温度: 289 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 詳細: MyavA01326iA1 PS00693 at 36.4 mg/mL against JCSG+ screen condition A5, 0.2 M MgFormate, 20% PEG 3350 with 25% ethylene glycol as cryo-protectant, Crystal tracking ID 216974a5, VAPOR ...詳細: MyavA01326iA1 PS00693 at 36.4 mg/mL against JCSG+ screen condition A5, 0.2 M MgFormate, 20% PEG 3350 with 25% ethylene glycol as cryo-protectant, Crystal tracking ID 216974a5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K
-
データ収集
回折
平均測定温度: 100 K
放射光源
由来: シンクロトロン / サイト: ALS / ビームライン: 5.0.1 / 波長: 0.97946 Å
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 0.97946 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 2→50 Å / Num. obs: 121812 / % possible obs: 98.1 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 3.6 % / Biso Wilson estimate: 32.649 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.068 / Net I/σ(I): 12.42
反射 シェル
Diffraction-ID: 1
解像度 (Å)
最高解像度 (Å)
冗長度 (%)
Rmerge(I) obs
Mean I/σ(I) obs
Num. measured obs
Num. unique all
Num. unique obs
% possible all
2-2.05
2.8
0.369
2.5
22874
8066
8066
88.2
2.05-2.11
3.2
0.326
3.3
27691
8611
8611
96.3
2.11-2.17
0.282
4.2
31707
8660
8660
100
2.17-2.24
0.255
4.8
31773
8453
8453
99.6
2.24-2.31
0.208
6
30293
8072
8072
99.6
2.31-2.39
0.175
7
29714
7914
7914
99.5
2.39-2.48
0.149
8.3
28383
7564
7564
99.5
2.48-2.58
0.129
9.5
27344
7304
7304
99.4
2.58-2.7
0.109
11
26219
7022
7022
99.2
2.7-2.83
0.093
13
24667
6675
6675
99
2.83-2.98
0.078
15.1
23325
6350
6350
99.1
2.98-3.16
0.066
17.4
21803
5974
5974
98.6
3.16-3.38
0.058
19.5
20261
5602
5602
98.5
3.38-3.65
0.049
22.7
18820
5238
5238
98.6
3.65-4
0.043
24.7
17074
4816
4816
98.3
4-4.47
0.039
27.2
15611
4385
4385
98.5
4.47-5.16
0.037
28.2
13618
3841
3841
98.6
5.16-6.32
0.036
27.4
11742
3303
3303
99.2
6.32-8.94
0.03
30
9562
2558
2558
99.6
8.94
0.024
31.6
5177
1404
1404
97.6
-
位相決定
位相決定
手法: 分子置換
Phasing MR
Rfactor: 53 / Model details: Phaser MODE: MR_AUTO
最高解像度
最低解像度
Rotation
3 Å
47.84 Å
Translation
3 Å
47.84 Å
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
NB
XSCALE
データスケーリング
PHASER
2.1.4
位相決定
REFMAC
精密化
PDB_EXTRACT
3.1
データ抽出
XDS
データ削減
精密化
構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 2→50 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.96 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.939 / WRfactor Rfree: 0.2071 / WRfactor Rwork: 0.1657 / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 0.4 / FOM work R set: 0.8691 / SU B: 8.911 / SU ML: 0.109 / SU R Cruickshank DPI: 0.1623 / SU Rfree: 0.1493 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R Free: 0.149 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS. U VALUES:RESIDUAL ONLY
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.2144
6117
5 %
RANDOM
Rwork
0.1708
-
-
-
obs
0.173
121719
98.13 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK