PDB-3bjq: CRYSTAL STRUCTURE OF A PHAGE-RELATED PROTEIN (BB3626) FROM BORDET...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3bjq

タイトル

CRYSTAL STRUCTURE OF A PHAGE-RELATED PROTEIN (BB3626) FROM BORDETELLA BRONCHISEPTICA RB50 AT 2.05 A RESOLUTION

要素

Phage-related protein

キーワード

VIRAL PROTEIN / PHAGE-RELATED PROTEIN / STRUCTURAL GENOMICS / JOINT CENTER FOR STRUCTURAL GENOMICS / JCSG / PROTEIN STRUCTURE INITIATIVE / PSI-2

機能・相同性

phage-related protein like fold / phage-related protein like domain / Major capsid protein GpE / Phage major capsid protein E / Alpha-Beta Complex / Alpha Beta / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein

機能・相同性情報

生物種

Bordetella bronchiseptica RB50 (気管支敗血症菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

多波長異常分散 / 解像度: 2.05 Å

データ登録者

Joint Center for Structural Genomics (JCSG)

引用

ジャーナル: To be published
タイトル: Crystal structure of phage-related protein (NP_890161.1) from Bordetella bronchiseptica at 2.05 A resolution
著者: Joint Center for Structural Genomics (JCSG)

履歴

登録	2007年12月4日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2007年12月18日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年7月13日	Group: Advisory / Version format compliance
改定 1.2	2011年9月7日	Group: Other
改定 1.3	2017年10月25日	Group: Refinement description / カテゴリ: software / Item: _software.classification / _software.name
改定 1.4	2019年7月24日	Group: Data collection / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: software / struct_conn Item: _software.classification / _software.contact_author ..._software.classification / _software.contact_author / _software.contact_author_email / _software.language / _software.location / _software.name / _software.type / _software.version / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag
改定 1.5	2023年1月25日	Group: Database references / Derived calculations / カテゴリ: database_2 / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

Remark 999

SEQUENCE THE CONSTRUCT WAS EXPRESSED WITH A PURIFICATION TAG MGSDKIHHHHHHENLYFQG. THE TAG WAS ...

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	3bjq.cif.gz	1.1 MB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb3bjq.ent.gz	971.7 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	3bjq.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bj/3bjq ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bj/3bjq	HTTPS FTP

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関連構造データ

類似構造データ	20659 5jmn-d 6q4o-d 4dej-d 21447 0784 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索
その他のデータベース	TargetDB: 373379

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: Phage-related protein

B: Phage-related protein

C: Phage-related protein

D: Phage-related protein

E: Phage-related protein

F: Phage-related protein

G: Phage-related protein

H: Phage-related protein

I: Phage-related protein

J: Phage-related protein

ヘテロ分子

354 kDa, 10 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	93.390, 188.320, 105.150
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 106.600, 90.000
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:
NCSドメイン領域:

Ens-ID: 1 / Refine code: 2

Dom-ID	Component-ID	Beg label comp-ID	End label comp-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	VAL	LYS	A	A	12 - 60	13 - 61
2	1	VAL	LYS	B	B	12 - 60	13 - 61
3	1	VAL	LYS	C	C	12 - 60	13 - 61
4	1	VAL	LYS	D	D	12 - 60	13 - 61
5	1	VAL	LYS	E	E	12 - 60	13 - 61
6	1	VAL	LYS	F	F	12 - 60	13 - 61
7	1	VAL	LYS	G	G	12 - 60	13 - 61
8	1	VAL	LYS	H	H	12 - 60	13 - 61
9	1	VAL	LYS	I	I	12 - 60	13 - 61
10	1	VAL	LYS	J	J	12 - 60	13 - 61
11	2	GLU	CYS	A	A	75 - 189	76 - 190
12	2	GLU	CYS	B	B	75 - 189	76 - 190
13	2	GLU	CYS	C	C	75 - 189	76 - 190
14	2	GLU	CYS	D	D	75 - 189	76 - 190
15	2	GLU	CYS	E	E	75 - 189	76 - 190
16	2	GLU	CYS	F	F	75 - 189	76 - 190
17	2	GLU	CYS	G	G	75 - 189	76 - 190
18	2	GLU	CYS	H	H	75 - 189	76 - 190
19	2	GLU	CYS	I	I	75 - 189	76 - 190
20	2	GLU	CYS	J	J	75 - 189	76 - 190
21	3	ILE	ARG	A	A	209 - 227	210 - 228
22	3	ILE	ARG	B	B	209 - 227	210 - 228
23	3	ILE	ARG	C	C	209 - 227	210 - 228
24	3	ILE	ARG	D	D	209 - 227	210 - 228
25	3	ILE	ARG	E	E	209 - 227	210 - 228
26	3	ILE	ARG	F	F	209 - 227	210 - 228
27	3	ILE	ARG	G	G	209 - 227	210 - 228
28	3	ILE	ARG	H	H	209 - 227	210 - 228
29	3	ILE	ARG	I	I	209 - 227	210 - 228
30	3	ILE	ARG	J	J	209 - 227	210 - 228
31	4	GLY	PRO	A	A	237 - 313	238 - 314
32	4	GLY	PRO	B	B	237 - 313	238 - 314
33	4	GLY	PRO	C	C	237 - 313	238 - 314
34	4	GLY	PRO	D	D	237 - 313	238 - 314
35	4	GLY	PRO	E	E	237 - 313	238 - 314
36	4	GLY	PRO	F	F	237 - 313	238 - 314
37	4	GLY	PRO	G	G	237 - 313	238 - 314
38	4	GLY	PRO	H	H	237 - 313	238 - 314
39	4	GLY	PRO	I	I	237 - 313	238 - 314
40	4	GLY	PRO	J	J	237 - 313	238 - 314

#1: タンパク質	Phage-related protein 分子量: 34941.262 Da / 分子数: 10 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Bordetella bronchiseptica RB50 (気管支敗血症菌) 生物種: Bordetella bronchiseptica / 株: RB50 / NCTC 13252 / 遺伝子: NP_890161.1, BB3626 / プラスミド: speedET / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): HK100 / 参照: UniProt: Q7WDF2, UniProt: A0A0H3LS71*PLUS
#2: 化合物	... ChemComp-PG4 / TETRAETHYLENE GLYCOL / テトラエチレングリコ-ル分子量: 194.226 Da / 分子数: 22 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₈H₁₈O₅ / コメント: 沈殿剤*YM
#3: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド分子量: 35.453 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 1336 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 2

-
試料調製

結晶

ID	マシュー密度 (Å³/Da)	溶媒含有率 (%)	解説
1	2.54	51.5	THE STRUCTURE WAS SOLVED BY MAD METHOD USING ANOTHER CRYSTAL AT LOWER RESOLUTION. THE CRYSTAL USED FOR REFINEMENT IS NOT ISOMORPHOUS TO THE CRYSTAL USED FOR PHASING. RIGID BODY REFINEMENT OF THE INITIAL MAD MODEL WAS SUFFICIENT TO ORIENT THE MONOMERS IN THE SET USED FOR REFINEMENT.
2

結晶化

温度 (K)	Crystal-ID	手法	pH	詳細
277	1	蒸気拡散法, シッティングドロップ法	5.79	NANODROP, 25.1% PEG 200, 5.0% PEG 3000, 0.1M MES pH 5.79, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
277	2	蒸気拡散法, シッティングドロップ法	6	NANODROP, 30.0% PEG 200, 5.0% PEG 3000, 0.1M MES pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K

-
データ収集

回折

ID	平均測定温度 (K)	Crystal-ID
1	100	1
2	100	2

放射光源

由来	サイト	ビームライン	ID	波長 (Å)
シンクロトロン	APS	23-ID-D	1	0.9184
シンクロトロン	SSRL	BL11-1	2	0.97916, 0.91162

検出器

タイプ	ID	検出器	日付	詳細
MARMOSAIC 300 mm CCD	1	CCD	2007年10月25日	Adjustable focusing mirrors in K-B geometry
MARMOSAIC 325 mm CCD	2	CCD	2007年4月9日	Flat mirror (vertical focusing)

放射

ID	モノクロメーター	プロトコル	単色(M)・ラウエ(L)	散乱光タイプ	Wavelength-ID
1	Si(111) Double crystal	SINGLE WAVELENGTH	M	x-ray	1
2	Single crystal Si(111) bent (horizontal focusing)	MAD	M	x-ray	1

放射波長

ID	波長 (Å)	相対比
1	0.9184	1
2	0.97916	1
3	0.91162	1

反射

解像度: 2.05→49.147 Å / Num. obs: 216795 / % possible obs: 99.7 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 5.49 % / B_iso Wilson estimate: 33.52 Å² / R_merge(I) obs: 0.091 / Net I/σ(I): 11.24

反射シェル

Diffraction-ID: 1,2

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Mean I/σ(I) obs	Num. measured obs	Num. unique obs	% possible all
2.05-2.08	3.78	0.847	1.7	34704	9184	99.3
2.08-2.15		0.712	1.9	74779	19575	99.8
2.15-2.24		0.58	2.4	83063	21729	99.8
2.24-2.34		0.463	3	77523	20338	99.6
2.34-2.47		0.342	4	83466	21757	99.8
2.47-2.62		0.258	5.2	77071	20062	99.8
2.62-2.82		0.3	7.6	121653	20550	99.8
2.82-3.1		0.227	11.3	154602	20614	99.8
3.1-3.55		0.114	18.4	161091	20939	99.8
3.55-4.47		0.058	27.9	161250	20942	99.8
4.47-49.147		0.046	34.1	160172	21105	99.7

-
位相決定

位相決定	手法: 多波長異常分散

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.2.0019	精密化
PHENIX		精密化
SHELX		位相決定
MolProbity	3beta29	モデル構築
XSCALE		データスケーリング
PDB_EXTRACT	3	データ抽出
MAR345	CCD	データ収集
XDS		データ削減
MOSFLM		データ削減
SCALA		データスケーリング
SHARP		位相決定
SHELXD		位相決定

精密化

構造決定の手法:

多波長異常分散 / 解像度: 2.05→49.147 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.964 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.941 / SU B: 9.972 / SU ML: 0.138 / TLS residual ADP flag: LIKELY RESIDUAL / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.176 / ESU R Free: 0.159 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD
詳細: 1. HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS. 2. A MET-INHIBITION PROTOCOL WAS USED FOR SELENOMETHIONINE INCORPORATION DURING PROTEIN EXPRESSION. THE OCCUPANCY OF THE SE ATOMS IN THE ...

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.227	3532	1.6 %	THIN SHELLS
R_work	0.186	-	-	-
obs	0.186	216789	100 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 43.017 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	1.64 Å²	0 Å²	0.1 Å²
2-	-	-1.2 Å²	0 Å²
3-	-	-	-0.39 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.05→49.147 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	22752	0	262	1336	24350

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.013	0.022	23670
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.002	0.02	16050
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.399	1.975	32156
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	0.892	3	39238
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	4.751	5	2983
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	32.124	23.992	967
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	12.783	15	3724
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	11.565	15	134
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.08	0.2	3556
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.005	0.02	26153
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.002	0.02	4549
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined	0.204	0.2	4583
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other	0.193	0.2	16385
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined	0.178	0.2	11427
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other	0.087	0.2	12349
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined	0.157	0.2	1368
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other	0.073	0.2	1
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined	0.165	0.2	18
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other	0.216	0.2	68
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined	0.213	0.2	19
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	1.491	3	15298
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	0.417	3	5976
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	2.337	5	23943
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	4.244	8	9720
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	5.874	11	8193

Refine LS restraints NCS

Ens-ID: 1 / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

Dom-ID	Auth asym-ID	数	タイプ	Rms dev position (Å)	Weight position
1	A	1497	TIGHT POSITIONAL	0.1	0.1
2	B	1497	TIGHT POSITIONAL	0.13	0.1
3	C	1497	TIGHT POSITIONAL	0.09	0.1
4	D	1497	TIGHT POSITIONAL	0.12	0.1
5	E	1497	TIGHT POSITIONAL	0.1	0.1
6	F	1497	TIGHT POSITIONAL	0.1	0.1
7	G	1497	TIGHT POSITIONAL	0.11	0.1
8	H	1497	TIGHT POSITIONAL	0.1	0.1
9	I	1497	TIGHT POSITIONAL	0.09	0.1
10	J	1497	TIGHT POSITIONAL	0.16	0.1
1	A	1689	MEDIUM POSITIONAL	0.3	0.5
2	B	1689	MEDIUM POSITIONAL	0.35	0.5
3	C	1689	MEDIUM POSITIONAL	0.32	0.5
4	D	1689	MEDIUM POSITIONAL	0.34	0.5
5	E	1689	MEDIUM POSITIONAL	0.37	0.5
6	F	1689	MEDIUM POSITIONAL	0.34	0.5
7	G	1689	MEDIUM POSITIONAL	0.29	0.5
8	H	1689	MEDIUM POSITIONAL	0.38	0.5
9	I	1689	MEDIUM POSITIONAL	0.31	0.5
10	J	1689	MEDIUM POSITIONAL	0.39	0.5
1	A	1497	TIGHT THERMAL	0.53	1.2
2	B	1497	TIGHT THERMAL	0.48	1.2
3	C	1497	TIGHT THERMAL	0.38	1.2
4	D	1497	TIGHT THERMAL	0.5	1.2
5	E	1497	TIGHT THERMAL	0.49	1.2
6	F	1497	TIGHT THERMAL	0.41	1.2
7	G	1497	TIGHT THERMAL	0.48	1.2
8	H	1497	TIGHT THERMAL	0.45	1.2
9	I	1497	TIGHT THERMAL	0.43	1.2
10	J	1497	TIGHT THERMAL	0.54	1.2
1	A	1689	MEDIUM THERMAL	1.39	3
2	B	1689	MEDIUM THERMAL	1.36	3
3	C	1689	MEDIUM THERMAL	1.21	3
4	D	1689	MEDIUM THERMAL	1.4	3
5	E	1689	MEDIUM THERMAL	1.31	3
6	F	1689	MEDIUM THERMAL	1.22	3
7	G	1689	MEDIUM THERMAL	1.36	3
8	H	1689	MEDIUM THERMAL	1.25	3
9	I	1689	MEDIUM THERMAL	1.22	3
10	J	1689	MEDIUM THERMAL	1.44	3

LS精密化シェル

解像度: 2.05→2.103 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.302	276	-
R_work	0.277	15688	-
all	-	15964	-
obs	-	-	100 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.5453	-0.0691	-0.3092	0.4635	0.5187	1.4497	0.0008	-0.0676	0.0253	0.1505	-0.0404	0.0677	0.2283	-0.1791	0.0396	-0.078	-0.0279	-0.0168	-0.0411	-0.0254	-0.0688	-101.7376	77.1966	-10.1837
2	1.0457	0.3876	0.1132	0.6274	0.0651	0.8725	-0.0138	-0.0337	0.058	0.0744	0.0242	0.0142	0.0987	-0.0938	-0.0104	-0.0194	-0.0397	0.0233	-0.109	0.0227	-0.0996	-93.9595	39.3774	28.706
3	0.9405	-0.1565	0.9186	0.7034	-0.5607	2.4765	-0.0805	0.2961	-0.2061	-0.0359	0.0339	0.0594	0.1107	0.0549	0.0466	-0.0507	-0.0723	0.08	0.1114	-0.1157	0.0367	-116.2426	61.2903	15.5133
4	0.4032	-0.0638	0.2315	1.0701	-0.2824	0.4173	-0.0423	-0.0248	0.0451	-0.13	0.0074	-0.2068	0.1032	-0.0114	0.0348	-0.0893	-0.013	0.0661	-0.109	-0.0122	-0.062	-70.7435	65.3526	-12.3932
5	0.0987	-0.094	0.016	0.4347	-0.2283	0.6275	0.0439	-0.0392	-0.0514	0.0554	-0.0329	-0.2012	0.1557	0.0684	-0.011	-0.055	-0.0105	-0.0098	-0.0973	0.0008	-0.0122	-66.0478	42.1311	12.3116
6	1.5692	-0.695	0.3113	1.2177	-0.5356	0.2827	-0.122	0.0016	0.1571	0.3848	0.007	-0.1872	-0.2575	0.0971	0.115	0.0666	-0.0694	-0.0379	0.0156	0.0739	0.0091	-86.8069	87.8544	65.9634
7	1.2641	0.3403	-0.1487	0.673	-0.051	0.635	0.0591	0.0081	-0.0318	0.0953	-0.0457	0.0178	-0.133	0.0048	-0.0135	-0.0457	-0.0261	-0.0515	-0.0504	-0.0182	-0.0688	-55.1328	81.8907	57.9547
8	1.4078	-0.629	-0.2134	0.677	0.0889	0.4594	-0.0785	-0.0319	-0.0093	0.1895	0.0835	-0.0325	-0.0276	0.0521	-0.005	0.0155	0.0279	-0.0019	-0.0879	-0.0141	-0.0776	-72.8221	119.2365	22.6587
9	0.1131	-0.1581	0.1206	0.4949	0.0623	0.8708	0.0026	0.0026	0.0268	-0.062	0.0636	-0.04	-0.1476	0.0218	-0.0661	-0.0533	-0.0198	0.0128	-0.0261	-0.0504	0.0094	-45.7337	101.3366	31.2229
10	0.2907	0.0225	0.1658	0.9791	0.3959	1.5762	0.0082	-0.0667	-0.0199	0.0426	0.1022	-0.0165	0.045	-0.0231	-0.1104	-0.0861	0.0469	0.0264	-0.0731	-0.0097	-0.1018	-97.5631	112.1943	43.8828

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	A	8 - 314	9 - 315
2	X-RAY DIFFRACTION	2	B	B	8 - 314	9 - 315
3	X-RAY DIFFRACTION	3	C	C	8 - 314	9 - 315
4	X-RAY DIFFRACTION	4	D	D	8 - 315	9 - 316
5	X-RAY DIFFRACTION	5	E	E	8 - 315	9 - 316
6	X-RAY DIFFRACTION	6	F	F	8 - 315	9 - 316
7	X-RAY DIFFRACTION	7	G	G	8 - 315	9 - 316
8	X-RAY DIFFRACTION	8	H	H	8 - 314	9 - 315
9	X-RAY DIFFRACTION	9	I	I	8 - 315	9 - 316
10	X-RAY DIFFRACTION	10	J	J	8 - 315	9 - 316

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlc1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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