登録情報 | データベース: PDB / ID: 3dsc |
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タイトル | Crystal structure of P. furiosus Mre11 DNA synaptic complex |
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要素 | - DNA (5'-D(P*DCP*DAP*DCP*DAP*DAP*DGP*DCP*DTP*DTP*DTP*DTP*DGP*DCP*DTP*DTP*DGP*DTP*DGP*DAP*DC)-3')
- DNA double-strand break repair protein mre11
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キーワード | Hydrolase/DNA / Protein-DNA complex / Double Helix / Nuclease / DNA damage / DNA repair / Endonuclease / Exonuclease / Hydrolase / Manganese / Metal-binding / Hydrolase-DNA COMPLEX |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
DNA exonuclease activity / DNA end binding / Y-form DNA binding / DNA double-strand break processing / 3'-5' exonuclease activity / DNA endonuclease activity / double-strand break repair / manganese ion binding / endonuclease activity / 加水分解酵素; エステル加水分解酵素 / identical protein binding類似検索 - 分子機能 DNA double-strand break repair nuclease / DNA double-strand break repair protein Mre11, archaea-type / Mre11 nuclease, N-terminal metallophosphatase domain / Translation Initiation Factor IF3 / Metallo-dependent phosphatases / Purple Acid Phosphatase; chain A, domain 2 / Calcineurin-like phosphoesterase domain, ApaH type / Calcineurin-like phosphoesterase / Metallo-dependent phosphatase-like / 4-Layer Sandwich ...DNA double-strand break repair nuclease / DNA double-strand break repair protein Mre11, archaea-type / Mre11 nuclease, N-terminal metallophosphatase domain / Translation Initiation Factor IF3 / Metallo-dependent phosphatases / Purple Acid Phosphatase; chain A, domain 2 / Calcineurin-like phosphoesterase domain, ApaH type / Calcineurin-like phosphoesterase / Metallo-dependent phosphatase-like / 4-Layer Sandwich / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 DNA / DNA (> 10) / DNA double-strand break repair protein Mre11類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_archaea.gif) Pyrococcus furiosus (古細菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.7 Å |
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データ登録者 | Williams, R.S. / Moncalian, G. / Shin, D.S. / Tainer, J.A. |
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引用 | ジャーナル: Cell(Cambridge,Mass.) / 年: 2008 タイトル: Mre11 dimers coordinate DNA end bridging and nuclease processing in double-strand-break repair. 著者: Williams, R.S. / Moncalian, G. / Williams, J.S. / Yamada, Y. / Limbo, O. / Shin, D.S. / Groocock, L.M. / Cahill, D. / Hitomi, C. / Guenther, G. / Moiani, D. / Carney, J.P. / Russell, P. / Tainer, J.A. |
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履歴 | 登録 | 2008年7月11日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2008年10月14日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Advisory / Version format compliance |
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改定 1.2 | 2017年1月11日 | Group: Other |
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改定 1.3 | 2020年2月26日 | Group: Advisory / Data collection / Database references カテゴリ: pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / reflns / struct_ref_seq_dif Item: _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs / _struct_ref_seq_dif.details |
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改定 1.4 | 2023年8月30日 | Group: Advisory / Data collection ...Advisory / Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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