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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3fs5 | ||||||
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タイトル | Crystal structure of Saccharomyces cerevisiae Ygr203w, a homolog of single-domain rhodanese and Cdc25 phosphatase catalytic domain | ||||||
![]() | Uncharacterized protein YGR203W | ||||||
![]() | TRANSFERASE / rhodanese family | ||||||
機能・相同性 | ![]() thiosulfate sulfurtransferase activity / 加水分解酵素; エステル加水分解酵素; 1価のリン酸エステル加水分解酵素 / phosphatase activity / dephosphorylation / protein tyrosine phosphatase activity / nucleus / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Yeo, H.K. / Lee, J.Y. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of Saccharomyces cerevisiae Ygr203w, a homolog of single-domain rhodanese and Cdc25 phosphatase catalytic domain 著者: Yeo, H.K. / Lee, J.Y. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 39.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 31.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 432.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 434.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 9.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 11.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 17633.992 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: YGR203W / プラスミド: pET21a / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.69 Å3/Da / 溶媒含有率: 54.26 % |
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結晶化 | 温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 詳細: 1.0 - 1.4M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 295 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: MAC Science DIP-2030 / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2000年2月1日 / 詳細: mirrors |
放射 | モノクロメーター: GRAPHITE / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.9→20 Å / Num. obs: 14393 / Observed criterion σ(I): 1 / Rmerge(I) obs: 0.07 / Net I/σ(I): 27.3 |
反射 シェル | 解像度: 1.9→1.97 Å / Rmerge(I) obs: 0.378 / Mean I/σ(I) obs: 4 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.9→20 Å
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拘束条件 |
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