登録情報 | データベース: PDB / ID: 2zdl |
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タイトル | Exploring trypsin S3 pocket |
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要素 | Cationic trypsin |
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キーワード | Hydrolase/Hydrolase Inhibitor / Hydrolase Inhibitors / Digestion / Metal-binding / Protease / Secreted / Serine protease / Zymogen / Hydrolase-Hydrolase Inhibitor complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
cap snatching / virion component / hydrolase activity / RNA-directed RNA polymerase / viral RNA genome replication / RNA-dependent RNA polymerase activity / nucleotide binding / metal ion binding類似検索 - 分子機能 RNA polymerase, arenaviral / RNA endonuclease, cap-snatching / Arenavirus RNA polymerase / Arenavirus cap snatching domain / RNA-directed RNA polymerase, negative-strand RNA virus / RdRp of negative ssRNA viruses with segmented genomes catalytic domain profile. / Trypsin / Trypsin-like serine proteases / Thrombin, subunit H / Beta Barrel / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 (S)-N-(4-carbamimidoylbenzyl)-1-(2-(cyclopentyloxy)ethanoyl)pyrrolidine-2-carboxamide / Chem-45U / RNA-directed RNA polymerase L類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_mammal.gif) Bos taurus (ウシ) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / フーリエ合成 / 解像度: 1.8 Å |
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データ登録者 | Baum, B. / Brandt, T. / Heine, A. / Klebe, G. |
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引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2011 タイトル: Congeneric but still distinct: how closely related trypsin ligands exhibit different thermodynamic and structural properties 著者: Brandt, T. / Holzmann, N. / Muley, L. / Khayat, M. / Wegscheid-Gerlach, C. / Baum, B. / Heine, A. / Hangauer, D. / Klebe, G. |
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履歴 | 登録 | 2007年11月26日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2008年10月14日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Non-polymer description / Version format compliance |
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改定 1.2 | 2012年12月12日 | Group: Other |
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改定 1.3 | 2014年1月22日 | Group: Database references |
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改定 1.4 | 2023年11月1日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / diffrn_source / pdbx_initial_refinement_model / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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