PDB-3t5m: Crystal structure of the S112A mutant of mycrocine immunity prote...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3t5m

タイトル

Crystal structure of the S112A mutant of mycrocine immunity protein (MccF) with AMP

要素

Microcin immunity protein MccF

キーワード

IMMUNE SYSTEM / MccF / AMP / CSGID / Structural Genomics / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases

機能・相同性

機能・相同性情報

hydrolase activity / nucleotide binding
類似検索 - 分子機能

生物種

Bacillus anthracis (炭疽菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.749 Å

データ登録者

Nocek, B. / Zhou, M. / Gu, M. / Anderson, W.F. / Joachimiak, A. / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases (CSGID)

引用

ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2012
タイトル: Structural and Functional Characterization of Microcin C Resistance Peptidase MccF from Bacillus anthracis.
著者: Nocek, B. / Tikhonov, A. / Babnigg, G. / Gu, M. / Zhou, M. / Makarova, K.S. / Vondenhoff, G. / Aerschot, A.V. / Kwon, K. / Anderson, W.F. / Severinov, K. / Joachimiak, A.

履歴

登録	2011年7月27日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2011年9月7日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2012年5月2日	Group: Database references
改定 1.2	2012年7月25日	Group: Database references
改定 1.3	2024年2月28日	Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	3t5m.cif.gz	288.7 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb3t5m.ent.gz	233.6 KB	表示	PDB形式
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その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	3t5m_validation.pdf.gz	1018.4 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	3t5m_full_validation.pdf.gz	1 MB	表示
XML形式データ	3t5m_validation.xml.gz	32.1 KB	表示
CIF形式データ	3t5m_validation.cif.gz	48 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/t5/3t5m ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/t5/3t5m	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	3gjzC 3sr3C 3tyxC 3u1bC C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	3u1b-d 3tyx-d 4mi1-d 1of8-d 3tlc-d 4iiy-d 3tle-d 3tla-d 5k99-d 3tlg-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索
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リンク

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PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#215 - 2017年11月
アスパラギン酸カルバモイル転移酵素 (Aspartate Transcarbamoylase)
類似性 (1)
#129 - 2010年9月
イソクエン酸脱水素酵素 (Isocitrate Dehydrogenase)
類似性 (1)
#154 - 2012年10月
クエン酸回路 (Citric Acid Cycle)
類似性 (1)
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グリコーゲンホスホリラーゼ (Glycogen Phosphorylase)
類似性 (1)
#55 - 2004年7月
DNAリガーゼ (DNA Ligase)
類似性 (1)
#57 - 2004年9月
カタラーゼ (Catalase)
類似性 (1)
#16 - 2001年4月
アミノアシル転移RNA合成酵素 (Aminoacyl-tRNA Synthetases)
類似性 (1)

登録構造単位

A: Microcin immunity protein MccF

B: Microcin immunity protein MccF

ヘテロ分子

76.8 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	118.389, 118.389, 55.764
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	78
Space group name H-M	P4₃

#1: タンパク質	Microcin immunity protein MccF 分子量: 38007.293 Da / 分子数: 2 / 変異: S112A / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Bacillus anthracis (炭疽菌) / 株: Ames / 遺伝子: BAS1809, BA_1949, GBAA_1949 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): Bl21DE3 / 参照: UniProt: Q81RT8, UniProt: A0A6L8PEJ7*PLUS
#2: 化合物	ChemComp-AMP / ADENOSINE MONOPHOSPHATE / AMP 分子量: 347.221 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₄N₅O₇P / コメント: AMP*YM
#3: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 628 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.57 Å³/Da / 溶媒含有率: 52.15 %
結晶化	温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7.5 詳細: 0.2 M potassium chloride, 20% Peg 3350, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 19-ID / 波長: 0.9794 Å
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2011年3月24日 / 詳細: mirrors
放射	モノクロメーター: double crystal / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.9794 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.75→28.714 Å / Num. all: 77620 / Num. obs: 77550 / % possible obs: 99.3 % / Observed criterion σ(F): 2 / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 3.7 % / B_iso Wilson estimate: 39 Å² / R_merge(I) obs: 0.07 / Net I/σ(I): 23
反射シェル	解像度: 1.75→1.78 Å / R_merge(I) obs: 0.48 / Mean I/σ(I) obs: 3 / % possible all: 100

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
SBC-Collect		データ収集
MOLREP		位相決定
PHENIX	(phenix.refine: 1.7_650)	精密化
HKL-3000		データ削減
HKL-3000		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 1.749→28.714 Å / SU ML: 0.19 / σ(F): 2 / σ(I): 2 / 位相誤差: 23.3 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.202	3910	5.05 %	RANDOM
R_work	0.1852	-	-	-
all	0.189	80368	-	-
obs	0.1861	77458	99.08 %	-

溶媒の処理

減衰半径: 0.89 Å / VDWプローブ半径: 1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / B_sol: 41.279 Å² / k_sol: 0.405 e/Å³

原子変位パラメータ

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-5.9601 Å²	-0 Å²	0 Å²
2-	-	-5.9601 Å²	-0 Å²
3-	-	-	11.9202 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.749→28.714 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	5265	0	52	628	5945

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.004	5477
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.975	7458
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	13.035	2015
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.051	817
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.004	952

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
1.7494-1.7707	0.3125	139	0.2907	2482	X-RAY DIFFRACTION	97
1.7707-1.7931	0.2891	146	0.2673	2667	X-RAY DIFFRACTION	100
1.7931-1.8167	0.2813	143	0.2683	2599	X-RAY DIFFRACTION	100
1.8167-1.8416	0.3116	146	0.2517	2629	X-RAY DIFFRACTION	100
1.8416-1.8679	0.2553	141	0.249	2601	X-RAY DIFFRACTION	100
1.8679-1.8957	0.2641	131	0.2354	2640	X-RAY DIFFRACTION	100
1.8957-1.9254	0.238	152	0.2274	2628	X-RAY DIFFRACTION	100
1.9254-1.9569	0.284	138	0.2184	2622	X-RAY DIFFRACTION	100
1.9569-1.9907	0.2572	154	0.2269	2662	X-RAY DIFFRACTION	100
1.9907-2.0268	0.2518	131	0.2212	2591	X-RAY DIFFRACTION	100
2.0268-2.0658	0.2378	140	0.2246	2693	X-RAY DIFFRACTION	100
2.0658-2.108	0.2533	120	0.2161	2602	X-RAY DIFFRACTION	100
2.108-2.1538	0.2377	149	0.2038	2661	X-RAY DIFFRACTION	100
2.1538-2.2039	0.2188	115	0.2058	2670	X-RAY DIFFRACTION	100
2.2039-2.259	0.247	121	0.2068	2649	X-RAY DIFFRACTION	100
2.259-2.32	0.2258	149	0.2038	2651	X-RAY DIFFRACTION	100
2.32-2.3883	0.2352	137	0.1981	2634	X-RAY DIFFRACTION	100
2.3883-2.4653	0.2329	141	0.2006	2655	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4653-2.5534	0.1864	142	0.2064	2617	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5534-2.6555	0.2173	147	0.1946	2680	X-RAY DIFFRACTION	100
2.6555-2.7763	0.2113	143	0.1901	2617	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7763-2.9225	0.1986	120	0.198	2667	X-RAY DIFFRACTION	100
2.9225-3.1054	0.2248	167	0.1833	2639	X-RAY DIFFRACTION	100
3.1054-3.3449	0.1692	152	0.1713	2632	X-RAY DIFFRACTION	100
3.3449-3.6809	0.1706	152	0.161	2657	X-RAY DIFFRACTION	100
3.6809-4.2121	0.1528	140	0.1406	2661	X-RAY DIFFRACTION	99
4.2121-5.3013	0.1429	146	0.129	2656	X-RAY DIFFRACTION	99
5.3013-28.7174	0.2067	108	0.1978	2386	X-RAY DIFFRACTION	85

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.3032	-0.3016	0.3261	0.3413	-0.3205	0.3594	-0.0658	-0.026	-0.0226	-0.0274	-0.0834	0.0993	0.0155	-0.0463	0.1099	0.374	0.1462	0.0404	0.3301	0.0248	0.2464	46.8509	-8.1195	13.6422
2	0.0306	0.017	-0.0655	0.017	-0.0292	0.3681	-0.0705	0.0053	-0.096	-0.0005	-0.0365	0.1759	0.2907	-0.0389	0.0621	0.4427	-0.0634	0.1026	0.2514	-0.1205	0.4639	39.3364	-11.8568	-2.9015
3	0.1789	0.1974	0.1805	0.2024	0.1775	0.2255	-0.0103	-0.0101	0.0017	0.0272	0.114	0.2341	-0.002	-0.1651	0.0719	0.2133	-0.0631	-0.0606	0.2169	-0.1972	0.4604	30.7907	2.452	-10.6591
4	0.2198	0.2374	-0.0631	0.2581	-0.0697	0.0193	0.0379	0.0524	0.0136	-0.0514	0.0277	0.0989	0.0708	0.0097	0.0223	0.3648	-0.1036	-0.0018	0.3002	-0.2943	0.5493	33.8562	-8.3577	-9.2239
5	0.0601	0.0236	0.0644	0.0695	0.0343	0.0695	-0.0298	0.0122	0.1125	-0.0128	-0.0588	0.2342	-0.1765	-0.1437	0.0754	0.1396	-0.0895	-0.1538	0.2534	-0.2068	0.6993	20.5704	7.2824	-4.8292
6	0.267	0.103	-0.0498	0.0517	0.062	0.1307	0.1372	0.2471	-0.0198	-0.0119	-0.2124	0.4821	0.0823	-0.1177	0.0422	0.0843	-0.2094	0.112	0.0568	-0.1648	0.5517	28.1358	2.9766	3.9053
7	0.6359	0.2333	-0.8182	0.0959	-0.3827	1.7829	-0.0961	0.0167	-0.1092	0.1002	-0.0249	0.1686	0.2217	0.0455	0.1366	0.3882	-0.0437	0.1584	0.2345	-0.013	0.4121	33.3523	-5.2777	13.0538
8	0.0799	-0.1079	-0.0658	0.5423	0.3853	0.6276	-0.0699	0.0303	-0.1863	0.0841	-0.0729	0.2139	0.139	0.0034	0.0836	0.2391	-0.0319	0.0533	0.2055	-0.0695	0.2693	39.6903	2.7058	1.6074
9	0.2995	-0.006	-0.1203	0.2609	0.1956	0.1961	-0.0822	-0.025	-0.1235	-0.0988	-0.0365	-0.014	0.0077	-0.0296	0.0445	0.3363	-0.0062	0.0319	0.2316	-0.0831	0.2734	47.8067	-3.0747	-9.9652
10	0.3554	-0.0248	-0.0026	0.2027	0.0796	0.0413	-0.0585	0.0595	-0.0643	0.0156	0.0752	-0.0173	-0.0154	-0.0969	0.0352	0.3132	0.0317	0.0129	0.2147	-0.0304	0.1852	55.447	1.4193	-6.1838
11	0.2304	0.0006	0.1191	0.1081	-0.2311	0.5392	-0.1025	0.0972	-0.0156	-0.1565	-0.137	-0.0057	-0.0827	0.2877	-0.0058	0.3263	0.0335	-0.0703	0.2564	-0.1016	0.1626	44.328	11.4618	-19.2372
12	0.0206	-0.0171	0.0232	0.0615	-0.0353	0.3965	-0.0182	-0.0226	0.0251	0.122	-0.0336	0.0701	-0.0014	0.0754	-0.0078	0.2319	-0.004	0.0634	0.1668	-0.0352	0.1926	48.7443	11.9847	8.53
13	0.0346	-0.0099	-0.0633	0.2432	-0.1002	0.277	-0.0517	-0.0253	-0.0035	0.1332	-0.0739	0.0433	-0.0383	0.0587	0.0372	0.2014	0.0073	0.0402	0.1857	-0.0289	0.1557	47.828	19.0179	7.5039
14	-0.0147	-0.0087	-0.0084	0.0605	0.0786	0.0498	0.01	-0.0077	-0.0084	-0.0221	-0.0461	0.0106	-0.0125	0.1234	-0.0038	0.2047	0.0115	0.0279	0.1883	-0.028	0.1242	52.9221	18.3009	-0.0266
15	0.3073	-0.1137	0.0248	0.1761	0.369	1.0574	-0.0195	-0.0115	-0.0453	0.076	0.0224	0.0346	0.174	0.1508	0.0337	0.2932	0.02	0.0254	0.1884	-0.0042	0.1938	56.4533	1.0817	4.8281
16	0.036	0.0376	0.0326	0.1136	0.0942	0.0815	-0.0328	-0.0214	-0.0511	-0.006	-0.0185	0.0123	-0.0265	0.0595	0.0195	0.2402	0.0333	0.0115	0.2004	-0.0333	0.2406	35.5698	50.2509	24.9595
17	0.1364	-0.1046	0.0477	0.1224	-0.0191	0.2041	0.0013	-0.0545	-0.0616	-0.0305	-0.0519	0.0387	-0.1071	0.0254	0.0181	0.2444	0.0118	-0.0056	0.2012	-0.0264	0.1712	38.4375	50.4154	5.7509
18	0.0707	-0.1369	-0.0253	0.4288	0.327	0.3271	-0.0467	-0.0311	0.0112	0.0185	0.0233	-0.025	0.0642	0.0118	0.0095	0.198	0.0079	0.022	0.1791	-0.009	0.1414	47.5577	40.172	10.7583
19	0.5822	-0.2773	-0.3205	0.2091	0.2875	0.4177	-0.0524	-0.0666	0.0116	0.0822	0.047	-0.0053	0.0681	-0.0269	0.017	0.3801	0.0703	-0.0142	0.2643	-0.0185	0.1807	46.6831	41.5153	27.592
20	0.3965	-0.2203	0.1048	0.6752	-0.1212	1.1031	-0.1536	0.0416	0.0216	0.1976	-0.1206	0.1286	0.0058	0.1241	0.0578	0.2077	0.0122	0.0295	0.1831	-0.0389	0.167	35.8114	39.8526	15.622
21	0.2502	0.016	-0.1001	0.7434	-0.012	0.2882	-0.0722	-0.0026	-0.034	0.1139	-0.1539	0.2305	-0.0131	-0.1458	0.1151	0.2148	0.0401	-0.0033	0.2028	-0.0838	0.2302	24.1685	49.6057	15.4532
22	0.1019	0.0214	0.1305	0.3377	-0.3003	0.5796	0.0869	-0.1085	-0.0316	0.1373	0.0168	0.1305	0.0239	-0.0329	-0.0931	0.3731	0.0099	0.2133	0.3117	-0.1705	0.6649	16.899	42.5285	18.704
23	0.8112	-0.3525	-0.0975	0.648	0.394	0.4013	0.0048	0.0105	-0.149	-0.11	-0.2906	0.2649	-0.0091	-0.0057	0.0494	0.2166	0.0328	-0.0806	0.219	-0.1085	0.3798	20.9806	42.6351	-0.4312
24	0.0804	-0.0038	-0.0132	0.1149	0.0118	0.0505	-0.0608	0.0379	-0.0701	0.2876	-0.1067	0.3589	0.1165	0.0148	-0.0285	0.2452	-0.0148	0.1672	0.1955	-0.0668	0.3721	29.6309	26.5163	18.3055
25	0.041	0.0662	-0.0164	0.1082	-0.0208	0.0829	0.0066	-0.0609	-0.0321	0.0784	-0.0832	0.1538	0.053	-0.0509	0.0586	0.3345	-0.0054	0.281	0.2997	0.0799	0.3525	32.9594	23.3299	26.5762
26	0.3989	-0.145	-0.0073	0.1387	0.0731	0.0469	-0.1189	0.1094	0.0276	-0.0037	-0.2468	0.4236	-0.0117	-0.0985	-0.0803	0.1572	-0.0393	0.164	0.2233	-0.1046	0.4347	26.8859	23.3599	12.5712
27	0.0345	0.0693	-0.0771	0.0899	-0.1152	0.1233	0.0095	-0.0881	-0.0669	0.037	-0.1317	0.3595	0.0343	-0.142	0.0798	0.1942	-0.0116	0.0174	0.2579	-0.1534	0.6441	19.0769	22.1527	3.0044
28	1.2395	0.2365	-0.0297	0.1157	0.0017	0.0501	0.0695	0.0085	-0.0277	0.053	-0.1012	-0.0556	0.0432	-0.082	0.0365	0.2389	-0.1351	0.1771	0.2751	-0.1762	0.4798	18.5382	14.2862	16.5672
29	0.0077	0.0049	-0.026	0.052	0.0281	0.0137	-0.255	0.0428	-0.0537	0.2168	-0.3116	0.4067	-0.0615	0.0739	-0.0298	0.2224	0.027	0.2208	0.1988	-0.1919	0.5333	21.6472	34.3869	17.2236
30	0.0547	0.0142	-0.0105	0.0143	0.0084	0.0246	-0.1062	-0.0441	-0.0743	0.2115	-0.0917	0.0351	-0.0787	0.1235	0.0219	0.2098	0.1688	0.4812	0.1579	-0.1229	0.2595	23.4803	39.7718	26.6583

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	(chain A and resid -1:4)
2	X-RAY DIFFRACTION	2	(chain A and resid 5:14)
3	X-RAY DIFFRACTION	3	(chain A and resid 15:38)
4	X-RAY DIFFRACTION	4	(chain A and resid 39:47)
5	X-RAY DIFFRACTION	5	(chain A and resid 48:55)
6	X-RAY DIFFRACTION	6	(chain A and resid 56:95)
7	X-RAY DIFFRACTION	7	(chain A and resid 96:105)
8	X-RAY DIFFRACTION	8	(chain A and resid 106:142)
9	X-RAY DIFFRACTION	9	(chain A and resid 143:159)
10	X-RAY DIFFRACTION	10	(chain A and resid 160:175)
11	X-RAY DIFFRACTION	11	(chain A and resid 176:193)
12	X-RAY DIFFRACTION	12	(chain A and resid 194:225)
13	X-RAY DIFFRACTION	13	(chain A and resid 226:257)
14	X-RAY DIFFRACTION	14	(chain A and resid 258:309)
15	X-RAY DIFFRACTION	15	(chain A and resid 310:333)
16	X-RAY DIFFRACTION	16	(chain B and resid 1:12)
17	X-RAY DIFFRACTION	17	(chain B and resid 13:46)
18	X-RAY DIFFRACTION	18	(chain B and resid 47:98)
19	X-RAY DIFFRACTION	19	(chain B and resid 99:104)
20	X-RAY DIFFRACTION	20	(chain B and resid 105:142)
21	X-RAY DIFFRACTION	21	(chain B and resid 143:162)
22	X-RAY DIFFRACTION	22	(chain B and resid 163:172)
23	X-RAY DIFFRACTION	23	(chain B and resid 173:194)
24	X-RAY DIFFRACTION	24	(chain B and resid 195:223)
25	X-RAY DIFFRACTION	25	(chain B and resid 224:229)
26	X-RAY DIFFRACTION	26	(chain B and resid 230:269)
27	X-RAY DIFFRACTION	27	(chain B and resid 270:286)
28	X-RAY DIFFRACTION	28	(chain B and resid 287:292)
29	X-RAY DIFFRACTION	29	(chain B and resid 293:322)
30	X-RAY DIFFRACTION	30	(chain B and resid 323:333)

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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