解像度: 1.55→50 Å / Num. obs: 25283 / % possible obs: 85.4 % / 冗長度: 3.4 % / Rsym value: 0.038 / Net I/σ(I): 36.1
反射 シェル
解像度: 1.55→1.61 Å / 冗長度: 2.8 % / Mean I/σ(I) obs: 2.5 / Rsym value: 0.321 / % possible all: 56.2
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
HKL-2000
データ収集
SOLVE
位相決定
REFMAC
5.2.0019
精密化
HKL-2000
データ削減
HKL-2000
データスケーリング
精密化
構造決定の手法: 多波長異常分散 / 解像度: 1.55→34.06 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.972 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.949 / SU B: 9.765 / SU ML: 0.14 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R Free: 0.106 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.23682
1356
5.1 %
RANDOM
Rwork
0.18952
-
-
-
obs
0.19193
25283
90.49 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK
原子変位パラメータ
Biso mean: 33.53 Å2
Baniso -1
Baniso -2
Baniso -3
1-
3.49 Å2
0 Å2
-0.37 Å2
2-
-
-1.17 Å2
0 Å2
3-
-
-
-2.76 Å2
精密化ステップ
サイクル: LAST / 解像度: 1.55→34.06 Å
タンパク質
核酸
リガンド
溶媒
全体
原子数
1706
0
22
174
1902
拘束条件
Refine-ID
タイプ
Dev ideal
Dev ideal target
数
X-RAY DIFFRACTION
r_bond_refined_d
0.017
0.022
1760
X-RAY DIFFRACTION
r_angle_refined_deg
1.644
1.983
2368
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_1_deg
6.123
5
210
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_2_deg
33.498
24.186
86
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_3_deg
14.689
15
333
X-RAY DIFFRACTION
r_dihedral_angle_4_deg
14.744
15
13
X-RAY DIFFRACTION
r_chiral_restr
0.106
0.2
259
X-RAY DIFFRACTION
r_gen_planes_refined
0.006
0.02
1313
X-RAY DIFFRACTION
r_nbd_refined
0.217
0.2
791
X-RAY DIFFRACTION
r_nbtor_refined
0.315
0.2
1199
X-RAY DIFFRACTION
r_xyhbond_nbd_refined
0.128
0.2
126
X-RAY DIFFRACTION
r_symmetry_vdw_refined
0.346
0.2
50
X-RAY DIFFRACTION
r_symmetry_hbond_refined
0.217
0.2
25
X-RAY DIFFRACTION
r_mcbond_it
1.169
1.5
1085
X-RAY DIFFRACTION
r_mcangle_it
1.647
2
1701
X-RAY DIFFRACTION
r_scbond_it
2.829
3
759
X-RAY DIFFRACTION
r_scangle_it
4.225
4.5
667
LS精密化 シェル
解像度: 1.55→1.59 Å / Total num. of bins used: 20
Rfactor
反射数
%反射
Rfree
0.34
63
-
Rwork
0.308
1187
-
obs
-
-
58.3 %
精密化 TLS
手法: refined / Origin x: 29.2265 Å / Origin y: 44.3873 Å / Origin z: 11.8613 Å