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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 393d | ||||||||||||||||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF TWO SELF-COMPLEMENTARY CHIMERIC DECAMER D(CCGG)R(C)D(GCCGG) AND D(CCGG)R(CG)D(CCGG) | ||||||||||||||||||||
![]() | DNA/RNA (5'-D(*![]() DNA/RNA / A-T-RNA / DOUBLE HELIX / DNA-RNA COMPLEX | 機能・相同性 | DNA/RNA hybrid | ![]() 生物種 | synthetic construct (人工物) | 手法 | ![]() ![]() Ban, C. / Sundaralingam, M. / Ramakrishnan, B. | ![]() ![]() タイトル: Crystal Structure of Two Self-Complementary Chimeric Decamer d(CCGG)r(C)d(GCCGG) and d(CCGG)r(CG)d(CCGG) 著者: Ban, C. / Ramakrishnan, B. / Sundaralingam, M. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 21.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 13.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 322.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 330.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 2.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 3.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: DNA/RNAハイブリッド | 分子量: 3062.980 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) synthetic construct (人工物) #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.04 Å3/Da / 溶媒含有率: 39.69 % | ||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6 詳細: pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.00K | ||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 |
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-データ収集
検出器 | タイプ: SIEMENS / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1995年6月13日 |
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放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2→20 Å / Num. obs: 3219 / % possible obs: 96 % / Observed criterion σ(I): 3 / 冗長度: 4 % / Rmerge(I) obs: 0.049 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2→8 Å / σ(F): 1 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→8 Å
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拘束条件 |
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Xplor file | Serial no: 1 / Param file: PARAM11.DNA |