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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3v7f | ||||||
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タイトル | Crystal Structure of Streptococcus pyogenes Csn2 | ||||||
![]() | Putative uncharacterized protein | ||||||
![]() | DNA BINDING PROTEIN / Calcium Binding | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Bae, E. / Jung, D.K. / Koo, Y. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of Streptococcus pyogenes Csn2 reveals calcium-dependent conformational changes in its tertiary and quaternary structure 著者: Koo, Y. / Jung, D.K. / Bae, E. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 98.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 76.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 26001.064 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 株: serotype M1 / 遺伝子: csn2, M5005_Spy0772, SPy_1049 / プラスミド: pHMGWA / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.45 Å3/Da / 溶媒含有率: 64.32 % |
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結晶化 | 温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7 詳細: 2.8M sodium acetate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 210 / 検出器: CCD / 日付: 2010年12月7日 |
放射 | モノクロメーター: DCM Si (111) Crystal / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.9→49.68 Å / Num. all: 16061 / Num. obs: 16061 / % possible obs: 98.4 % |
反射 シェル | 解像度: 2.9→3.06 Å / % possible all: 97.8 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 65.144 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.9→49.68 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 2.9→2.975 Å / Total num. of bins used: 20
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