TRANSPORT PROTEIN / LptC / lipopolysaccharide export pathway / Structural Genomics / Scottish Structural Proteomics Facility / SSPF
機能・相同性
機能・相同性情報
lipopolysaccharide transmembrane transporter activity / transporter complex / glycolipid transfer activity / lipopolysaccharide transport / Gram-negative-bacterium-type cell outer membrane assembly / outer membrane-bounded periplasmic space / membrane / identical protein binding / plasma membrane 類似検索 - 分子機能
Lipopolysaccharide (LPS) transport protein A like domain / Lipopolysaccharide assembly, LptC-related / Lipopolysaccharide export system protein LptC / Lipopolysaccharide-assembly, LptC-related / lipopolysaccharide transport protein A fold / Sandwich / Mainly Beta 類似検索 - ドメイン・相同性
Lipopolysaccharide export system protein LptC 類似検索 - 構成要素
解像度: 2.2→2.26 Å / 冗長度: 6.8 % / Rmerge(I) obs: 0.604 / Mean I/σ(I) obs: 2.3 / Rsym value: 0.709 / % possible all: 99.9
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
MOSFLM
データ削減
SOLVE
位相決定
REFMAC
5.2.0019
精密化
SCALA
データスケーリング
精密化
構造決定の手法: 単波長異常分散 / 解像度: 2.2→37 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.958 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.95 / SU B: 9.626 / SU ML: 0.106 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.151 / ESU R Free: 0.141 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.22226
718
5 %
RANDOM
Rwork
0.19466
-
-
-
obs
0.19606
13542
99.53 %
-
all
-
14286
-
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK