登録情報 | データベース: PDB / ID: 3f5e |
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タイトル | Crystal structure of Toxoplasma gondii micronemal protein 1 bound to 2'F-3'SiaLacNAc1-3 |
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要素 | Micronemal protein 1 |
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キーワード | CELL ADHESION / cellular adhesion / micronemal protein 1 / toxoplasma gondii / carbohydrate / fluorine / Cytoplasmic vesicle / Lectin / Virulence |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
microneme / cytoplasmic vesicle / carbohydrate binding / cell adhesion類似検索 - 分子機能 Actin; Chain A, domain 4 - #70 / Micronemal protein 1 / Micronemal protein 1, galectin-like domain / MIC1, C-terminal superfamily / Toxoplasma gondii micronemal protein 1 TgMIC1 / Micronemal adhesive repeat, sialic-acid binding / Sialic-acid binding micronemal adhesive repeat / Actin; Chain A, domain 4 / Alpha-Beta Complex / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Toxoplasma gondii (トキソプラズマ) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2 Å |
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データ登録者 | Garnett, J.A. / Liu, Y. / Feizi, T. / Matthews, S.J. |
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引用 | ジャーナル: Protein Sci. / 年: 2009タイトル: Detailed insights from microarray and crystallographic studies into carbohydrate recognition by microneme protein 1 (MIC1) of Toxoplasma gondii. 著者: Garnett, J.A. / Liu, Y. / Leon, E. / Allman, S.A. / Friedrich, N. / Saouros, S. / Curry, S. / Soldati-Favre, D. / Davis, B.G. / Feizi, T. / Matthews, S. #1: ジャーナル: Embo J. / 年: 2007タイトル: Atomic resolution insight into host cell recognition by Toxoplasma gondii. 著者: Blumenschein, T.M. / Friedrich, N. / Childs, R.A. / Saouros, S. / Carpenter, E.P. / Campanero-Rhodes, M.A. / Simpson, P. / Chai, W. / Koutroukides, T. / Blackman, M.J. / Feizi, T. / Soldati- ...著者: Blumenschein, T.M. / Friedrich, N. / Childs, R.A. / Saouros, S. / Carpenter, E.P. / Campanero-Rhodes, M.A. / Simpson, P. / Chai, W. / Koutroukides, T. / Blackman, M.J. / Feizi, T. / Soldati-Favre, D. / Matthews, S. |
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履歴 | 登録 | 2008年11月3日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2009年7月28日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Source and taxonomy / Version format compliance |
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改定 1.2 | 2016年2月17日 | Group: Derived calculations / Non-polymer description |
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改定 2.0 | 2020年7月29日 | Group: Atomic model / Data collection ...Atomic model / Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_struct_special_symmetry / struct_asym / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _pdbx_struct_special_symmetry.label_asym_id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation |
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改定 2.1 | 2023年9月6日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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改定 2.2 | 2023年11月15日 | Group: Data collection / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / Item: _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_2 |
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