PDB-3ria: C. elegans glutamate-gated chloride channel (GluCl) in complex wi...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3ria

タイトル

C. elegans glutamate-gated chloride channel (GluCl) in complex with Fab, ivermectin and iodide.

要素

(Mouse monoclonal Fab fragment, ...) x 2
Avermectin-sensitive glutamate-gated chloride channel GluCl alpha

キーワード

TRANSPORT PROTEIN/IMMUNE SYSTEM / Membrane protein / transport protein / Cys-loop receptor / ligand-gated ion channel / neurotransmitter receptor / Ivermectin / Picrotoxin / Glycosylation / TRANSPORT PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex

機能・相同性

機能・相同性情報

Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane domain / Acetylcholine Binding Protein; Chain: A, / Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding domain / Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 / Distorted Sandwich / Immunoglobulins / Up-down Bundle / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta / Mainly Alpha
類似検索 - ドメイン・相同性

生物種

Caenorhabditis elegans (センチュウ)

Mus musculus (ハツカネズミ)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 3.8 Å

データ登録者

Hibbs, R.E. / Gouaux, E.

引用

ジャーナル: Nature / 年: 2011
タイトル: Principles of activation and permeation in an anion-selective Cys-loop receptor.
著者: Hibbs, R.E. / Gouaux, E.

履歴

登録	2011年4月13日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2011年5月25日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年7月13日	Group: Version format compliance
改定 1.2	2011年10月19日	Group: Database references
改定 1.3	2017年8月23日	Group: Refinement description / Source and taxonomy / カテゴリ: entity_src_gen / software
改定 1.4	2023年9月13日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / entity / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_initial_refinement_model / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _chem_comp.name / _database_2.pdbx_DOI ..._chem_comp.name / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.name / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
改定 1.5	2024年11月27日	Group: Structure summary カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

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その他	その他のダウンロード

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検証レポート

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文書・詳細版	3ria_full_validation.pdf.gz	2.7 MB	表示
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CIF形式データ	3ria_validation.cif.gz	179.2 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ri/3ria ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ri/3ria	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	3rhwSC 3ri5C 3rifC S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	3rhw-d 3ri5-d 3rif-d 4tnw-1 4tnw-2 4tnv-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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「今月の分子」の関連する項目	#191 - 2015年11月グルタミン酸開閉型塩化物イオン受容体 (Glutamate-gated Chloride Receptors) 類似性 (4) #21 - 2001年9月抗体 (Antibodies) 類似性 (1) #256 - 2021年4月 SARSコロナウイルス2型のスパイクと抗体 (SARS-CoV-2 Spike and Antibodies) 類似性 (1) #152 - 2012年8月環状AMP依存性タンパク質リン酸化酵素 (cAMP-dependent Protein Kinase) 類似性 (1)

PDBのページ

PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#191 - 2015年11月
グルタミン酸開閉型塩化物イオン受容体 (Glutamate-gated Chloride Receptors)
類似性 (4)
#21 - 2001年9月
抗体 (Antibodies)
類似性 (1)
#256 - 2021年4月
SARSコロナウイルス2型のスパイクと抗体 (SARS-CoV-2 Spike and Antibodies)
類似性 (1)
#152 - 2012年8月
環状AMP依存性タンパク質リン酸化酵素 (cAMP-dependent Protein Kinase)
類似性 (1)

登録構造単位

A: Avermectin-sensitive glutamate-gated chloride channel GluCl alpha

B: Avermectin-sensitive glutamate-gated chloride channel GluCl alpha

C: Avermectin-sensitive glutamate-gated chloride channel GluCl alpha

D: Avermectin-sensitive glutamate-gated chloride channel GluCl alpha

E: Avermectin-sensitive glutamate-gated chloride channel GluCl alpha

F: Mouse monoclonal Fab fragment, heavy chain

G: Mouse monoclonal Fab fragment, heavy chain

H: Mouse monoclonal Fab fragment, heavy chain

I: Mouse monoclonal Fab fragment, heavy chain

J: Mouse monoclonal Fab fragment, heavy chain

K: Mouse monoclonal Fab fragment, light chain

L: Mouse monoclonal Fab fragment, light chain

M: Mouse monoclonal Fab fragment, light chain

N: Mouse monoclonal Fab fragment, light chain

O: Mouse monoclonal Fab fragment, light chain

ヘテロ分子

438 kDa, 15 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	155.099, 155.099, 578.257
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	96
Space group name H-M	P4₃2₁2

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:
NCSドメイン領域:

Dom-ID	Component-ID	Ens-ID	Selection details
1	1	1	chain A and (resseq 1:340 ) and (not element H)
2	1	1	chain B and (resseq 1:340 ) and (not element H)
3	1	1	chain C and (resseq 1:339 ) and (not element H)
4	1	1	chain D and (resseq 1:340 ) and (not element H)
5	1	1	chain E and (resseq 1:340 ) and (not element H)
1	1	2	chain F and (resseq 1:120 ) and (not element H)
2	1	2	chain G and (resseq 1:120 ) and (not element H)
3	1	2	chain H and (resseq 1:120 ) and (not element H)
4	1	2	chain I and (resseq 1:120 ) and (not element H)
5	1	2	chain J and (resseq 1:120 ) and (not element H)
1	1	3	chain K and (resseq 1:108 ) and (not element H)
2	1	3	chain L and (resseq 1:108 ) and (not element H)
3	1	3	chain M and (resseq 1:108 ) and (not element H)
4	1	3	chain N and (resseq 1:108 ) and (not element H)
5	1	3	chain O and (resseq 1:108 ) and (not element H)
1	1	4	A348
2	1	4	C349
3	1	4	C350
4	1	4	E348
5	1	4	E349

NCSアンサンブル:

ID
1
2
3
4

-
抗体 , 2種, 10分子 FGHIJKLMNO

#2: 抗体	Mouse monoclonal Fab fragment, heavy chain 分子量: 23921.744 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Mus musculus (ハツカネズミ) / Cell: HYBRIDOMA
#3: 抗体	Mouse monoclonal Fab fragment, light chain 分子量: 22618.156 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Mus musculus (ハツカネズミ) / Cell: HYBRIDOMA

-
タンパク質 / 糖 , 2種, 8分子 ABCDE

#1: タンパク質	Avermectin-sensitive glutamate-gated chloride channel GluCl alpha 分子量: 39636.629 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Caenorhabditis elegans (センチュウ) 遺伝子: glc-1, F11A5.10 発現宿主: Spodoptera frugiperda (ツマジロクサヨトウ) 参照: UniProt: O17793
#5: 糖	ChemComp-LMT / DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE / ドデシルβ-D-マルトシドタイプ: D-saccharide / 分子量: 510.615 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₄H₄₆O₁₁ / コメント: 可溶化剤*YM

-
非ポリマー , 5種, 14分子

#4: 化合物	ChemComp-IVM / (2aE,4E,5'S,6S,6'R,7S,8E,11R,13R,15S,17aR,20R,20aR,20bS)-6'-[(2S)-butan-2-yl]-20,20b-dihydroxy-5',6,8,19-tetramethyl-17 -oxo-3',4',5',6,6',10,11,14,15,17,17a,20,20a,20b-tetradecahydro-2H,7H-spiro[11,15-methanofuro[4,3,2-pq][2,6]benzodioxacy clooctadecine-13,2'-pyran]-7-yl 2,6-dideoxy-4-O-(2,6-dideoxy-3-O-methyl-alpha-L-arabino-hexopyranosyl)-3-O-methyl-alpha-L-arabino-hexopyranoside / 22,23-DIHYDROAVERMECTIN B1A / IVERMECTIN 分子量: 875.093 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄₈H₇₄O₁₄ / コメント: 抗寄生虫剤*YM
#6: 化合物	ChemComp-IOD / IODIDE ION / ヨ-ジド分子量: 126.904 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: I
#7: 化合物	ChemComp-OCT / N-OCTANE / オクタン分子量: 114.229 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₈H₁₈
#8: 化合物	ChemComp-UND / UNDECANE / LIPID FRAGMENT / ウンデカン分子量: 156.308 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₁H₂₄
#9: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド分子量: 35.453 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl

-
詳細

Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 4 Å³/Da / 溶媒含有率: 69.23 %
結晶化	温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 4.5 詳細: 21-23% PEG 400, 50 mM sodium citrate pH 4.5, 70 mM sodium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 24-ID-C / 波長: 1.49 Å
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2010年10月23日詳細: Mirrors: bent cylinders, stripes of Pt, Rh and clear
放射	モノクロメーター: Cryo-cooled double Si(111) crystal monochromator プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1.49 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 3.8→40 Å / Num. all: 69600 / Num. obs: 69600 / % possible obs: 98.3 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 4.9 % / R_merge(I) obs: 0.142 / Net I/σ(I): 11.6
反射シェル	解像度: 3.8→3.94 Å / 冗長度: 5 % / R_merge(I) obs: 0.672 / Mean I/σ(I) obs: 2.7 / % possible all: 97.7

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
HKL-2000		データ収集
PHASER		位相決定
PHENIX	(phenix.refine: 1.7_650)	精密化
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 3RHW

3rhw

解像度: 3.8→38.775 Å / SU ML: 0.42 / σ(F): 0 / 位相誤差: 25.34 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2803	3349	5.04 %
R_work	0.2664	-	-
obs	0.2671	66435	93.9 %
all	-	66437	-

溶媒の処理

減衰半径: 0.83 Å / VDWプローブ半径: 1.1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / B_sol: 12.442 Å² / k_sol: 0.28 e/Å³

原子変位パラメータ

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	2.5452 Å²	0 Å²	-0 Å²
2-	-	2.5452 Å²	-0 Å²
3-	-	-	-5.0903 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 3.8→38.775 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	28730	0	429	0	29159

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.004	29952
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.728	40892
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	13.983	10752
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.048	4788
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.003	5044

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Refine-ID	タイプ	Rms dev position (Å)
1	1	A	2716	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL
1	2	B	2716	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.016
1	3	C	2706	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.017
1	4	D	2716	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.016
1	5	E	2716	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.017
2	1	F	949	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL
2	2	G	949	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.025
2	3	H	949	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.014
2	4	I	949	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.01
2	5	J	949	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.012
3	1	K	804	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL
3	2	L	804	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.013
3	3	M	804	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.012
3	4	N	804	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.011
3	5	O	804	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.048
4	1	A	62	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL
4	2	B	62	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.01
4	3	C	62	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.009
4	4	D	62	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.01
4	5	E	62	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.009

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
3.8-3.8535	0.3151	129	0.327	2273	X-RAY DIFFRACTION	83
3.8535-3.9109	0.3288	127	0.3289	2338	X-RAY DIFFRACTION	85
3.9109-3.972	0.3508	114	0.3213	2394	X-RAY DIFFRACTION	86
3.972-4.0371	0.3347	138	0.2961	2427	X-RAY DIFFRACTION	89
4.0371-4.1066	0.2837	111	0.2826	2502	X-RAY DIFFRACTION	90
4.1066-4.1812	0.2907	130	0.2644	2535	X-RAY DIFFRACTION	91
4.1812-4.2615	0.2579	134	0.2569	2526	X-RAY DIFFRACTION	92
4.2615-4.3484	0.2815	121	0.2496	2587	X-RAY DIFFRACTION	94
4.3484-4.4428	0.255	121	0.2404	2616	X-RAY DIFFRACTION	93
4.4428-4.546	0.2292	129	0.235	2604	X-RAY DIFFRACTION	95
4.546-4.6595	0.2377	132	0.2255	2627	X-RAY DIFFRACTION	95
4.6595-4.7853	0.2381	154	0.2128	2638	X-RAY DIFFRACTION	95
4.7853-4.9258	0.2136	157	0.2115	2638	X-RAY DIFFRACTION	96
4.9258-5.0845	0.2429	158	0.23	2657	X-RAY DIFFRACTION	96
5.0845-5.2658	0.2579	142	0.2317	2687	X-RAY DIFFRACTION	96
5.2658-5.476	0.2635	135	0.2483	2706	X-RAY DIFFRACTION	97
5.476-5.7245	0.272	138	0.2695	2699	X-RAY DIFFRACTION	96
5.7245-6.0253	0.3377	160	0.2879	2689	X-RAY DIFFRACTION	96
6.0253-6.4012	0.3016	143	0.2807	2721	X-RAY DIFFRACTION	97
6.4012-6.8929	0.3539	158	0.2945	2755	X-RAY DIFFRACTION	97
6.8929-7.5819	0.2956	145	0.258	2801	X-RAY DIFFRACTION	98
7.5819-8.6683	0.2379	155	0.2423	2848	X-RAY DIFFRACTION	99
8.6683-10.881	0.2584	188	0.2311	2857	X-RAY DIFFRACTION	99
10.881-38.7768	0.3602	130	0.357	2961	X-RAY DIFFRACTION	95

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.5865	-0.126	0.0269	2.8536	-0.4429	0.9892	0.0173	-0.0605	0.07	0.2873	0.0703	0.2478	0.0234	-0.1112	-0	0.7517	-0.0719	-0.0209	0.877	-0.0143	0.7088	-2.2137	74.4988	38.5492
2	0.9832	0.22	-0.1187	2.7697	-0.7087	1.0675	-0.0258	0.1228	-0.0732	0.0192	0.2409	0.0126	0.2087	-0.0264	0	0.7819	-0.0221	-0.0292	0.9288	-0.1276	0.7195	22.854	71.9542	35.2644
3	0.9612	-0.397	0.2554	2.9004	-1.2221	1.804	0.0739	0.1103	-0.0082	-0.0682	-0.0263	-0.0789	0.1937	0.1256	-0	0.7758	-0.054	-0.0305	0.8338	-0.169	0.8807	34.3174	81.2064	55.7977
4	1.408	0.2304	-0.1197	1.8162	-0.9115	1.4585	0.0237	-0.21	-0.062	0.1395	-0.04	-0.091	0.055	0.0687	-0	0.956	-0.0181	-0.0296	0.863	-0.2019	0.7988	16.5794	89.6278	71.8078
5	1.106	0.5336	0.0632	2.5734	-0.7483	1.3069	-0.0292	-0.0859	0.0984	0.3973	0.0717	0.1036	-0.06	-0.0524	0	0.8158	0.0994	0.1124	0.8398	-0.1271	0.8681	-6.1374	85.4807	61.1974
6	0.0241	0.0575	-0.0089	0.0006	-0.0214	0.0202	0.3805	0.3095	-1.3427	-0.6585	-0.3117	-0.3796	0.4452	0.5476	-0	0.6484	-0.1585	-0.0051	1.2522	0.004	0.5419	10.9761	92.4924	21.367
7	0.0041	0.0391	0.021	0.0843	0.0747	0.0488	0.1919	-0.0297	-0.3202	0.4268	-0.3895	-0.257	0.0959	0.8936	0	0.8976	-0.21	-0.0597	1.1039	0.0696	1.0042	34.5382	97.1105	33.4207
8	0.0204	-0.0566	0.0442	0.0455	-0.0011	-0.0333	-0.3783	-1.1572	0.2859	0.2891	-0.3179	0.514	0.3902	0.6873	-0	1.3696	-0.264	-0.4081	-1.7221	-2.026	0.3742	29.8859	108.9688	57.2847
9	0.0113	-0.0301	0.0561	0.0399	-0.0353	0.0566	0.2784	-0.4368	0.1141	-0.2666	-0.8892	0.572	0.1966	-0.2216	0	1.0457	-0.0265	0.2388	1.095	-0.068	1.3245	2.8918	111.3169	60.2502
10	0.0347	0.0148	-0.1121	0.0121	-0.0332	0.1023	-0.5007	-0.237	-0.0006	0.1403	-0.9833	0.0597	0.6825	-0.3653	-0	0.7587	0.0476	-0.1159	1.0011	0.01	0.9233	-8.7833	101.2709	37.9733
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18	0.3144	0.3874	-0.9063	-0.476	-0.0245	-0.2131	-0.052	-3.7536	0.5348	0.0176	-1.6169	-0.2636	2.2557	-4.6589	0	3.176	-2.1077	0.5339	6.1887	-1.4558	1.4472	-11.1475	85.1165	138.5171
19	3.8445	0.5493	0.4673	1.9399	0.319	3.5258	0.0513	0.1425	0.0033	0.1019	0.0468	0.6792	0.0433	-0.4633	0	0.9309	-0.0853	0.1585	0.8715	-0.0507	1.2156	-38.7705	64.175	62.3948
20	0.7928	0.7806	0.0911	0.428	0.7376	1.1528	-0.0884	-0.1941	-0.6813	-0.0852	-0.2187	0.9781	0.3271	-0.8563	-0	1.6407	0.0813	0.4532	1.5729	-0.0239	2.45	-68.4291	50.0224	66.4757

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain A
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain B
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain C
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain D
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain E
6	X-RAY DIFFRACTION	6	A348
7	X-RAY DIFFRACTION	7	C349
8	X-RAY DIFFRACTION	8	C350
9	X-RAY DIFFRACTION	9	E348
10	X-RAY DIFFRACTION	10	E349
11	X-RAY DIFFRACTION	11	(chain F and resid 1:120) or (chain N and
12	X-RAY DIFFRACTION	12	(chain F and resid 126:221) or (chain N and
13	X-RAY DIFFRACTION	13	(chain G and resid 1:120) or (chain K and
14	X-RAY DIFFRACTION	14	(chain G and resid 126:221) or (chain K and
15	X-RAY DIFFRACTION	15	(chain H and resid 1:120) or (chain L and
16	X-RAY DIFFRACTION	16	(chain H and resid 126:221) or (chain L and
17	X-RAY DIFFRACTION	17	(chain I and resid 1:120) or (chain O and
18	X-RAY DIFFRACTION	18	(chain I and resid 126:221) or (chain O and
19	X-RAY DIFFRACTION	19	(chain J and resid 1:120) or (chain M and
20	X-RAY DIFFRACTION	20	(chain J and resid 126:221) or (chain M and

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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