ソフトウェア | 名称 | バージョン | 分類 |
---|
MAR345 | | データ収集 | AMoRE | | 位相決定 | REFMAC | 5.2.0019精密化 | AUTOMAR | | データ削減 | SCALEPACK | | データスケーリング | |
|
---|
精密化 | 構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 2→15 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.905 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.965 / SU B: 5.557 / SU ML: 0.146 / Isotropic thermal model: Isotropic / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.263 / ESU R Free: 0.195 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD
| Rfactor | 反射数 | %反射 | Selection details |
---|
Rfree | 0.24078 | 77 | 4.3 % | RANDOM |
---|
Rwork | 0.23882 | - | - | - |
---|
obs | 0.23892 | 1711 | 96.08 % | - |
---|
all | - | 1711 | - | - |
---|
|
---|
溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK |
---|
原子変位パラメータ | Biso mean: 12.664 Å2
| Baniso -1 | Baniso -2 | Baniso -3 |
---|
1- | -0.7 Å2 | 0 Å2 | 0 Å2 |
---|
2- | - | -0.57 Å2 | 0 Å2 |
---|
3- | - | - | 1.27 Å2 |
---|
|
---|
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→15 Å
| タンパク質 | 核酸 | リガンド | 溶媒 | 全体 |
---|
原子数 | 0 | 240 | 0 | 24 | 264 |
---|
|
---|
拘束条件 | Refine-ID | タイプ | Dev ideal | Dev ideal target | 数 |
---|
X-RAY DIFFRACTION | r_bond_refined_d0.027 | 0.021 | 268 | X-RAY DIFFRACTION | r_angle_refined_deg3.767 | 3 | 410 | X-RAY DIFFRACTION | r_chiral_restr0.177 | 0.2 | 46 | X-RAY DIFFRACTION | r_gen_planes_refined0.016 | 0.02 | 126 | X-RAY DIFFRACTION | r_nbd_refined0.182 | 0.2 | 84 | X-RAY DIFFRACTION | r_nbtor_refined0.303 | 0.2 | 150 | X-RAY DIFFRACTION | r_xyhbond_nbd_refined0.116 | 0.2 | 4 | X-RAY DIFFRACTION | r_symmetry_vdw_refined0.183 | 0.2 | 7 | X-RAY DIFFRACTION | r_symmetry_hbond_refined0.113 | 0.2 | 4 | | | | | | | | | |
|
---|
LS精密化 シェル | 解像度: 2→2.051 Å / Total num. of bins used: 20
| Rfactor | 反射数 | %反射 |
---|
Rfree | 0.105 | 4 | - |
---|
Rwork | 0.329 | 123 | - |
---|
obs | - | 123 | 99.22 % |
---|
|
---|