PDB-3fwy: Crystal structure of the L protein of Rhodobacter sphaeroides lig...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3fwy

タイトル

Crystal structure of the L protein of Rhodobacter sphaeroides light-independent protochlorophyllide reductase (BchL) with MgADP bound: a homologue of the nitrogenase Fe protein

要素

Light-independent protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein

キーワード

OXIDOREDUCTASE / BchL / protochlorophyllide / Electron donor / DPOR / Fe protein / nitrogenase / mixed alpha-beta domain / MgADP / ATP-binding / Bacteriochlorophyll biosynthesis / Chlorophyll biosynthesis / Iron / Iron-sulfur / Metal-binding / Nucleotide-binding / Photosynthesis

機能・相同性

機能・相同性情報

ferredoxin:protochlorophyllide reductase (ATP-dependent) / photosynthesis, dark reaction / light-independent bacteriochlorophyll biosynthetic process / oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors, iron-sulfur protein as acceptor / oxidoreductase activity, acting on iron-sulfur proteins as donors / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / ATP binding / metal ion binding
類似検索 - 分子機能

生物種

Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.63 Å

データ登録者

Sarma, R. / Barney, B.M. / Hamilton, T.L. / Jones, A. / Seefeldt, L.C. / Peters, J.W.

引用

ジャーナル: Biochemistry / 年: 2008
タイトル: Crystal Structure of the L Protein of Rhodobacter sphaeroides Light-Independent Protochlorophyllide Reductase with MgADP Bound: A Homologue of the Nitrogenase Fe Protein.
著者: Sarma, R. / Barney, B.M. / Hamilton, T.L. / Jones, A. / Seefeldt, L.C. / Peters, J.W.

履歴

登録	2009年1月19日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
置き換え	2009年3月24日	ID: 3END
改定 1.0	2009年3月24日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年7月13日	Group: Advisory / Version format compliance
改定 1.2	2017年11月1日	Group: Refinement description / カテゴリ: software
改定 1.3	2023年9月6日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ncs_dom_lim / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	3fwy.cif.gz	132.9 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb3fwy.ent.gz	101.8 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	3fwy.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	3fwy_validation.pdf.gz	1.1 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	3fwy_full_validation.pdf.gz	1.1 MB	表示
XML形式データ	3fwy_validation.xml.gz	25.5 KB	表示
CIF形式データ	3fwy_validation.cif.gz	37.3 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/fw/3fwy ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/fw/3fwy	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	2nipS S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	6nnr-d 6vpt-d 6q93-3 4f4i-d 5knn-2 2bbq-d 3fiu-2 5dxf-1 6jbw-1 5zu3-2 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#26 - 2002年2月ニトロゲナーゼ (Nitrogenase) 類似性 (7)

登録構造単位

A: Light-independent protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein

B: Light-independent protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein

ヘテロ分子

70.3 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	56.729, 86.622, 117.169
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	A
2	1	B

NCSドメイン領域:

Component-ID: 1 / Ens-ID: 1 / Beg auth comp-ID: GLY / Beg label comp-ID: GLY / End auth comp-ID: LEU / End label comp-ID: LEU / Refine code: 4 / Auth seq-ID: 30 - 250 / Label seq-ID: 47 - 267

Dom-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID
1	A	A
2	B	B

#1: タンパク質	Light-independent protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein / LI-POR subunit L / DPOR subunit L 分子量: 34515.043 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 (バクテリア) 株: 2.4.1 / NCIB 8253 / DSM 158 / 遺伝子: bchL, RHOS4_18930, RSP_0288 / プラスミド: pUC / 発現宿主: Azotobacter vinelandii (窒素固定) / 参照: UniProt: Q9RFD6, EC: 1.18.-.-
#2: 化合物	ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン分子量: 24.305 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg
#3: 化合物	ChemComp-ADP / ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / ADP 分子量: 427.201 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₅N₅O₁₀P₂ / コメント: ADP, エネルギー貯蔵分子*YM
#4: 化合物	ChemComp-SF4 / IRON/SULFUR CLUSTER 分子量: 351.640 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: Fe₄S₄
#5: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 402 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.09 Å³/Da / 溶媒含有率: 41.01 %
結晶化	温度: 301 K / 手法: capillary batch diffusion / pH: 7.8 詳細: 20-25% PEG 3350, 200mM Magnesium formate, 10mM MgADP, pH 7.8, CAPILLARY BATCH DIFFUSION, temperature 301K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: SSRL / ビームライン: BL9-2 / 波長: 0.98 Å
検出器	タイプ: MARMOSAIC 325 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2008年1月19日 / 詳細: Flat collimating mirror, toroid focusing mirror
放射	モノクロメーター: Double crystal / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.98 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.63→50 Å / Num. all: 133747 / Num. obs: 133747 / % possible obs: 96.4 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 2 % / R_sym value: 0.037 / Net I/σ(I): 40
反射シェル	解像度: 1.63→1.67 Å / 冗長度: 2 % / Mean I/σ(I) obs: 4.6 / Num. unique all: 13313 / R_sym value: 0.242 / % possible all: 93.83

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
HKL-2000		データ収集
PHASER		位相決定
REFMAC	5.2.0019	精密化
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 2NIP

2nip

解像度: 1.63→33.02 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.963 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.95 / SU B: 2.339 / SU ML: 0.049 / TLS residual ADP flag: LIKELY RESIDUAL / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.63 / ESU R: 0.091 / ESU R Free: 0.088 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD
詳細: The Friedel pairs were used in phasing. HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.1986	3544	5 %	RANDOM
R_work	0.17403	-	-	-
obs	0.17529	66727	96.24 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 14.577 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-0.01 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	0.01 Å²	0 Å²
3-	-	-	-0.01 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.63→33.02 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	4112	0	64	402	4578

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.008	0.022	4333
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.001	0.02	2915
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.206	1.984	5898
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	0.874	3	7101
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	6.144	5	552
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	32.46	23.776	196
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	11.914	15	716
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	17.812	15	32
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.152	0.2	666
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.004	0.02	4856
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.001	0.02	900
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined	0.217	0.2	927
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other	0.19	0.2	3092
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined	0.176	0.2	2161
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other	0.082	0.2	2206
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined	0.134	0.2	283
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined	0.026	0.2	1
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined	0.217	0.2	15
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other	0.282	0.2	41
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined	0.267	0.2	23
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	1.434	2	3449
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	0.512	2	1105
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	1.758	3	4328
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	4.595	9	1884
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	6.086	12	1549

Refine LS restraints NCS

Dom-ID: 1 / Auth asym-ID: A / Ens-ID: 1 / 数: 2773 / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

タイプ	Rms dev position (Å)	Weight position
medium positional	0.55	0.5
medium thermal	0.81	2

LS精密化シェル

解像度: 1.63→1.67 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.211	235	-
R_work	0.168	4776	-
obs	-	-	93.86 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.5772	0.0789	0.0051	1.285	-0.1926	0.9499	-0.0303	0.0405	-0.104	-0.1136	0.036	-0.025	0.2216	-0.075	-0.0057	0.0808	-0.0111	0.0018	0.0637	-0.0046	0.1135	2.8636	46.0239	61.0448
2	6.7637	2.6711	1.235	2.7107	-0.1857	2.5367	-0.2667	0.1396	-0.4988	-0.3786	0.0317	-0.6683	0.2204	0.3158	0.235	0.1118	0.0565	0.0876	0.0778	-0.0012	0.294	19.4218	42.2011	57.4529
3	1.8382	1.1512	-0.4954	2.151	-0.4758	0.1527	-0.0646	0.019	-0.1352	-0.0175	0.0476	-0.2018	0.1924	0.0761	0.017	0.0806	0.0266	0.0157	0.0882	0.0008	0.1572	15.0171	49.684	60.8295
4	38.214	2.7235	11.5194	4.0918	1.8939	3.7678	-0.0121	2.1208	0.0469	-0.3769	0.1726	0.073	-0.203	0.1725	-0.1605	0.2737	-0.0908	0.0526	0.3729	-0.0255	0.1495	9.7428	48.9902	46.8863
5	0.8013	0.1495	-0.0719	0.6771	-0.1267	0.6577	0.0093	-0.0084	0.0105	0.0312	0.0216	0.0108	0.0807	-0.0204	-0.031	0.044	-0.0068	-0.0037	0.0844	0.0102	0.1105	1.5639	59.9142	64.6412
6	2.3951	0.6872	-0.6069	2.3461	-1.3983	1.5478	0.0352	0.0937	0.1153	0.0863	0.1378	0.1408	-0.0139	-0.1421	-0.1731	0.0485	-0.0002	-0.0111	0.0824	-0.0047	0.1046	-4.072	60.0615	62.2554
7	1.612	-0.8601	-0.1118	2.9205	-0.6836	1.3094	-0.0566	-0.1789	-0.071	0.193	0.0849	0.3215	0.0046	-0.2147	-0.0284	0.0055	-0.0182	0.006	0.1147	0.0313	0.1154	-13.6059	59.0071	68.0391
8	9.179	-4.2545	2.7626	11.3072	-3.1263	3.5061	-0.3151	-0.3244	-0.2956	0.3977	0.4815	0.7033	0.3954	-0.1052	-0.1664	0.1232	-0.0387	0.0378	-0.028	0.0579	0.0889	-5.6529	36.4372	67.3103
9	3.0079	0.1453	-2.1461	13.9117	-3.1536	2.2003	-0.2233	-0.4192	-0.3684	-0.3653	0.7038	0.6616	1.0991	-1.2789	-0.4805	0.2873	-0.2635	-0.0583	0.3971	0.077	0.236	-14.4656	36.51	62.8358
10	2.1679	-0.9805	0.4097	3.5495	-1.9292	3.2578	0.0723	0.0145	-0.0928	-0.2157	0.0057	0.2079	0.0969	-0.4274	-0.078	0.0764	-0.0405	-0.0397	0.1447	-0.0336	0.1229	-11.0698	50.6026	53.9097
11	1.1888	0.2519	1.812	0.4351	0.1305	3.0895	-0.1251	-0.2185	0.1834	0.0833	-0.0403	0.1111	-0.1332	-0.2465	0.1653	0.0473	0.0226	0.0148	0.1385	-0.0232	0.1359	-7.3298	69.6877	70.8342
12	0.7111	-0.9027	-0.725	1.7836	1.0207	1.7945	-0.0137	-0.039	0.0041	0.3776	-0.0598	0.0053	0.1655	-0.032	0.0735	0.1666	-0.0352	-0.0093	0.0999	-0.0101	0.1017	6.5273	66.1925	90.7947
13	5.0516	1.1153	-2.4657	7.4986	-1.3947	13.8694	0.327	0.1408	0.2811	-0.3461	-0.1588	-0.489	-0.6132	0.7204	-0.1682	0.1331	0.0157	0.1361	0.032	0.0343	0.1896	13.4905	83.595	78.2439
14	0.5155	-0.2425	-0.6604	0.7408	0.9103	3.7805	0.0927	-0.085	0.1326	0.1553	0.0319	-0.1498	-0.2587	0.1595	-0.1246	0.1464	-0.0179	-0.0117	0.0924	-0.014	0.152	11.3852	74.1385	84.6373
15	1.1432	2.9026	-4.8623	7.3746	-12.3058	20.9741	-0.0341	-0.5015	0.262	0.7238	-0.1694	-0.6119	-0.521	1.0853	0.2035	0.2479	-0.0219	-0.0999	0.3346	-0.0877	0.3213	19.3281	73.3961	95.9051
16	0.3581	-0.1738	0.3225	1.3907	0.9135	1.167	0.0035	-0.0829	0	0.3206	-0.0706	-0.088	0.2769	0.086	0.0671	0.1803	0.0059	-0.018	0.1252	0.0108	0.144	12.2924	56.2521	84.2826
17	0.6512	-0.0144	0.5461	2.1195	1.3579	1.9917	-0.0424	0.054	-0.0122	0.3353	0.1941	-0.4679	0.3576	0.5384	-0.1517	0.2483	0.0618	-0.073	0.2501	0.0048	0.2539	21.7269	54.0912	85.257
18	0.8487	-0.9808	-0.1818	2.1249	0.6677	0.3216	-0.0305	-0.1568	-0.3293	0.546	-0.121	0.2495	0.2863	0.0784	0.1515	0.3693	-0.037	0.0587	0.1362	0.0269	0.2211	6.4261	44.7151	91.7624
19	5.0962	0.2071	1.0231	7.5324	-2.8748	8.9086	-0.1259	-0.1438	-0.3811	0.485	-0.0476	0.6842	0.4985	-0.5771	0.1735	0.1452	-0.1078	0.1566	0.1194	-0.0865	0.181	-7.6234	61.7254	94.0036
20	7.4956	-2.6816	1.7395	3.3769	-0.9632	5.8692	-0.1087	-0.4282	-0.2312	0.8691	-0.1905	0.5652	0.5247	-1.0537	0.2992	0.5388	-0.1568	0.1987	0.2905	-0.0873	0.1697	-4.4146	58.6351	103.484
21	0.4506	0.4365	-0.4013	4.4644	2.4079	2.2926	-0.0167	-0.2733	-0.0818	1.4599	0.1002	-0.4288	0.7491	0.4722	-0.0835	0.622	0.0752	-0.1166	0.1383	0.046	0.0705	14.0058	54.3735	101.8801
22	3.1671	1.1308	0.7298	3.8657	-0.2709	1.3026	0.0864	-0.1519	-0.1164	0.4184	-0.0942	-0.2645	0.2313	0.0238	0.0078	0.1947	0.0305	-0.0169	0.0423	0.0391	0.138	12.4271	39.6836	78.5713

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	30 - 88
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	89 - 109
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	110 - 141
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	142 - 147
5	X-RAY DIFFRACTION	5	A	148 - 198
6	X-RAY DIFFRACTION	6	A	199 - 215
7	X-RAY DIFFRACTION	7	A	216 - 238
8	X-RAY DIFFRACTION	8	A	239 - 252
9	X-RAY DIFFRACTION	9	A	253 - 264
10	X-RAY DIFFRACTION	10	A	265 - 276
11	X-RAY DIFFRACTION	11	A	277 - 297
12	X-RAY DIFFRACTION	12	B	30 - 88
13	X-RAY DIFFRACTION	13	B	89 - 100
14	X-RAY DIFFRACTION	14	B	101 - 141
15	X-RAY DIFFRACTION	15	B	142 - 148
16	X-RAY DIFFRACTION	16	B	149 - 188
17	X-RAY DIFFRACTION	17	B	189 - 208
18	X-RAY DIFFRACTION	18	B	209 - 236
19	X-RAY DIFFRACTION	19	B	237 - 250
20	X-RAY DIFFRACTION	20	B	251 - 265
21	X-RAY DIFFRACTION	21	B	266 - 280
22	X-RAY DIFFRACTION	22	B	281 - 297

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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