登録情報 | データベース: PDB / ID: 3o3f |
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タイトル | T. maritima RNase H2 D107N in complex with nucleic acid substrate and magnesium ions |
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要素 | - DNA (5'-D(*GP*AP*AP*TP*CP*AP*GP*GP*TP*GP*TP*C)-3')
- DNA/RNA (5'-D(*GP*AP*CP*AP*C)-R(P*C)-D(P*TP*GP*AP*TP*TP*C)-3')
- Ribonuclease HII
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キーワード | HYDROLASE/DNA-RNA hybrid / RNase H / nuclease / HYDROLASE-DNA-RNA hybrid complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
ribonuclease H2 complex / DNA replication, removal of RNA primer / ribonuclease H / mismatch repair / RNA-DNA hybrid ribonuclease activity / manganese ion binding / RNA binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Ribonuclease HII / Ribonuclease (RNase) H type-2 domain profile. / Ribonuclease HII/HIII / Ribonuclease HII/HIII domain / Ribonuclease HII / Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H / Nucleotidyltransferase; domain 5 / Ribonuclease H superfamily / Ribonuclease H-like superfamily / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 DNA / DNA (> 10) / DNA/RNA hybrid / DNA/RNA hybrid (> 10) / Ribonuclease HII類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Thermotoga maritima (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2 Å |
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データ登録者 | Rychlik, M.P. / Chon, H. / Cerritelli, S.M. / Klimek, P. / Crouch, R.J. / Nowotny, M. |
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引用 | ジャーナル: Mol.Cell / 年: 2010 タイトル: Crystal Structures of RNase H2 in Complex with Nucleic Acid Reveal the Mechanism of RNA-DNA Junction Recognition and Cleavage. 著者: Rychlik, M.P. / Chon, H. / Cerritelli, S.M. / Klimek, P. / Crouch, R.J. / Nowotny, M. |
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履歴 | 登録 | 2010年7月24日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2010年12月8日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2024年2月21日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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