登録情報 | データベース: PDB / ID: 3dp5 |
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タイトル | Crystal structure of Geobacter sulfurreducens OmcF with N-terminal Strep-tag II |
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要素 | Cytochrome c family protein |
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キーワード | ELECTRON TRANSPORT / c-type cytochrome / Fe SAD phasing / dissimilatory metal reduction / Geobacter sulfurreducens |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
plasma membrane-derived thylakoid lumen / electron transfer activity / iron ion binding / heme binding類似検索 - 分子機能 Cytochrome c6 / Cytochrome C oxidase, cbb3-type, subunit III / Cytochrome c-like domain / Cytochrome Bc1 Complex; Chain D, domain 2 / Cytochrome c family profile. / Cytochrome c-like domain / Cytochrome c-like domain superfamily / Prokaryotic membrane lipoprotein lipid attachment site profile. / Orthogonal Bundle / Mainly Alpha類似検索 - ドメイン・相同性 HEME C / Lipoprotein cytochrome c, 1 heme-binding site類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Geobacter sulfurreducens (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / 単波長異常分散 / 解像度: 1.86 Å |
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データ登録者 | Lukat, P. / Hoffmann, M. / Einsle, O. |
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引用 | ジャーナル: ACTA CRYSTALLOGR.,SECT.D / 年: 2008 タイトル: Crystal packing of the c(6)-type cytochrome OmcF from Geobacter sulfurreducens is mediated by an N-terminal Strep-tag II 著者: Lukat, P. / Hoffmann, M. / Einsle, O. |
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履歴 | 登録 | 2008年7月7日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2008年9月2日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 2.0 | 2019年10月2日 | Group: Atomic model / Data collection ...Atomic model / Data collection / Derived calculations / Non-polymer description / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / entity / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.formula / _chem_comp.formula_weight / _chem_comp.id / _chem_comp.name / _chem_comp.pdbx_synonyms / _entity.formula_weight / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.comp_id / _pdbx_entity_nonpoly.name / _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id / _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id |
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