- PDB-3nio: Crystal structure of Pseudomonas aeruginosa guanidinobutyrase -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 3nio
タイトル
Crystal structure of Pseudomonas aeruginosa guanidinobutyrase
要素
Guanidinobutyrase
キーワード
HYDROLASE / PA1421 / guanidinobutyrase / GbuA
機能・相同性
機能・相同性情報
guanidinobutyrase / guanidinobutyrase activity / putrescine biosynthetic process from arginine, using agmatinase / agmatinase activity / arginine catabolic process / metal ion binding 類似検索 - 分子機能
Agmatinase-related / Ureohydrolase domain / Ureohydrolase, manganese-binding site / Arginase family signature. / Ureohydrolase / Arginase family / Arginase family profile. / Arginase; Chain A / Ureohydrolase domain superfamily / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性
解像度: 2→20 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.933 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.922 / SU B: 4.586 / SU ML: 0.128 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R Free: 0.18 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.25105
6635
5 %
RANDOM
Rwork
0.23321
-
-
-
obs
0.23409
125264
99.88 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK