登録情報 | データベース: PDB / ID: 3rc9 |
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タイトル | Crystal Structure of the K102A mutant of KijD10, a 3-ketoreductase from Actinomadura kijaniata in complex with TDP-benzene and NADP |
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要素 | Sugar 3-ketoreductase |
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キーワード | SUGAR BINDING PROTEIN / sugar biosynthesis / ketoreductase / TDP binding / NADP binding |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
dTDP-3,4-didehydro-2,6-dideoxy-alpha-D-glucose 3-reductase / D-xylose 1-dehydrogenase (NADP+) activity / D-xylose catabolic process / antibiotic biosynthetic process / nucleotide binding類似検索 - 分子機能 : / Gfo/Idh/MocA-like oxidoreductase, C-terminal / Oxidoreductase family, C-terminal alpha/beta domain / Gfo/Idh/MocA-like oxidoreductase, N-terminal / Oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold / Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2 / Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2 / NAD(P)-binding Rossmann-like Domain / NAD(P)-binding domain superfamily / Rossmann fold ...: / Gfo/Idh/MocA-like oxidoreductase, C-terminal / Oxidoreductase family, C-terminal alpha/beta domain / Gfo/Idh/MocA-like oxidoreductase, N-terminal / Oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold / Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2 / Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2 / NAD(P)-binding Rossmann-like Domain / NAD(P)-binding domain superfamily / Rossmann fold / 2-Layer Sandwich / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE / PHOSPHATE ION / Chem-TLO / dTDP-3,4-didehydro-2,6-dideoxy-alpha-D-glucose 3-reductase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Actinomadura kijaniata (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 1.91 Å |
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データ登録者 | Holden, H.M. / Kubiak, R.L. |
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引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 2011 タイトル: Combined Structural and Functional Investigation of a C-3''-Ketoreductase Involved in the Biosynthesis of dTDP-l-Digitoxose. 著者: Kubiak, R.L. / Holden, H.M. |
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履歴 | 登録 | 2011年3月30日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2011年6月8日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2023年9月13日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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