Small outer capsid protein Soc / Small outer capsid protein / Small outer capsid protein superfamily / Small outer capsid protein / Outer Surface Protein A; domain 3 / Alpha-Beta Complex / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性
IMIDAZOLE / Small outer capsid protein 類似検索 - 構成要素
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1.54 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 2.54→23.6 Å / Num. obs: 7033 / % possible obs: 99.6 % / 冗長度: 5.4 % / Rsym value: 0.058 / Net I/σ(I): 21.2
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
MOLREP
位相決定
PHENIX
(phenix.refine)
精密化
HKL-2000
データ削減
SCALEPACK
データスケーリング
精密化
構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: structure of the Soc protein from bacteriophage RB69 (hexagonal crystal form). 解像度: 2.254→23.595 Å / SU ML: 0.38 / σ(F): 1.35 / 立体化学のターゲット値: ML
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.2627
334
4.76 %
random
Rwork
0.2169
-
-
-
obs
0.2189
7023
99.67 %
-
溶媒の処理
減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / Bsol: 40.408 Å2 / ksol: 0.316 e/Å3