PDB-3mxg: Structure of Shiga Toxin type 2 (Stx2) B Pentamer Mutant Q40L

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3mxg

タイトル

Structure of Shiga Toxin type 2 (Stx2) B Pentamer Mutant Q40L

要素

Shiga-like toxin 2 subunit B

キーワード

TOXIN / Stx2B pentamer / shiga toxin

機能・相同性

機能・相同性情報

symbiont-mediated hemolysis of host erythrocyte / toxin activity / extracellular region
類似検索 - 分子機能

生物種

Escherichia coli (大腸菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.49 Å

データ登録者

Kovall, R.A. / Vander Wielen, B.D. / Friedmann, D.R. / Flagler, M.J.

引用

ジャーナル: Plos One / 年: 2010
タイトル: Molecular basis of differential B-pentamer stability of Shiga toxins 1 and 2.
著者: Conrady, D.G. / Flagler, M.J. / Friedmann, D.R. / Vander Wielen, B.D. / Kovall, R.A. / Weiss, A.A. / Herr, A.B.

履歴

登録	2010年5月7日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2011年1月12日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年7月13日	Group: Version format compliance
改定 1.2	2012年4月11日	Group: Database references
改定 1.3	2017年11月8日	Group: Refinement description / カテゴリ: software
改定 1.4	2020年7月29日	Group: Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: chem_comp / entity ...chem_comp / entity / pdbx_entity_nonpoly / struct_ref_seq_dif / struct_site / struct_site_gen Item: _chem_comp.name / _entity.pdbx_description ..._chem_comp.name / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.name / _struct_ref_seq_dif.details 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation
改定 1.5	2024年11月20日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature / struct_ncs_dom_lim Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI ..._chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	3mxg.cif.gz	287.3 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb3mxg.ent.gz	241.9 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	3mxg.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/mx/3mxg ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/mx/3mxg	HTTPS FTP

-
関連構造データ

類似構造データ	1qoh-4 1qoh-1 1bos-4 2xsc-d 1c48-d 1qoh-2 1bos-2 1czw-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#69 - 2005年9月コレラ毒素 (Cholera Toxin) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Shiga-like toxin 2 subunit B

B: Shiga-like toxin 2 subunit B

C: Shiga-like toxin 2 subunit B

D: Shiga-like toxin 2 subunit B

E: Shiga-like toxin 2 subunit B

F: Shiga-like toxin 2 subunit B

G: Shiga-like toxin 2 subunit B

H: Shiga-like toxin 2 subunit B

I: Shiga-like toxin 2 subunit B

J: Shiga-like toxin 2 subunit B

ヘテロ分子

78.7 kDa, 10 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Shiga-like toxin 2 subunit B

G: Shiga-like toxin 2 subunit B

H: Shiga-like toxin 2 subunit B

I: Shiga-like toxin 2 subunit B

J: Shiga-like toxin 2 subunit B

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
39.2 kDa, 5 ポリマー
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2

B: Shiga-like toxin 2 subunit B

C: Shiga-like toxin 2 subunit B

D: Shiga-like toxin 2 subunit B

E: Shiga-like toxin 2 subunit B

F: Shiga-like toxin 2 subunit B

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
39.5 kDa, 5 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	121.908, 69.208, 103.013
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 124.36, 90.00
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	A
2	1	B
3	1	C
4	1	D
5	1	E
6	1	F
7	1	G
8	1	H
9	1	I
10	1	J

NCSドメイン領域:

Ens-ID: 1

Dom-ID	Component-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Refine code	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	ALA	ALA	ILE	ILE	2	A	A	1 - 8	1 - 8
2	1	ALA	ALA	ILE	ILE	2	B	B	1 - 8	1 - 8
3	1	ALA	ALA	ILE	ILE	2	C	C	1 - 8	1 - 8
4	1	ALA	ALA	ILE	ILE	2	D	D	1 - 8	1 - 8
5	1	ALA	ALA	ILE	ILE	2	E	E	1 - 8	1 - 8
6	1	ALA	ALA	ILE	ILE	2	F	F	1 - 8	1 - 8
7	1	ALA	ALA	ILE	ILE	2	G	G	1 - 8	1 - 8
8	1	ALA	ALA	ILE	ILE	2	H	H	1 - 8	1 - 8
9	1	ALA	ALA	ILE	ILE	2	I	I	1 - 8	1 - 8
10	1	ALA	ALA	ILE	ILE	2	J	J	1 - 8	1 - 8
1	2	PHE	PHE	ASN	ASN	2	A	A	10 - 14	10 - 14
2	2	PHE	PHE	ASN	ASN	2	B	B	10 - 14	10 - 14
3	2	PHE	PHE	ASN	ASN	2	C	C	10 - 14	10 - 14
4	2	PHE	PHE	ASN	ASN	2	D	D	10 - 14	10 - 14
5	2	PHE	PHE	ASN	ASN	2	E	E	10 - 14	10 - 14
6	2	PHE	PHE	ASN	ASN	2	F	F	10 - 14	10 - 14
7	2	PHE	PHE	ASN	ASN	2	G	G	10 - 14	10 - 14
8	2	PHE	PHE	ASN	ASN	2	H	H	10 - 14	10 - 14
9	2	PHE	PHE	ASN	ASN	2	I	I	10 - 14	10 - 14
10	2	PHE	PHE	ASN	ASN	2	J	J	10 - 14	10 - 14
1	3	ASP	ASP	ASP	ASP	2	A	A	16	16
2	3	ASP	ASP	ASP	ASP	2	B	B	16	16
3	3	ASP	ASP	ASP	ASP	2	C	C	16	16
4	3	ASP	ASP	ASP	ASP	2	D	D	16	16
5	3	ASP	ASP	ASP	ASP	2	E	E	16	16
6	3	ASP	ASP	ASP	ASP	2	F	F	16	16
7	3	ASP	ASP	ASP	ASP	2	G	G	16	16
8	3	ASP	ASP	ASP	ASP	2	H	H	16	16
9	3	ASP	ASP	ASP	ASP	2	I	I	16	16
10	3	ASP	ASP	ASP	ASP	2	J	J	16	16
1	4	THR	THR	ARG	ARG	2	A	A	18 - 32	18 - 32
2	4	THR	THR	ARG	ARG	2	B	B	18 - 32	18 - 32
3	4	THR	THR	ARG	ARG	2	C	C	18 - 32	18 - 32
4	4	THR	THR	ARG	ARG	2	D	D	18 - 32	18 - 32
5	4	THR	THR	ARG	ARG	2	E	E	18 - 32	18 - 32
6	4	THR	THR	ARG	ARG	2	F	F	18 - 32	18 - 32
7	4	THR	THR	ARG	ARG	2	G	G	18 - 32	18 - 32
8	4	THR	THR	ARG	ARG	2	H	H	18 - 32	18 - 32
9	4	THR	THR	ARG	ARG	2	I	I	18 - 32	18 - 32
10	4	THR	THR	ARG	ARG	2	J	J	18 - 32	18 - 32
1	5	LEU	LEU	SER	SER	2	A	A	35 - 53	35 - 53
2	5	LEU	LEU	SER	SER	2	B	B	35 - 53	35 - 53
3	5	LEU	LEU	SER	SER	2	C	C	35 - 53	35 - 53
4	5	LEU	LEU	SER	SER	2	D	D	35 - 53	35 - 53
5	5	LEU	LEU	SER	SER	2	E	E	35 - 53	35 - 53
6	5	LEU	LEU	SER	SER	2	F	F	35 - 53	35 - 53
7	5	LEU	LEU	SER	SER	2	G	G	35 - 53	35 - 53
8	5	LEU	LEU	SER	SER	2	H	H	35 - 53	35 - 53
9	5	LEU	LEU	SER	SER	2	I	I	35 - 53	35 - 53
10	5	LEU	LEU	SER	SER	2	J	J	35 - 53	35 - 53
1	6	THR	THR	CYS	CYS	2	A	A	55 - 56	55 - 56
2	6	THR	THR	CYS	CYS	2	B	B	55 - 56	55 - 56
3	6	THR	THR	CYS	CYS	2	C	C	55 - 56	55 - 56
4	6	THR	THR	CYS	CYS	2	D	D	55 - 56	55 - 56
5	6	THR	THR	CYS	CYS	2	E	E	55 - 56	55 - 56
6	6	THR	THR	CYS	CYS	2	F	F	55 - 56	55 - 56
7	6	THR	THR	CYS	CYS	2	G	G	55 - 56	55 - 56
8	6	THR	THR	CYS	CYS	2	H	H	55 - 56	55 - 56
9	6	THR	THR	CYS	CYS	2	I	I	55 - 56	55 - 56
10	6	THR	THR	CYS	CYS	2	J	J	55 - 56	55 - 56
1	7	SER	SER	ASN	ASN	4	A	A	58 - 68	58 - 68
2	7	SER	SER	ASN	ASN	4	B	B	58 - 68	58 - 68
3	7	SER	SER	ASN	ASN	4	C	C	58 - 68	58 - 68
4	7	SER	SER	ASN	ASN	4	D	D	58 - 68	58 - 68
5	7	SER	SER	ASN	ASN	4	E	E	58 - 68	58 - 68
6	7	SER	SER	ASN	ASN	4	F	F	58 - 68	58 - 68
7	7	SER	SER	ASN	ASN	4	G	G	58 - 68	58 - 68
8	7	SER	SER	ASN	ASN	4	H	H	58 - 68	58 - 68
9	7	SER	SER	ASN	ASN	4	I	I	58 - 68	58 - 68
10	7	SER	SER	ASN	ASN	4	J	J	58 - 68	58 - 68

#1: タンパク質	Shiga-like toxin 2 subunit B / SLT-2 B subunit / SLT-2b / SLT-IIb / Verocytotoxin 2 subunit B / Verotoxin 2 subunit B 分子量: 7809.619 Da / 分子数: 10 / 断片: unp residues 20-89 / 変異: Q40L / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Escherichia coli (大腸菌) / 株: O157:H7 / 遺伝子: stx2B, L0104 / プラスミド: pET21b / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3)pLysS / 参照: UniProt: A7UQX3
#2: 糖	ChemComp-XLS / D-xylose / D-XYLOSE (LINEAR FORM) / キシロ-スタイプ: D-saccharide / 分子量: 150.130 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C₅H₁₀O₅
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 29 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.3 Å³/Da / 溶媒含有率: 46.45 %
結晶化	温度: 298 K / pH: 7.1 詳細: 100mM HEPES, 200mM Magnesium Chloride, 25% PEG-3350, pH 7.1, temperature 298K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 22-ID / 波長: 1
検出器	タイプ: MAR / 検出器: CCD / 日付: 2009年3月26日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.49→50 Å / Num. obs: 24345 / % possible obs: 98.3 % / 冗長度: 3.4 % / R_merge(I) obs: 0.078 / Net I/σ(I): 14.5
反射シェル	解像度: 2.49→2.59 Å / 冗長度: 3.1 % / R_merge(I) obs: 0.291 / % possible all: 91.1

-
位相決定

位相決定	手法: 分子置換

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
DENZO		データ削減
SCALEPACK		データスケーリング
PHASER		位相決定
REFMAC		精密化
PDB_EXTRACT	3.1	データ抽出
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 2.49→30.46 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.953 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.922 / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 0.5 / SU B: 26.692 / SU ML: 0.269 / SU R Cruickshank DPI: 1.291 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 1.291 / ESU R Free: 0.333 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.266	1239	5.1 %	RANDOM
R_work	0.202	-	-	-
obs	0.205	24343	97.7 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 61.09 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-0.02 Å²	0 Å²	0.01 Å²
2-	-	-0.01 Å²	0 Å²
3-	-	-	0.04 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.49→30.46 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	5480	0	40	29	5549

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.016	0.022	5632
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.637	1.944	7614
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	6.544	5	692
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	36.983	26.169	261
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	17.898	15	971
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	7.259	15	10
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.103	0.2	843
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.006	0.02	4218
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	0.547	1.5	3463
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	1.044	2	5566
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	1.745	3	2169
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	2.772	4.5	2047
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

Refine LS restraints NCS

Ens-ID: 1 / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

Dom-ID	Auth asym-ID	数	タイプ	Rms dev position (Å)	Weight position
1	A	200	tight positional	0.26	0.05
2	B	200	tight positional	0.25	0.05
3	C	200	tight positional	0.19	0.05
4	D	200	tight positional	0.2	0.05
5	E	200	tight positional	0.28	0.05
6	F	200	tight positional	0.21	0.05
7	G	200	tight positional	0.19	0.05
8	H	200	tight positional	0.19	0.05
9	I	200	tight positional	0.19	0.05
10	J	200	tight positional	0.2	0.05
1	A	268	medium positional	0.33	0.5
2	B	268	medium positional	0.36	0.5
3	C	268	medium positional	0.36	0.5
4	D	268	medium positional	0.32	0.5
5	E	268	medium positional	0.46	0.5
6	F	268	medium positional	0.31	0.5
7	G	268	medium positional	0.33	0.5
8	H	268	medium positional	0.36	0.5
9	I	268	medium positional	0.38	0.5
10	J	268	medium positional	0.32	0.5
1	A	200	tight thermal	0.72	0.5
2	B	200	tight thermal	0.68	0.5
3	C	200	tight thermal	0.65	0.5
4	D	200	tight thermal	0.85	0.5
5	E	200	tight thermal	0.66	0.5
6	F	200	tight thermal	0.92	0.5
7	G	200	tight thermal	0.79	0.5
8	H	200	tight thermal	0.8	0.5
9	I	200	tight thermal	0.59	0.5
10	J	200	tight thermal	0.7	0.5
1	A	268	medium thermal	1.02	2
2	B	268	medium thermal	0.91	2
3	C	268	medium thermal	1.06	2
4	D	268	medium thermal	1.04	2
5	E	268	medium thermal	0.95	2
6	F	268	medium thermal	1.17	2
7	G	268	medium thermal	0.99	2
8	H	268	medium thermal	0.94	2
9	I	268	medium thermal	1.01	2
10	J	268	medium thermal	1.17	2

LS精密化シェル

解像度: 2.49→2.56 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.404	71	-
R_work	0.327	1381	-
obs	-	-	80.89 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.0903	-0.698	0.4583	6.3164	1.9676	1.8491	0.1489	-0.3016	0.2656	0.3272	-0.1506	-0.295	-0.1758	0.0194	0.0016	0.3311	-0.0937	0.0436	0.3869	-0.0577	0.3416	16.18	56.142	3.061
2	21.3602	6.6331	3.7604	24.8412	21.1957	18.27	-0.1453	-0.2329	0.0224	-0.3401	-0.2546	0.4601	-0.2837	-0.1883	0.3998	0.2672	0.0029	0.0138	0.3177	0.0333	0.2806	7.7	45.456	-5.354
3	5.3649	1.4491	1.6394	6.3001	3.3823	8.4084	-0.2337	-0.6668	0.3726	0.3804	-0.4794	0.3162	-0.3385	-0.663	0.713	0.3134	-0.0684	-0.0361	0.3785	-0.0452	0.3086	14.184	54.814	4.678
4	7.2224	-0.9962	-0.5733	1.9407	-0.3295	2.1874	0.0353	0.2617	-0.0588	-0.1083	-0.1474	0.0518	0.072	0.0908	0.1122	0.318	-0.0105	-0.0307	0.3287	0.0144	0.3659	13.718	54.444	-5.634
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47	3.3641	3.1246	2.853	3.2008	3.0483	2.9709	-0.135	0.2759	0.4416	-0.1283	0.1642	0.1236	-0.1648	0.1932	-0.0292	0.4162	-0.0794	-0.0057	0.4402	0.0388	0.4489	27.541	71.717	-18.809
48	3.03	-3.1555	-0.2089	8.8659	-1.8175	0.7683	-0.1672	0.0487	0.6896	0.3412	0.3601	-0.215	-0.0515	-0.1141	-0.1929	0.4737	0.0086	-0.0258	0.3041	0.0425	0.4485	19.895	74.771	-19.159
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54	10.6409	-1.0983	9.2945	3.7044	0.5983	27.6876	0.1935	0.5104	-0.0683	-0.1832	0.1556	-0.1192	0.4185	0.3866	-0.3492	0.319	-0.0385	0.03	0.3309	-0.0467	0.4419	37.358	52.748	-30.482
55	1.6203	-1.4859	-0.6737	4.1837	-3.1109	5.5403	0.1314	0.4749	0.3264	-0.5101	-0.1504	-0.3384	0.1149	-0.2926	0.0189	0.5542	-0.19	-0.0058	0.6151	0.0496	0.4119	33.004	56.93	-35.985
56	18.9763	3.6521	-16.3099	5.7526	-7.7001	18.1427	-0.2599	-1.6165	-0.0376	0.6082	-0.8546	-1.238	-0.3837	1.8837	1.1145	0.3494	-0.1071	-0.1264	0.4461	-0.0536	0.6277	40.185	48.525	-23.189
57	4.4928	-1.0154	1.6209	3.5689	-1.3311	2.7518	-0.1494	-0.3619	-0.0268	0.1074	0.2236	-0.5549	0.1779	0.4024	-0.0743	0.276	0.0383	0.054	0.4148	-0.0934	0.3256	36.019	37.846	-21.603
58	16.7309	6.2411	14.0272	33.9843	-4.6576	16.4154	0.1627	0.4896	0.6954	-1.0044	-0.4048	0.7961	-0.0826	0.3269	0.242	0.3273	0.0266	-0.0108	0.3633	-0.0821	0.3408	26.909	44.77	-32.673
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62	0.8372	0.9461	-1.3572	2.1317	1.6138	11.6113	-0.1735	-0.1578	-0.3284	-0.2327	-0.1567	-0.3947	0.2367	0.2311	0.3303	0.3481	-0.0027	0.0376	0.3921	0.0382	0.443	30.281	31.516	-25.275
63	10.9702	5.4069	7.9752	12.1699	1.3902	20.1281	-0.221	-1.8146	-0.7563	0.8547	0.1249	-1.1035	-0.733	0.913	0.0961	0.2026	0.1204	-0.0389	0.9044	0.0653	0.4292	32.986	36.368	-9.513
64	1.5547	0.4775	-0.3443	2.7882	-1.9385	1.6452	-0.0092	-0.3427	-0.1693	0.2174	0.0449	-0.0479	0.1157	0.2698	-0.0356	0.383	0.164	-0.0385	0.5071	0.009	0.3205	23.149	35.545	-3.197
65	4.811	0.6457	4.4632	3.9858	-0.1051	5.4886	0.0933	0.0114	-0.3485	-0.0154	0.1087	-0.0587	0.246	0.547	-0.2021	0.2674	0.0343	0.0219	0.3445	0.0367	0.3529	21.168	33.123	-10.421
66	6.375	-1.2198	-0.42	3.7641	-0.7196	8.3748	-0.0173	-0.3317	-0.0498	-0.3049	0.0419	-0.4831	0.3701	0.0432	-0.0246	0.1852	0.006	-0.0209	0.2973	-0.0073	0.3083	16.269	36.527	-9.326
67	3.7533	1.0055	1.3382	1.046	0.2262	4.8948	-0.1203	-0.1993	0.3441	0.1993	0.0464	-0.1175	-0.2081	0.6608	0.0739	0.2259	0.0097	-0.0422	0.3855	-0.0175	0.3509	25.729	44.006	-7.42
68	8.8851	1.7218	2.5278	3.1189	-0.1481	4.9893	0.3495	-0.6607	0.2226	0.1978	-0.3226	0.2097	0.3004	-0.0746	-0.0268	0.3203	0.0612	-0.0053	0.3762	0.0142	0.2656	16.822	38.043	0.952
69	10.8601	2.3492	-1.4191	13.3668	1.1715	6.8712	-0.0345	-0.2109	-0.5792	0.8783	-0.4341	0.7644	0.9078	0.1148	0.4686	0.2667	0.0057	-0.0135	0.3723	0.0312	0.2677	14.146	33.376	-3.342
70	0.4494	3.8232	-0.8627	38.1973	-6.8849	1.9105	0.1535	-0.2017	-0.0687	0.6847	-0.0715	-1.8067	-0.7219	0.6016	-0.082	0.8075	-0.4114	0.2399	0.9366	-0.2565	0.4011	22.454	46.43	3.22

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	1 - 13
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	14 - 18
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	19 - 26
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	27 - 42
5	X-RAY DIFFRACTION	5	A	43 - 54
6	X-RAY DIFFRACTION	6	A	55 - 64
7	X-RAY DIFFRACTION	7	A	65 - 70
8	X-RAY DIFFRACTION	8	B	1 - 8
9	X-RAY DIFFRACTION	9	B	9 - 16
10	X-RAY DIFFRACTION	10	B	17 - 25
11	X-RAY DIFFRACTION	11	B	26 - 39
12	X-RAY DIFFRACTION	12	B	40 - 54
13	X-RAY DIFFRACTION	13	B	55 - 65
14	X-RAY DIFFRACTION	14	B	66 - 70
15	X-RAY DIFFRACTION	15	C	1 - 13
16	X-RAY DIFFRACTION	16	C	14 - 25
17	X-RAY DIFFRACTION	17	C	26 - 35
18	X-RAY DIFFRACTION	18	C	36 - 42
19	X-RAY DIFFRACTION	19	C	43 - 55
20	X-RAY DIFFRACTION	20	C	56 - 65
21	X-RAY DIFFRACTION	21	C	66 - 70
22	X-RAY DIFFRACTION	22	D	1 - 13
23	X-RAY DIFFRACTION	23	D	14 - 25
24	X-RAY DIFFRACTION	24	D	26 - 34
25	X-RAY DIFFRACTION	25	D	35 - 45
26	X-RAY DIFFRACTION	26	D	46 - 54
27	X-RAY DIFFRACTION	27	D	55 - 64
28	X-RAY DIFFRACTION	28	D	65 - 70
29	X-RAY DIFFRACTION	29	E	1 - 9
30	X-RAY DIFFRACTION	30	E	10 - 17
31	X-RAY DIFFRACTION	31	E	18 - 26
32	X-RAY DIFFRACTION	32	E	27 - 46
33	X-RAY DIFFRACTION	33	E	47 - 53
34	X-RAY DIFFRACTION	34	E	54 - 61
35	X-RAY DIFFRACTION	35	E	62 - 70
36	X-RAY DIFFRACTION	36	F	1 - 13
37	X-RAY DIFFRACTION	37	F	14 - 25
38	X-RAY DIFFRACTION	38	F	26 - 35
39	X-RAY DIFFRACTION	39	F	36 - 46
40	X-RAY DIFFRACTION	40	F	47 - 55
41	X-RAY DIFFRACTION	41	F	56 - 65
42	X-RAY DIFFRACTION	42	F	66 - 70
43	X-RAY DIFFRACTION	43	G	1 - 13
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70	X-RAY DIFFRACTION	70	J	66 - 70

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新型コロナ情報

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