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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3gwn | ||||||
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タイトル | Crystal structure of the FAD binding domain from mimivirus sulfhydryl oxidase R596 | ||||||
![]() | Probable FAD-linked sulfhydryl oxidase R596 | ||||||
![]() | OXIDOREDUCTASE / FIVE HELIX BUNDLE / HOMODIMER / Disulfide bond / FAD / Flavoprotein / Virion | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Hakim, M. / Fass, D. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Dimer interface migration in a viral sulfhydryl oxidase 著者: Hakim, M. / Fass, D. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 69.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 51.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.2 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.2 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 16.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 21.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 13297.046 Da / 分子数: 2 / 断片: mimivirus R596 FAD binding domain / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: MIMI_R596, R596 / プラスミド: pET15b / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 化合物 | #3: 化合物 | #4: 化合物 | ChemComp-GOL / | #5: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.31 Å3/Da / 溶媒含有率: 46.67 % |
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結晶化 | 温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8 詳細: 0.5M ammonium sulfate, 25% PEG 4K, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 293 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: RIGAKU RAXIS IV++ / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2008年9月28日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.78→50 Å / Num. all: 24453 / Num. obs: 24259 / % possible obs: 99.2 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 11.2 % / Biso Wilson estimate: 22.8 Å2 / Rsym value: 0.078 / Net I/σ(I): 12.5 |
反射 シェル | 解像度: 1.78→1.81 Å / 冗長度: 4.5 % / Mean I/σ(I) obs: 2.3 / Rsym value: 0.407 / % possible all: 97.9 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 1JR8 解像度: 1.78→50 Å / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.78→50 Å
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拘束条件 |
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