PDB-3em6: Crystal structure of I50L/A71V mutant of hiv-1 protease in comple...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3em6

タイトル

Crystal structure of I50L/A71V mutant of hiv-1 protease in complex with inhibitor darunavir

要素

Protease

キーワード

HYDROLASE / protease inhibitor / hyper susceptibility / drug resistance / hiv / darunavir / AIDS / Protease

機能・相同性

機能・相同性情報

HIV-1 retropepsin / symbiont-mediated activation of host apoptosis / retroviral ribonuclease H / exoribonuclease H / exoribonuclease H activity / host multivesicular body / DNA integration / viral genome integration into host DNA / RNA-directed DNA polymerase / establishment of integrated proviral latency ...
類似検索 - 分子機能

Reverse transcriptase connection / Reverse transcriptase connection domain / Reverse transcriptase thumb / Reverse transcriptase thumb domain / Integrase Zinc binding domain / Zinc finger integrase-type profile. / Integrase-like, N-terminal / Integrase DNA binding domain / Integrase, C-terminal domain superfamily, retroviral / Integrase, N-terminal zinc-binding domain ...
類似検索 - ドメイン・相同性

生物種

HIV-1 M:B_ARV2/SF2 (ヒト免疫不全ウイルス)

手法

X線回折 / 解像度: 2.1 Å

データ登録者

Royer, C.J. / King, N.M. / Prabu-Jeyabalan, M. / Ng, C. / Nalivaika, E.A. / Schiffer, C.A.

引用

ジャーナル: To be Published
タイトル: Kinetic and structural studies on atazanavir specific I50L drug-resistant HIV-1 protease mutant.
著者: Prabu-Jeyabalan, M. / Ng, C. / King, N.M. / Bandaranayake, R. / Nalivaika, E.A. / Schiffer, C.A.

履歴

登録	2008年9月23日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2009年9月1日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年7月13日	Group: Advisory / Version format compliance
改定 1.2	2017年10月25日	Group: Refinement description / カテゴリ: software
改定 1.3	2021年10月20日	Group: Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: chem_comp / database_2 ...chem_comp / database_2 / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI ..._chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
改定 1.4	2023年9月6日	Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model
改定 1.5	2024年3月13日	Group: Source and taxonomy / Structure summary / カテゴリ: entity / pdbx_entity_src_syn / Item: _entity.details

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	3em6.cif.gz	56.1 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb3em6.ent.gz	41.5 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	3em6.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	3em6_validation.pdf.gz	817.2 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	3em6_full_validation.pdf.gz	819.2 KB	表示
XML形式データ	3em6_validation.xml.gz	11.3 KB	表示
CIF形式データ	3em6_validation.cif.gz	15 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/em/3em6 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/em/3em6	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	1f7aS 3em3 3em4 S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	3el9-d 1b6l-d 1mtr-d 3b7v-d 6c8y-d 1tsq-d 3sac-d 2qnn-d 6oxo-d 3o9c-d 4eq0-d 3o9h-d 6dv4-d 3i7e-d 5kr2-2 2bpx-d 1a30-d 2r3w-d 6dgz-d 4rvx-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#163 - 2013年7月 HIVカプシド (HIV Capsid) 類似性 (2) #6 - 2000年6月 HIV-1タンパク質分解酵素 (HIV-1 Protease) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Protease

B: Protease

ヘテロ分子

22.9 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	51.140, 57.891, 61.364
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

#1: タンパク質	Protease / Retropepsin / PR 分子量: 10829.816 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP residues 491-589 / 変異: Q7K, I50L, A71V / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) HIV-1 M:B_ARV2/SF2 (ヒト免疫不全ウイルス) 株: HXB2 / 遺伝子: gag-pol, HIV-1 subtype B / プラスミド: pXC35 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): TAP106 / 参照: UniProt: P03369, HIV-1 retropepsin
#2: 化合物	ChemComp-017 / (3R,3AS,6AR)-HEXAHYDROFURO[2,3-B]FURAN-3-YL(1S,2R)-3-[[(4-AMINOPHENYL)SULFONYL](ISOBUTYL)AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXYPROPYLCARBAMATE / Darunavir / TMC114 / UIC-94017 / ダルナビル分子量: 547.664 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₇H₃₇N₃O₇S / 詳細: Darunavir / コメント: 薬剤, 抗レトロウイルス剤*YM
#3: 化合物	ChemComp-PO4 / PHOSPHATE ION / ホスファ-ト分子量: 94.971 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: PO₄
#4: 化合物	ChemComp-ACT / ACETATE ION / 酢酸イオン分子量: 59.044 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₃O₂
#5: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 108 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.1 Å³/Da / 溶媒含有率: 41.34 %
結晶化	温度: 300 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.2 詳細: pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K

-
データ収集

回折

平均測定温度: 200 K

放射光源

由来:

回転陽極 / タイプ: RIGAKU / 波長: 1.5418 Å

検出器

タイプ: RIGAKU RAXIS IV / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2004年3月28日 / 詳細: Yale Mirrors

放射

モノクロメーター: Yale Mirrors / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 1.5418 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2.1→50 Å / Num. obs: 10762 / % possible obs: 96.6 % / Observed criterion σ(F): 0 / 冗長度: 3.2 % / R_merge(I) obs: 0.092 / Χ²: 1.052 / Net I/σ(I): 11.443

反射シェル

解像度 (Å)	R_merge(I) obs	Num. unique all	Χ²	Diffraction-ID	% possible all
2.1-2.18	0.461	1027	1.127	1	95.6
2.18-2.26	0.403	1056	1.194	1	96.8
2.26-2.37	0.342	1046	1.146	1	96.9
2.37-2.49	0.291	1068	1.131	1	97.1
2.49-2.65	0.223	1066	1.136	1	96.7
2.65-2.85	0.175	1076	1.168	1	97.2
2.85-3.14	0.117	1068	1.057	1	97.2
3.14-3.59	0.068	1099	0.997	1	97.4
3.59-4.52	0.042	1114	0.827	1	97.6
4.52-50	0.036	1142	0.78	1	94

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
DENZO		データ削減
SCALEPACK		データスケーリング
REFMAC	5.2.0005	精密化
PDB_EXTRACT	3.006	データ抽出
AMoRE		位相決定

精密化

開始モデル: 1F7A

1f7a

解像度: 2.1→42.26 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.953 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.927 / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 0.5 / SU B: 11.468 / SU ML: 0.154 / TLS residual ADP flag: LIKELY RESIDUAL / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / σ(I): 0 / ESU R: 0.276 / ESU R Free: 0.209 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.24	507	4.7 %	RANDOM
R_work	0.186	-	-	-
obs	0.188	10740	96.79 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK

原子変位パラメータ

B_iso max: 48.64 Å² / B_iso mean: 6.32 Å² / B_iso min: 2 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-0.4 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	-0.46 Å²	0 Å²
3-	-	-	0.86 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.1→42.26 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	1458	0	75	108	1641

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.004	0.022	1590
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.001	0.02	1519
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.151	2.028	2179
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	0.825	3	3516
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	6.315	5	202
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	44.145	25	52
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	13.456	15	241
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	14.465	15	7
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.067	0.2	258
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.006	0.02	1737
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.007	0.02	287
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined	0.178	0.2	244
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other	0.182	0.2	1526
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined	0.166	0.2	715
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other	0.082	0.2	952
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined	0.165	0.2	91
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined	0.151	0.2	12
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other	0.197	0.2	39
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined	0.18	0.2	13
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	0.439	1.5	1286
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	0.062	1.5	418
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	0.485	2	1616
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	0.722	3	655
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	1.056	4.5	563

LS精密化シェル

解像度: 2.1→2.154 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.291	31	-
R_work	0.234	721	-
all	-	752	-
obs	-	-	95.8 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.5811	1.222	1.683	3.0934	0.1698	3.5737	-0.0594	0.2524	0.1524	-0.1122	0.0205	0.0417	-0.1162	-0.0352	0.0389	-0.0261	-0.0147	-0.0226	-0.0166	0.03	-0.0698	20.3652	8.6493	2.362
2	17.4901	-2.1527	3.198	4.7047	0.298	9.3934	0.1962	0.2455	-0.9111	-0.3082	0.1465	0.3366	0.7618	0.0199	-0.3427	0.0431	-0.0219	-0.0138	-0.0312	-0.0487	-0.0368	20.7545	-4.7785	2.524
3	11.1468	1.7059	4.4815	5.7396	3.2844	3.0343	0.3319	-0.404	0.2241	0.225	-0.1849	0.5232	0.0161	0.1627	-0.147	-0.0488	0.0178	0.0234	-0.0807	-0.0142	-0.0777	19.4604	12.2305	14.9645
4	16.6113	-4.5753	3.4494	6.3865	1.5033	5.4157	0.0845	0.2532	-0.0167	-0.125	0.0966	-0.7027	-0.0903	0.4293	-0.1811	-0.0235	-0.0036	0.047	-0.0573	0.0134	-0.0497	38.6161	-2.1179	6.991
5	3.475	-1.2721	-0.4403	1.1304	-0.1048	0.1622	0.0298	0.0157	-0.0304	-0.0409	-0.065	0.1822	0.0765	0.06	0.0352	-0.0112	-0.0127	-0.0066	-0.0221	-0.005	-0.0709	26.5549	1.276	12.1827
6	7.8498	-1.0099	-1.6413	8.4637	3.5289	4.8814	-0.0136	0.0991	0.017	0.0789	0.3723	-0.5267	0.3419	0.5033	-0.3587	-0.0564	0.0099	-0.0162	-0.0478	0.0534	-0.0822	39.945	-1.9549	20.182
7	21.1942	3.5427	-9.5554	0.6538	-2.173	9.6857	1.1698	-1.2277	1.4643	1.0468	-0.6927	0.2245	0.4792	-0.342	-0.4771	-0.0832	0.0613	-0.0449	-0.0602	-0.0472	0.1712	2.6859	7.0249	14.0493
8	7.6114	1.0594	-1.1384	4.1071	-0.891	0.3058	-0.059	-0.1834	0.2383	0.0573	0.0715	0.1656	0.0214	0.3192	-0.0124	-0.0405	0.003	-0.0237	-0.0628	0.0078	-0.0381	13.9354	1.5557	12.1205
9	12.6138	-1.1458	1.9137	4.5972	0.3594	0.3536	0.296	-0.5711	0.1338	-0.0056	-0.2784	0.4695	-0.3339	-0.5853	-0.0177	-0.0343	-0.003	0.0205	0.0862	0.0804	-0.0046	0.6769	-5.1671	17.458
10	18.2174	3.183	4.7565	0.5605	0.9441	4.1845	0.0814	-0.8984	0.2194	0.3948	-0.2071	-0.0195	0.231	-0.2994	0.1257	-0.0011	-0.0127	0.0509	-0.0686	-0.0013	-0.0961	26.5612	-1.8445	26.5017
11	15.327	5.5278	4.0896	12.76	1.589	1.3378	0.2628	-0.1549	-0.1445	0.1161	-0.0438	0.104	-0.1679	0.0962	-0.2191	-0.0511	0.0182	0.0293	-0.0587	0.0199	-0.1637	14.6925	-10.0908	19.6378
12	6.6488	4.0966	-4.1405	5.3755	-9.3411	18.7471	0.1115	-0.3504	0.2451	0.1727	-0.229	-0.5182	0.2446	0.2985	0.1175	-0.1186	-0.0144	-0.0603	-0.032	0.0012	-0.0862	39.0835	3.8647	20.9134
13	12.675	-1.374	10.255	10.021	-4.7728	32.3048	0.1075	0.6425	-0.1404	-0.2295	0.1487	-0.0995	-0.4448	0.2504	-0.2562	-0.0929	0.0198	0.0985	-0.1504	-0.0214	-0.0524	37.2797	4.6583	6.4503
14	3.5378	0.5463	1.1143	1.5691	0.3714	0.3778	-0.0644	-0.0476	0.2441	-0.1369	0.0928	-0.2077	0.0833	0.1843	-0.0284	-0.0112	-0.0018	-0.0288	-0.0763	-0.011	-0.0624	36.1254	7.0716	12.773
15	10.3546	-4.4935	5.4161	10.4683	-8.3152	7.0098	0.2025	-0.0905	-0.4315	-0.0221	0.107	0.2159	0.0579	0.1397	-0.3094	-0.0409	-0.0336	-0.0024	-0.0529	0.0083	0.0705	1.8413	-7.5925	12.6305
16	6.5434	10.0803	-7.2437	28.2022	-10.1503	8.0992	0.2781	-0.3976	0.3853	-0.4363	-0.4938	0.578	-0.1339	0.1106	0.2157	-0.0365	0.0143	-0.0994	-0.0065	0.0529	0.0649	3.0933	5.9842	7.2375
17	3.4326	3.5425	-0.0329	3.9361	0.8366	2.706	-0.0781	0.4145	-0.0208	-0.2466	0.2186	0.3409	-0.1099	0.1408	-0.1405	-0.0486	-0.0276	0.0058	-0.026	0.0011	0.0155	4.4116	-0.6932	6.9984
18	2.9938	2.0965	1.295	2.5368	-0.8952	3.599	-0.0778	-0.0775	-0.1552	0.0783	0.0367	-0.0256	0.1905	-0.1396	0.0411	-0.0159	0.0221	0.0089	-0.0283	0.0153	-0.0754	29.4827	-3.9695	16.1196
19	6.5764	4.7293	-5.5817	3.4337	-3.8925	5.1882	0.2272	-0.289	0.2657	0.3645	0.0068	0.4317	-0.4267	0.0384	-0.234	-0.0067	0.0024	0.0454	-0.0103	0.0032	0.0399	10.8383	-0.0892	18.7552
20	2.2979	-0.7552	-0.6213	4.6714	1.5068	4.4132	0.0078	0.0507	0.2175	0.1115	-0.014	-0.1246	0.0146	-0.0824	0.0062	-0.0226	-0.0093	-0.002	-0.04	0.0194	-0.0783	28.9674	9.194	10.9977
21	0.0012	-0.014	0.0463	0.1581	-0.5246	1.741	0.0044	0.1682	-0.2814	-0.1009	0.229	0.3163	0.148	-0.2195	-0.2334	0.0011	-0.0288	-0.06	0.0399	0.0301	0.0221	11.5591	0.4153	4.4554
22	6.8593	7.6803	3.8399	9.8049	4.6356	2.3487	0.071	0.0426	0.088	0.3605	0.1112	0.2381	0.2675	0.0473	-0.1822	-0.004	-0.0361	-0.0017	0.0177	-0.0027	0.0057	19.9786	-0.8618	17.21

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	1 - 5
2	X-RAY DIFFRACTION	1	A	94 - 99
3	X-RAY DIFFRACTION	1	B	1 - 5
4	X-RAY DIFFRACTION	1	B	94 - 99
5	X-RAY DIFFRACTION	2	A	6 - 10
6	X-RAY DIFFRACTION	3	B	6 - 10
7	X-RAY DIFFRACTION	4	A	11 - 20
8	X-RAY DIFFRACTION	5	A	21 - 32
9	X-RAY DIFFRACTION	6	A	33 - 43
10	X-RAY DIFFRACTION	7	B	11 - 20
11	X-RAY DIFFRACTION	8	B	21 - 32
12	X-RAY DIFFRACTION	9	B	33 - 43
13	X-RAY DIFFRACTION	10	A	44 - 56
14	X-RAY DIFFRACTION	11	B	44 - 56
15	X-RAY DIFFRACTION	12	A	57 - 62
16	X-RAY DIFFRACTION	13	A	63 - 68
17	X-RAY DIFFRACTION	14	A	69 - 76
18	X-RAY DIFFRACTION	15	B	57 - 62
19	X-RAY DIFFRACTION	16	B	63 - 68
20	X-RAY DIFFRACTION	17	B	69 - 76
21	X-RAY DIFFRACTION	18	A	77 - 85
22	X-RAY DIFFRACTION	19	B	77 - 85
23	X-RAY DIFFRACTION	20	A	86 - 93
24	X-RAY DIFFRACTION	21	B	86 - 93
25	X-RAY DIFFRACTION	22	A	200

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)