登録情報 データベース : PDB / ID : 3flm 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of menD from E.coli 要素2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexene-1-carboxylate synthase 詳細 キーワード TRANSFERASE / menaquinone biosynthesis protein / Magnesium / Manganese / Menaquinone biosynthesis / Metal-binding / Thiamine pyrophosphate機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexene-1-carboxylic-acid synthase / 2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexene-1-carboxylic-acid synthase activity / menaquinone biosynthetic process / thiamine pyrophosphate binding / manganese ion binding / magnesium ion binding / protein homodimerization activity 類似検索 - 分子機能 Menaquinone biosynthesis protein MenD, middle domain / Middle domain of thiamine pyrophosphate / 2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexene-1-carboxylic-acid synthase / Thiamine pyrophosphate enzyme, N-terminal TPP-binding domain / Thiamine pyrophosphate enzyme, N-terminal TPP binding domain / Thiamine pyrophosphate enzyme, C-terminal TPP-binding / Thiamine pyrophosphate enzyme, C-terminal TPP binding domain / Thiamin diphosphate (ThDP)-binding fold, Pyr/PP domains / TPP-binding domain / Thiamin diphosphate-binding fold ... Menaquinone biosynthesis protein MenD, middle domain / Middle domain of thiamine pyrophosphate / 2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexene-1-carboxylic-acid synthase / Thiamine pyrophosphate enzyme, N-terminal TPP-binding domain / Thiamine pyrophosphate enzyme, N-terminal TPP binding domain / Thiamine pyrophosphate enzyme, C-terminal TPP-binding / Thiamine pyrophosphate enzyme, C-terminal TPP binding domain / Thiamin diphosphate (ThDP)-binding fold, Pyr/PP domains / TPP-binding domain / Thiamin diphosphate-binding fold / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexene-1-carboxylate synthase 類似検索 - 構成要素生物種 Escherichia coli K-12 (大腸菌)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.7 Å 詳細データ登録者 Priyadarshi, A. / Hwang, K.Y. 引用ジャーナル : Biochem.Biophys.Res.Commun. / 年 : 2009タイトル : Structural insights of the MenD from Escherichia coli reveal ThDP affinity.著者 : Priyadarshi, A. / Saleem, Y. / Nam, K.H. / Kim, K.S. / Park, S.Y. / Kim, E.E. / Hwang, K.Y. 履歴 登録 2008年12月19日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : PDBJ改定 1.0 2009年3月24日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 1.2 2012年4月18日 Group : Database references改定 1.3 2021年11月10日 Group : Database references / カテゴリ : database_2 / struct_ref_seq_difItem : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details改定 1.4 2023年11月1日 Group : Data collection / Refinement descriptionカテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model
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