PDB-4ani: Structural basis for the intermolecular communication between Dna...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4ani

タイトル

Structural basis for the intermolecular communication between DnaK and GrpE in the DnaK chaperone system from Geobacillus kaustophilus HTA426

要素

CHAPERONE PROTEIN DNAK
PROTEIN GRPE

キーワード

CHAPERONE / CHAPERONE CYCLE / COMPLEMENTARY ASSAY

機能・相同性

機能・相同性情報

adenyl-nucleotide exchange factor activity / ATP-dependent protein folding chaperone / unfolded protein binding / protein folding / protein-folding chaperone binding / protein homodimerization activity / ATP binding / cytoplasm
類似検索 - 分子機能

生物種

GEOBACILLUS KAUSTOPHILUS (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

多波長異常分散 / 解像度: 4.094 Å

データ登録者

Wu, C.-C. / Naveen, V. / Chien, C.-H. / Chang, Y.-W. / Hsiao, C.-D.

引用

ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2012
タイトル: Crystal Structure of Dnak Protein Complexed with Nucleotide Exchange Factor Grpe in Dnak Chaperone System: Insight Into Intermolecular Communication.
著者: Wu, C.-C. / Naveen, V. / Chien, C.-H. / Chang, Y.-W. / Hsiao, C.-D.

履歴

登録	2012年3月19日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2012年5月23日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2012年8月1日	Group: Database references
改定 1.2	2024年5月8日	Group: Data collection / Database references / Other カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_sf

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4ani.cif.gz	986.8 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4ani.ent.gz	829.3 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4ani.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	4ani_validation.pdf.gz	511.9 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	4ani_full_validation.pdf.gz	784.2 KB	表示
XML形式データ	4ani_validation.xml.gz	125.6 KB	表示
CIF形式データ	4ani_validation.cif.gz	165.6 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/an/4ani ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/an/4ani	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	2v7y
類似構造データ	23582 6pa7-d 5b66-d 6dhf-d 6jlo-d 5ws5-d 8706 6jln-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#32 - 2002年8月シャペロン (Chaperones) 類似性 (15)

登録構造単位

A: PROTEIN GRPE

B: PROTEIN GRPE

C: CHAPERONE PROTEIN DNAK

D: CHAPERONE PROTEIN DNAK

E: PROTEIN GRPE

F: PROTEIN GRPE

G: CHAPERONE PROTEIN DNAK

H: CHAPERONE PROTEIN DNAK

317 kDa, 8 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	279.975, 279.975, 278.820
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	98
Space group name H-M	I4₁22

#1: タンパク質	PROTEIN GRPE / GKGRPE / HSP-70 COFACTOR 分子量: 24071.840 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) GEOBACILLUS KAUSTOPHILUS (バクテリア) 株: HTA426 / 発現宿主: ESCHERICHIA COLI (大腸菌) / 参照: UniProt: Q5KWZ6
#2: タンパク質	CHAPERONE PROTEIN DNAK / GKGRPE / HSP70 / HEAT SHOCK 70 KDA PROTEIN / HEAT SHOCK PROTEIN 70 分子量: 55125.156 Da / 分子数: 4 / Fragment: RESIDUES 1-509 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) GEOBACILLUS KAUSTOPHILUS (バクテリア) 株: HTA426 / 発現宿主: ESCHERICHIA COLI (大腸菌) / 参照: UniProt: Q5KWZ7

-
実験

実験	手法: X線回折

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 4.31 Å³/Da / 溶媒含有率: 71 % / 解説: NONE

-
データ収集

回折

平均測定温度: 273 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

NSRRC

/ ビームライン: BL13B1 / 波長: 1.02249, 1.03964

検出器

タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD

放射

プロトコル: MAD / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

ID	波長 (Å)	相対比
1	1.02249	1
2	1.03964	1

反射

解像度: 4.09→26.22 Å / Num. obs: 41248 / % possible obs: 94.8 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 8.5 % / B_iso Wilson estimate: 143.41 Å² / R_merge(I) obs: 0.09 / Net I/σ(I): 32.3

反射シェル

解像度: 4.1→4.35 Å / 冗長度: 8.7 % / R_merge(I) obs: 0.49 / Mean I/σ(I) obs: 2.8 / % possible all: 94.5

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	(PHENIX.REFINE: 1.7_650)	精密化
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング
PHENIX		位相決定

精密化

構造決定の手法:

多波長異常分散
開始モデル: NONE

解像度: 4.094→26.221 Å / SU ML: 0.73 / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 35.08 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.3474	2083	5.1 %
R_work	0.2737	-	-
obs	0.2773	41248	94.78 %

溶媒の処理

減衰半径: 1.17 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / B_sol: 152.677 Å² / k_sol: 0.286 e/Å³

原子変位パラメータ

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-14.9513 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	-14.9513 Å²	0 Å²
3-	-	-	29.9025 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 4.094→26.221 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	18889	0	0	0	18889

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.022	19872
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.84	25867
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	20.859	6944
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.118	3038
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.008	3464

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
4.0943-4.1892	0.4585	139	0.352	2545	X-RAY DIFFRACTION	94
4.1892-4.2935	0.3854	143	0.3403	2588	X-RAY DIFFRACTION	95
4.2935-4.4091	0.3652	134	0.319	2616	X-RAY DIFFRACTION	96
4.4091-4.5382	0.3615	148	0.3016	2595	X-RAY DIFFRACTION	96
4.5382-4.6838	0.331	156	0.2697	2581	X-RAY DIFFRACTION	96
4.6838-4.8502	0.328	139	0.2644	2613	X-RAY DIFFRACTION	96
4.8502-5.0431	0.3199	133	0.2354	2622	X-RAY DIFFRACTION	95
5.0431-5.2709	0.338	136	0.2505	2621	X-RAY DIFFRACTION	95
5.2709-5.5463	0.3704	127	0.2855	2594	X-RAY DIFFRACTION	95
5.5463-5.8901	0.4181	136	0.3342	2617	X-RAY DIFFRACTION	95
5.8901-6.3389	0.4505	129	0.3318	2628	X-RAY DIFFRACTION	95
6.3389-6.966	0.3844	149	0.3362	2601	X-RAY DIFFRACTION	95
6.966-7.9493	0.3401	149	0.2583	2615	X-RAY DIFFRACTION	94
7.9493-9.9242	0.3102	130	0.2101	2623	X-RAY DIFFRACTION	93
9.9242-26.2216	0.2976	135	0.253	2706	X-RAY DIFFRACTION	92

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.5745	-0.2557	0.3169	0.2924	0.5727	0.6481	-1.0358	-1.4455	-0.1733	-0.5493	0.6489	-0.3395	1.0893	-1.0616	0	1.6327	0.1494	0.2083	1.7971	0.3782	2.1265	118.1024	14.9909	37.0856
2	3.6553	1.4076	1.5263	2.9498	-1.0609	2.2317	0.2727	0.9533	0.1142	-0.0452	0.0781	1.2502	0.8671	-1.2601	0	1.5991	-0.1485	-0.0732	2.06	0.3858	1.4256	80.8674	42.7172	18.0552
3	-0.8109	1.2748	-0.4195	2.4743	-1.9557	2.1703	-0.7307	0.0534	0.5039	0.6147	-0.1985	-0.9643	-0.1751	0.4803	0	1.6044	0.1803	0.0259	1.5718	-0.0626	0.9886	111.5213	36.5687	31.6358
4	2.712	0.5839	0.5252	1.1506	1.9262	0.6421	-0.0937	-0.5734	1.155	0.6367	0.501	0.0715	-0.7406	-0.168	0	1.8707	0.1528	0.1942	1.4828	0.2484	1.4809	100.3274	68.0066	24.5381
5	5.3247	-1.7589	-0.0643	4.6562	-2.6276	5.2319	0.3127	0.313	-0.0749	-0.3174	0.0851	1.2417	1.2307	-0.7187	0	1.7289	-0.0772	0.101	1.523	0.3092	1.1932	88.8044	17.5236	36.8531
6	6.3112	-1.9772	-1.2717	2.8261	-0.4007	2.056	-0.1828	0.0064	0.3007	0.1752	0.1376	-0.4071	0.0356	-0.0477	0	1.5413	0.0071	0.4115	1.4487	0.0349	1.3859	86.6067	37.2918	50.3629
7	5.4736	2.0491	-0.8315	2.9211	0.192	1.6033	0.1887	-0.7236	0.5837	0.9287	0.1325	-0.6458	-0.4415	0.4301	0	1.4688	0.2799	-0.02	1.4845	-0.1388	1.37	135.153	39.8742	35.9684
8	5.1344	-1.7891	-2.4097	1.5266	-1.887	6.7688	0.0145	-0.2444	1.0692	0.7597	-0.1067	1.0691	-0.1327	0.8806	0	1.5436	-0.0715	0.1262	1.5596	0.153	1.0566	123.4631	68.5923	7.7478
9	3.9233	1.468	-2.4867	2.8559	-0.2961	3.547	0.59	1.1753	0.8232	-0.3204	-0.2253	-0.0473	0.7392	0.5067	0	1.899	0.1138	-0.2391	1.5952	0.1452	1.3094	128.0927	62.198	-8.1802
10	1.0862	-2.2058	-1.2271	4.1511	-0.4474	4.659	0.2779	-0.355	-0.126	-0.7154	0.4662	0.7837	0.0472	-0.055	0	1.6803	-0.246	-0.3331	1.5445	0.3122	1.6503	100.545	65.5348	-6.3603
11	-1.4838	-1.0535	1.0659	1.4126	0.0485	0.6575	-0.3566	0.4621	-1.1815	-0.7887	0.2743	0.4176	0.0454	0.5145	0	2.2241	-0.0795	0.1807	1.7204	0.3879	1.8026	127.3256	49.2766	-7.3735
12	0.3872	0.231	0.4257	0.2841	0.2707	1.6884	-0.8538	0.2949	0.2355	-0.2794	-0.1028	-2.3488	0.0986	-0.2771	0	1.4522	-0.0339	0.2672	1.3259	-0.0961	2.2046	154.7627	19.9799	16.2265
13	0.2996	0.4387	0.3432	0.6636	2.4678	0.6334	0.2098	-0.5726	0.2379	0.1737	0.8271	-0.5031	2.2248	0.9341	0	1.8018	0.5518	-0.3279	1.6391	-0.0877	2.6263	160.5062	11.1708	23.3304
14	2.4	-0.0231	1.4043	3.8303	-0.5585	0.9067	-0.4074	0.2222	0.2324	-0.1344	-0.0367	-0.4489	1.2351	0.8287	0	1.904	0.1818	0.2888	1.6615	-0.5625	2.4414	158.7271	16.3806	14.975
15	1.9318	-1.3021	-1.6675	1.0487	-0.0658	0.9101	0.5315	1.3576	0.9132	-0.1845	0.6779	-0.9206	0.8416	1.3395	0	2.3242	0.4437	0.3835	1.699	-0.0118	3.5811	162.1991	2.1205	-11.2905
16	-0.0178	0.0629	-0.0026	-0.0003	0.0372	-0.0477	-1.6925	0.3743	0.2236	-1.0236	-2.7461	1.0594	0.5739	0.1635	0	1.9837	0.3751	0.2342	3.0916	-0.5413	2.371	192.3919	21.5423	5.7937
17	-0.0326	0.1907	0.3801	-0.0899	-0.276	-0.0316	0.0699	-1.0833	0.3618	0.3354	-1.0816	1.3764	-0.9176	0.166	0	2.7266	-0.2125	-0.3886	2.7827	-0.9323	3.9514	214.6928	27.5467	10.4715
18	-0.0472	-0.1679	-0.055	0.0088	-0.109	0.5107	-1.2617	1.2616	2.1437	0.5009	-1.4719	-1.1351	2.1268	-0.9396	0	1.5353	1.0415	0.9684	2.5444	-0.3698	4.699	201.864	22.6707	14.9754
19	-0.0178	-0.0485	0.1036	0.0002	0.0734	0.066	0.2355	1.169	-0.4049	0.0842	0.2262	-0.0201	0.7	-0.004	0.0001	5.5662	2.0016	-2.4921	2.6177	-1.6539	5.3271	207.4294	2.9926	8.0831
20	0.0631	0.1971	0.0469	0.1057	0.0079	0.0733	0.4084	-0.9254	0.7833	1.7661	-0.1351	0.6955	-3.014	0.6433	0	2.8506	0.767	-1.1092	2.1381	-1.4752	9.8905	204.9894	10.3525	11.9668
21	-0.0696	-0.1718	0.2453	-0.0859	0.131	-0.1912	-1.0774	0.9761	0.5257	-0.9671	-0.345	-0.4581	-1.6581	0.8936	0.0001	0.3001	2.8305	-0.7572	4.2199	-2.2	6.2774	207.6929	7.4518	7.8145
22	0.6746	-0.3607	-1.7519	0.2804	-0.2513	0.6826	-0.4766	-1.2288	0.4004	0.0135	0.3219	0.3917	0.0092	0.0493	0	2.5251	0.3075	0.5981	2.0498	0.0263	2.5801	162.0148	12.3968	-11.977
23	0.0176	0.2663	0.4615	0.6257	0.4819	-0.126	-0.7006	1.0707	0.4811	-2.7134	0.3308	0.5596	2.0696	-1.1165	0	1.6988	-0.182	0.6026	3.5539	0.8001	4.402	205.0512	32.0678	4.5062
24	-0.1401	0.2339	0.0435	0.0979	0.2388	-0.1921	1.1024	0.7265	-0.4724	-0.4417	-2.3199	-2.9288	0.4969	-0.0954	0	2.329	-0.0398	0.0518	2.5804	-0.3239	3.2618	198.289	47.6267	2.3471
25	-0.0267	-1.3639	-1.9758	-0.5967	0.5892	2.0543	1.54	-0.5504	-0.7131	1.4844	2.6017	-3.5212	1.1586	2.4842	0	2.385	0.5441	-0.5172	2.9866	-1.9787	6.881	194.0952	-5.488	-3.4175
26	1.177	-2.8837	1.5437	3.8779	0.1116	1.2473	0.383	1.6875	-2.0064	0.2033	0.7067	-2.6339	0.5306	0.9843	0	2.7673	-0.0467	1.297	2.6842	-0.7282	4.4809	200.5586	5.3548	-16.9548
27	-1.0706	0.1958	-1.2265	-2.1766	0.6163	-1.2789	0.0553	0.4333	0.058	-0.2982	0.298	-1.0286	-0.507	0.3645	0	3.5351	-0.1391	1.5596	3.0067	-0.3563	3.6911	192.7778	9.4326	-26.2631
28	4.4282	-0.2616	0.4917	1.1573	-2.2977	5.4311	-0.1884	0.6213	0.5795	-2.0144	0.3362	-1.3106	-0.7266	0.7468	0	2.6081	-0.0479	1.0417	1.7062	0.2001	2.4923	156.1133	37.5407	-9.4871
29	0.8945	-1.0411	-1.4693	3.7651	0.7615	8.0744	0.4128	0.271	0.2147	0.0078	0.6378	-3.4616	-0.6335	0.0133	0	1.8451	0.0479	0.4476	2.019	-0.308	3.9356	176.2825	56.7612	21.8912
30	0.0235	0.692	0.7499	3.7413	2.5942	1.8795	1.104	-0.0181	-0.1268	-0.3135	5.5664	-15.4837	-0.6162	2.7703	0	2.472	-0.2167	0.3967	4.1545	-6.2477	22.0111	198.9585	50.1101	31.9625
31	6.3088	1.6662	2.8277	4.6264	1.7	4.2259	0.1528	-0.0496	-0.2155	0.0986	0.1561	-0.7724	0.2494	-0.3112	0	1.5165	0.1357	0.1105	1.063	0.3152	1.6361	140.7377	27.9147	15.0888

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	CHAIN A AND (RESSEQ 58:106)
2	X-RAY DIFFRACTION	2	CHAIN A AND (RESSEQ 107:213)
3	X-RAY DIFFRACTION	3	CHAIN B AND (RESSEQ 60:135)
4	X-RAY DIFFRACTION	4	CHAIN B AND (RESSEQ 136:213)
5	X-RAY DIFFRACTION	5	CHAIN C AND (RESSEQ 1:134)
6	X-RAY DIFFRACTION	6	CHAIN C AND (RESSEQ 135:338)
7	X-RAY DIFFRACTION	7	CHAIN C AND (RESSEQ 339:509)
8	X-RAY DIFFRACTION	8	CHAIN D AND (RESSEQ 1:105)
9	X-RAY DIFFRACTION	9	CHAIN D AND (RESSEQ 106:181)
10	X-RAY DIFFRACTION	10	CHAIN D AND (RESSEQ 182:315)
11	X-RAY DIFFRACTION	11	CHAIN D AND (RESSEQ 316:367)
12	X-RAY DIFFRACTION	12	CHAIN D AND (RESSEQ 368:395)
13	X-RAY DIFFRACTION	13	CHAIN D AND (RESSEQ 396:440)
14	X-RAY DIFFRACTION	14	CHAIN D AND (RESSEQ 441:509)
15	X-RAY DIFFRACTION	15	CHAIN E AND (RESSEQ 58:102)
16	X-RAY DIFFRACTION	16	CHAIN E AND (RESSEQ 103:113)
17	X-RAY DIFFRACTION	17	CHAIN E AND (RESSEQ 114:144)
18	X-RAY DIFFRACTION	18	CHAIN E AND (RESSEQ 145:168)
19	X-RAY DIFFRACTION	19	CHAIN E AND (RESSEQ 169:186)
20	X-RAY DIFFRACTION	20	CHAIN E AND (RESSEQ 187:202)
21	X-RAY DIFFRACTION	21	CHAIN E AND (RESSEQ 203:213)
22	X-RAY DIFFRACTION	22	CHAIN F AND (RESSEQ 60:105)
23	X-RAY DIFFRACTION	23	CHAIN F AND (RESSEQ 106:158)
24	X-RAY DIFFRACTION	24	CHAIN F AND (RESSEQ 159:210)
25	X-RAY DIFFRACTION	25	CHAIN G AND (RESSEQ 1:105)
26	X-RAY DIFFRACTION	26	CHAIN G AND (RESSEQ 106:271)
27	X-RAY DIFFRACTION	27	CHAIN G AND (RESSEQ 272:367)
28	X-RAY DIFFRACTION	28	CHAIN G AND (RESSEQ 368:509)
29	X-RAY DIFFRACTION	29	CHAIN H AND (RESSEQ 1:181)
30	X-RAY DIFFRACTION	30	CHAIN H AND (RESSEQ 182:302)
31	X-RAY DIFFRACTION	31	CHAIN H AND (RESSEQ 303:509)

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)