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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3las | ||||||
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タイトル | Crystal structure of carbonic anhydrase from streptococcus mutans to 1.4 angstrom resolution | ||||||
![]() | Putative carbonic anhydrase | ||||||
![]() | LYASE / carbonic anhydrase / Zinc binding / streptococcus mutans | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Ma, L.-L. / Wang, K.-T. / Liu, X. / Su, X.-D. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of carbonic anhydrase from streptococcus mutans to 1.4 angstrom resolution 著者: Ma, L.-L. / Wang, K.-T. / Liu, X. / Su, X.-D. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 141.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 110.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
-タンパク質 , 1種, 2分子 AB
#1: タンパク質 | 分子量: 18246.641 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: SMU_328 / プラスミド: pET28a / 発現宿主: ![]() ![]() |
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-非ポリマー , 5種, 331分子 








#2: 化合物 | #3: 化合物 | #4: 化合物 | ChemComp-GOL / | #5: 化合物 | #6: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.23 Å3/Da / 溶媒含有率: 44.79 % |
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結晶化 | 温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6 詳細: 30% PEG MME 2000, 0.1M NaCaD pH6.0, 0.2M MgCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARMOSAIC 225 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2009年5月10日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.4→50 Å / Num. obs: 61732 / % possible obs: 99.6 % / Observed criterion σ(I): 0 |
反射 シェル | 解像度: 1.4→1.48 Å / % possible all: 98 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 13.502 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.4→20 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 1.4→1.436 Å / Total num. of bins used: 20
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精密化 TLS | 手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION
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精密化 TLSグループ |
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