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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3bpq | ||||||
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タイトル | Crystal Structure of RelB-RelE antitoxin-toxin complex from Methanococcus jannaschii | ||||||
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![]() | TOXIN / protein toxin-antitoxin complex | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Francuski, D. / Saenger, W. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of the antitoxin-toxin protein complex RelB-RelE from Methanococcus jannaschii 著者: Francuski, D. / Saenger, W. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 64.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 48.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 438.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 441.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 11.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 15.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 6323.375 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 株: DSM2661 / 遺伝子: relB3, relB, MJ1103.1 / プラスミド: pET21 / 発現宿主: ![]() ![]() #2: タンパク質 | 分子量: 10515.409 Da / 分子数: 2 / Mutation: R62S / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 株: DSM2661 / 遺伝子: MJ1103, relE, relE3 / プラスミド: pET21 / 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: Q58503, 加水分解酵素; エステル加水分解酵素 #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.67 Å3/Da / 溶媒含有率: 53.9 % |
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結晶化 | 温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 5.5 詳細: 20%MPD, 0.1M Bis-Tris pH5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MAR CCD 165 mm / 検出器: CCD / 日付: 2006年7月12日 / 詳細: mirrors |
放射 | モノクロメーター: Si-111 crystal / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.94905 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.13→50 Å / Num. obs: 19952 / % possible obs: 99.6 % / Observed criterion σ(I): 3 / 冗長度: 4.2 % / Rmerge(I) obs: 0.05 / Net I/σ(I): 15.4 |
反射 シェル | 解像度: 2.13→2.18 Å / 冗長度: 4.1 % / Rmerge(I) obs: 0.421 / Mean I/σ(I) obs: 3.13 / Num. unique all: 1332 / % possible all: 98.9 |
-位相決定
位相決定 | 手法: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Phasing set |
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Phasing MIR der | Native set-ID: 1 / 解像度: 2.13→32.95 Å
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Phasing MIR der shell |
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