登録情報 | データベース: PDB / ID: 3wrg |
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タイトル | The complex structure of HypBA1 with L-arabinose |
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要素 | Non-reducing end beta-L-arabinofuranosidase |
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キーワード | HYDROLASE / glycoside hydrolase / arabinofuranose / beta-L-arabinofuranosidase / one (a11/a6)-barrel fold / two b-jellyroll folds |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
non-reducing end beta-L-arabinofuranosidase / beta-L-arabinofuranosidase activity / polysaccharide catabolic process / metal ion binding類似検索 - 分子機能 : / : / Glycoside hydrolase family 127 C-terminal domain / : / Beta-L-arabinofuranosidase, GH127 middle domain / Beta-L-arabinofuranosidase, GH127 / Beta-L-arabinofuranosidase, GH127 catalytic domain / Six-hairpin glycosidase-like superfamily / Six-hairpin glycosidase superfamily類似検索 - ドメイン・相同性 beta-L-arabinofuranose / Non-reducing end beta-L-arabinofuranosidase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Bifidobacterium longum (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.23 Å |
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データ登録者 | Huang, C.H. / Zhu, Z. / Cheng, Y.S. / Chan, H.C. / Ko, T.P. / Chen, C.C. / Wang, I. / Ho, M.R. / Hsu, S.T. / Zeng, Y.F. ...Huang, C.H. / Zhu, Z. / Cheng, Y.S. / Chan, H.C. / Ko, T.P. / Chen, C.C. / Wang, I. / Ho, M.R. / Hsu, S.T. / Zeng, Y.F. / Huang, Y.N. / Liu, J.R. / Guo, R.T. |
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引用 | ジャーナル: J BIOPROCESS BIOTECH / 年: 2014 タイトル: Structure and Catalytic Mechanism of a Glycoside Hydrolase Family-127 beta-L-Arabinofuranosidase (HypBA1) 著者: Huang, C.H. / Zhu, Z. / Cheng, Y.S. / Chan, H.C. / Ko, T.P. / Chen, C.C. / Wang, I. / Ho, M.R. / Hsu, S.T. / Zeng, Y.F. / Huang, Y.N. / Liu, J.R. / Guo, R.T. |
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履歴 | 登録 | 2014年2月25日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2014年9月3日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 2.0 | 2020年7月29日 | Group: Atomic model / Data collection / Derived calculations カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id ..._atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id / _chem_comp.type / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation |
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改定 2.1 | 2024年3月20日 | Group: Data collection / Database references / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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