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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3nvj | ||||||
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タイトル | Crystal structure of the C143A/C166A mutant of Ero1p | ||||||
![]() | Endoplasmic oxidoreductin-1 | ||||||
![]() | OXIDOREDUCTASE / flavoenzyme / FAD / disulfide bonds / ER | ||||||
機能・相同性 | ![]() 酸化還元酵素; 含硫化合物に対し酸化酵素として働く; ジスルフィドが電子受容体 / thiol oxidase activity / protein folding in endoplasmic reticulum / protein-disulfide reductase activity / FAD binding / endoplasmic reticulum membrane / endoplasmic reticulum 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Fass, D. / Vonshak, O. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Steps in reductive activation of the disulfide-generating enzyme Ero1p 著者: Heldman, N. / Vonshak, O. / Sevier, C.S. / Vitu, E. / Mehlman, T. / Fass, D. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 87.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 64.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 898.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 917.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 18 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 23.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 45294.898 Da / 分子数: 1 / 断片: residues in UNP 56-424 / 変異: C143A,C166A / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: ERO1, YML130C, YM4987.05C / プラスミド: pGEX-4T1 / 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: Q03103, 酸化還元酵素; 含硫化合物に対し酸化酵素として働く; ジスルフィドが電子受容体 |
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#2: 化合物 | ChemComp-NEN / |
#3: 化合物 | ChemComp-FAD / |
#4: 化合物 | ChemComp-CD / |
#5: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 4.64 Å3/Da / 溶媒含有率: 73.51 % |
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-データ収集
放射光源 | 由来: ![]() |
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検出器 | タイプ: RIGAKU RAXIS IV++ / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2010年5月16日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.514 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 3.2→50 Å / Num. all: 13439 / Num. obs: 13131 / % possible obs: 97.7 % / Observed criterion σ(F): 2 / Observed criterion σ(I): 1 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: 1RQ1 解像度: 3.2→50 Å / σ(F): 2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 3.2→50 Å
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