THE PDB FILE IS NUMBERED AFTER PDB-ENTRY 2EWY WHICH HAS NUMBERS 62 LESS THAN THE DATA BANK SEQUENCE. ...THE PDB FILE IS NUMBERED AFTER PDB-ENTRY 2EWY WHICH HAS NUMBERS 62 LESS THAN THE DATA BANK SEQUENCE. THE MUTATION HERE IS E269A IN THE PDB FILE AND E331A IN THE DATA BANK SEQUENCE. ANTIBODY RAISED IN LLAMA AGAINST BACE2. V(HH) EXPRESSED IN E. COLI. WITH 6HIS AND EPEA TAG.
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.98→46.26 Å / Num. obs: 67998 / % possible obs: 98.5 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 3 % / Rmerge(I) obs: 0.1 / Net I/σ(I): 7.2
反射 シェル
解像度: 1.98→2.09 Å / 冗長度: 3 % / Rmerge(I) obs: 0.88 / Mean I/σ(I) obs: 1.2 / % possible all: 98.4
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.7.0029
精密化
XDS
データ削減
SCALA
データスケーリング
REFMAC
位相決定
精密化
構造決定の手法: OTHER 開始モデル: NONE 解像度: 2.1→46.26 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.919 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.874 / SU B: 15.407 / SU ML: 0.199 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.343 / ESU R Free: 0.261 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS.
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.29601
2596
5.1 %
RANDOM
Rwork
0.23825
-
-
-
obs
0.24123
48660
88.56 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK