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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2xkb | ||||||
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タイトル | Crystal structure of GDP-form protofilaments of Bacillus thuringiensis serovar israelensis TubZ | ||||||
要素 | FTSZ/TUBULIN-RELATED PROTEIN | ||||||
キーワード | STRUCTURAL PROTEIN / MOTOR PROTEIN / CYTOSKELETON / CYTOMOTIVE / DNA SEGREGATION / MICROTUBULE / PBTOXIS / PBT156 / REPX / TUBR | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 plasmid partitioning / 加水分解酵素; 酸無水物に作用; GTPに作用・細胞または細胞小器官の運動に関与 / GTPase activity / GTP binding / identical protein binding / metal ion binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | BACILLUS THURINGIENSIS (バクテリア) | ||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 3 Å | ||||||
データ登録者 | Aylett, C.H.S. / Lowe, J. | ||||||
引用 | ジャーナル: Proc Natl Acad Sci U S A / 年: 2010 タイトル: Filament structure of bacterial tubulin homologue TubZ. 著者: Christopher H S Aylett / Qing Wang / Katharine A Michie / Linda A Amos / Jan Löwe / 要旨: Low copy number plasmids often depend on accurate partitioning systems for their continued survival. Generally, such systems consist of a centromere-like region of DNA, a DNA-binding adaptor, and a ...Low copy number plasmids often depend on accurate partitioning systems for their continued survival. Generally, such systems consist of a centromere-like region of DNA, a DNA-binding adaptor, and a polymerizing cytomotive filament. Together these components drive newly replicated plasmids to opposite ends of the dividing cell. The Bacillus thuringiensis plasmid pBToxis relies on a filament of the tubulin/FtsZ-like protein TubZ for its segregation. By combining crystallography and electron microscopy, we have determined the structure of this filament. We explain how GTP hydrolysis weakens the subunit-subunit contact and also shed light on the partitioning of the plasmid-adaptor complex. The double helical superstructure of TubZ filaments is unusual for tubulin-like proteins. Filaments of ParM, the actin-like partitioning protein, are also double helical. We suggest that convergent evolution shapes these different types of cytomotive filaments toward a general mechanism for plasmid separation. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2xkb.cif.gz | 912.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2xkb.ent.gz | 756 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2xkb.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2xkb_validation.pdf.gz | 3.6 MB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2xkb_full_validation.pdf.gz | 3.7 MB | 表示 | |
XML形式データ | 2xkb_validation.xml.gz | 162.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2xkb_validation.cif.gz | 216.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/xk/2xkb ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/xk/2xkb | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCSドメイン:
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