- PDB-3wvu: Crystal Structure of RuCO/apo-R52CFr -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 3wvu
タイトル
Crystal Structure of RuCO/apo-R52CFr
要素
Ferritin light chain
キーワード
METAL BINDING PROTEIN / Protein Structure Initiative
機能・相同性
機能・相同性情報
: / intracellular sequestering of iron ion / ferric iron binding / ferrous iron binding / iron ion transport / iron ion binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能
モノクロメーター: CONFOCAL MIRRORS / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1.5418 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.92→50 Å / Num. obs: 19140 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 20.4 % / Biso Wilson estimate: 12.8 Å2 / Net I/σ(I): 48.6
反射 シェル
解像度: 1.92→1.97 Å / % possible all: 100
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解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
CrystalClear
データ収集
MOLREP
位相決定
REFMAC
5.7.0032
精密化
HKL-2000
データスケーリング
精密化
構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 1.92→30.26 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.952 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.937 / SU B: 1.901 / SU ML: 0.057 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.109 / ESU R Free: 0.108 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.19272
1027
5.1 %
RANDOM
Rwork
0.15812
-
-
-
obs
0.15985
19140
99.93 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK