PDB-2x86: AGME bound to ADP-B-mannose

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 2x86

タイトル

AGME bound to ADP-B-mannose

要素

ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

キーワード

ISOMERASE / LIPOPOLYSACCHARIDE BIOSYNTHESIS / CARBOHYDRATE METABOLISM / STRESS RESPONSE

機能・相同性

機能・相同性情報

ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase / ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase activity / ADP-L-glycero-beta-D-manno-heptose biosynthetic process / lipopolysaccharide core region biosynthetic process / NADP binding
類似検索 - 分子機能

生物種

ESCHERICHIA COLI (大腸菌)

手法

X線回折 /

分子置換 / 解像度: 2.8 Å

データ登録者

Kowatz, T. / Morrison, J.P. / Tanner, M.E. / Naismith, J.H.

引用

ジャーナル: Protein Sci. / 年: 2010
タイトル: The Crystal Structure of the Y140F Mutant of Adp-L-Glycero-D-Manno-Heptose 6-Epimerase Bound to Adp-Beta-D-Mannose Suggests a One Base Mechanism.
著者: Kowatz, T. / Morrison, J.P. / Tanner, M.E. / Naismith, J.H.

履歴

登録	2010年3月6日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2010年3月16日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年7月13日	Group: Advisory / Version format compliance
改定 1.2	2017年6月28日	Group: Data collection / カテゴリ: diffrn_source / Item: _diffrn_source.type
改定 1.3	2020年7月29日	Group: Data collection / Derived calculations ...Data collection / Derived calculations / Other / Structure summary カテゴリ: chem_comp / entity ...chem_comp / entity / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_database_status / pdbx_entity_nonpoly / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item: _chem_comp.name / _chem_comp.type ..._chem_comp.name / _chem_comp.type / _entity.pdbx_description / _pdbx_database_status.status_code_sf / _pdbx_entity_nonpoly.name / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation
改定 1.4	2023年12月20日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
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PDB形式	pdb2x86.ent.gz	1017.3 KB	表示	PDB形式
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その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/x8/2x86 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/x8/2x86	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	2x6tC 1eq2S C: 同じ文献を引用 (文献) S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	1eq2-2 1eq2-1 4h5o-1 6mvf-2 4pay-d 4h5o-2 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

B: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

C: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

D: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

E: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

F: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

G: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

H: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

I: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

J: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

K: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

L: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

M: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

N: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

O: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

P: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

Q: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

R: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

S: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

T: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

ヘテロ分子

825 kDa, 20 ポリマー
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1

A: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

B: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

C: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

D: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

E: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
206 kDa, 5 ポリマー
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2

F: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

G: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

H: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

I: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

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3

K: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

L: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

M: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

N: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

O: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

ヘテロ分子

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4

P: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

Q: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

R: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

S: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

T: ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
206 kDa, 5 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	138.074, 162.458, 185.027
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 101.45, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

#1: タンパク質

ADP-L-GLYCERO-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE / AGME / ADP-HEP 6-EPIMERASE / ADP-L-GLYCERO-BETA-D-MANNO-HEPTOSE-6-EPIMERASE / ADP-GLYCEROMANNO- ...

分子量: 39891.512 Da / 分子数: 20 / 変異: YES / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

ESCHERICHIA COLI (大腸菌) / 発現宿主:

ESCHERICHIA COLI (大腸菌)
参照: UniProt: P67911, ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase

#2: 化合物

ChemComp-NAP / NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE / 2'-MONOPHOSPHOADENOSINE 5'-DIPHOSPHORIBOSE

分子量: 743.405 Da / 分子数: 20 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₁H₂₈N₇O₁₇P₃

#3: 化合物

ChemComp-ADP / ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / ADP

分子量: 427.201 Da / 分子数: 20 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₅N₅O₁₀P₂ / コメント: ADP, エネルギー貯蔵分子*YM

#4: 糖

ChemComp-BMA / beta-D-mannopyranose / beta-D-mannose / D-mannose / mannose / β-D-マンノピラノ-ス

タイプ: D-saccharide, beta linking / 分子量: 180.156 Da / 分子数: 19 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C₆H₁₂O₆

#5: 水

ChemComp-HOH / water

分子量: 18.015 Da / 分子数: 925 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

構成要素の詳細

ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN A, TYR 140 TO PHE ENGINEERED RESIDUE IN CHAIN B, TYR 140 TO PHE ...

配列の詳細

HIS TAG AT N-TERMINUS, Y140F MUTATION

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.55 Å³/Da / 溶媒含有率: 51.75 % / 解説: NONE

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: 回転陽極 / タイプ: RIGAKU MICROMAX-007 HF / 波長: 1.54
検出器	タイプ: RIGAKU CCD RIGAKU / 検出器: CCD / 詳細: MIRRORS
放射	モノクロメーター: MIRRORS / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1.54 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.8→33 Å / Num. obs: 197672 / % possible obs: 97 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 3.6 % / R_merge(I) obs: 0.09 / Net I/σ(I): 15
反射シェル	解像度: 2.8→2.85 Å / 冗長度: 3.5 % / R_merge(I) obs: 0.81 / Mean I/σ(I) obs: 1.8 / % possible all: 92

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.6.0060	精密化
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング
MOLREP		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 1EQ2

1eq2

解像度: 2.8→35.05 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.92 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.902 / SU B: 32.587 / SU ML: 0.303 / TLS residual ADP flag: LIKELY RESIDUAL / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R Free: 0.417 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD
詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS. U VALUES RESIDUAL ONLY. ATOM RECORD CONTAINS RESIDUAL B FACTORS ONLY

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.27239	9661	5.1 %	RANDOM
R_work	0.2522	-	-	-
obs	0.25321	181448	96.78 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 10.715 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-0.12 Å²	0 Å²	0.03 Å²
2-	-	0.15 Å²	-0 Å²
3-	-	-	-0.02 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.8→35.05 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	48800	0	1709	925	51434

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.012	0.022	51808
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.006	0.02	34053
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.353	1.983	70363
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	2.399	3	82740
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	5.299	5	6120
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	37.639	24.729	2580
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	15.854	15	8160
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	11.517	15	200
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.069	0.2	7415
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.004	0.02	57768
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.003	0.02	11020
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_other
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_other
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_other
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

LS精密化シェル

解像度: 2.795→2.867 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.497	647	-
R_work	0.467	12604	-
obs	-	-	91.68 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.4011	-0.7438	0.7183	2.7238	-0.0939	2.2185	0.042	0.11	0.0637	0.1155	-0.0175	-0.3624	0.2663	0.2136	-0.0245	0.1477	-0.0061	0.0638	0.195	0.014	0.1904	23.581	-32.116	80.306
2	1.9554	-0.1387	0.9408	2.951	0.4723	2.9251	-0.0929	0.0752	0.0479	0.4686	0.1287	-0.5898	-0.0398	0.5195	-0.0358	0.4599	0.0389	-0.1991	0.261	-0.0127	0.3151	42.179	-14.62	110.598
3	1.9206	-0.7647	0.286	2.848	0.1879	2.3182	-0.0939	0.0065	0.2165	0.2652	0.1493	-0.4936	-0.2573	0.3077	-0.0554	0.5936	-0.0985	-0.0785	0.1809	-0.0525	0.2506	31.39	23.599	110.925
4	1.3462	-0.0982	0.6101	2.1805	-0.5799	2.2736	-0.0019	0.0349	0.1346	0.1673	-0.0072	0.0489	-0.3464	0.0035	0.0091	0.3282	0.0419	0.087	0.1554	0.0069	0.1629	5.451	29.438	81.577
5	1.0461	-0.0459	0.4444	2.423	-0.2696	1.8331	-0.0679	0.1123	0.0099	-0.0155	-0.0109	0.1527	-0.0676	-0.0218	0.0788	0.0417	-0.018	0.0648	0.2422	-0.0213	0.1463	0.815	-5.02	62.541
6	1.1448	-0.4459	0.7678	2.7714	0.2295	2.1545	0.0862	0.0793	0.0222	-0.1826	-0.0145	-0.3557	0.2593	0.188	-0.0717	0.189	0.0022	0.1158	0.1843	0.0063	0.1745	-18.983	-32.121	125.036
7	1.1499	0.146	0.9689	3.2524	1.0181	3.2666	0.0439	0.099	-0.0387	0.3951	0.1503	-0.7841	0.2082	0.6401	-0.1942	0.2354	0.0559	-0.1224	0.3211	-0.0218	0.4053	-0.873	-14.663	155.684
8	1.4022	-0.4001	0.3828	2.1824	-0.0751	2.0024	-0.0273	0.0364	0.1336	0.2463	0.0209	-0.2969	-0.2932	0.3381	0.0064	0.2472	-0.1062	0.048	0.2284	-0.0369	0.1876	-11.82	23.605	156.018
9	1.301	0.0093	0.5113	1.9963	-0.3813	2.0384	0.019	0.0362	0.1367	-0.0117	0.0419	0.0518	-0.1685	0.0341	-0.0609	0.1055	0.0382	0.1174	0.1842	0.0044	0.1629	-37.071	29.456	126.106
10	1.2064	-0.1755	0.7923	2.6002	0.0729	1.8064	0.0303	0.1218	-0.0132	-0.299	-0.0428	0.1456	0.1111	0.024	0.0125	0.0824	-0.0043	0.052	0.2127	-0.0244	0.1302	-41.403	-4.92	106.879
11	2.0599	-0.0198	1.393	2.3505	-0.4602	2.817	0.1379	-0.16	-0.2991	-0.0852	0.174	0.2507	0.1698	-0.3939	-0.3119	0.1678	-0.0527	-0.0348	0.2187	0.0415	0.2376	16.489	67.201	115.306
12	1.3394	0.6424	0.4005	2.3528	-0.1845	1.5655	-0.1899	0.1081	0.1793	-0.2899	0.1674	0.0532	-0.1948	-0.1168	0.0225	0.2682	-0.0123	-0.0024	0.1837	0.0093	0.1781	33.869	102.701	111.786
13	1.2072	0.1412	0.7803	2.3456	0.2472	1.9492	-0.0645	-0.0295	0.0638	0.1204	0.0139	-0.1132	-0.205	0.0968	0.0506	0.1002	-0.0319	0.0141	0.2254	-0.074	0.2775	57.353	107.976	143.142
14	2.1121	0.2623	0.9367	2.9882	-0.4925	1.9489	0.1047	-0.6904	-0.1436	0.5688	0.0176	-0.1449	0.0541	-0.2482	-0.1222	0.1812	0.006	-0.0277	0.4529	0.0271	0.281	55.558	75.356	165.681
15	2.0102	0.4259	1.6523	2.7567	0.0392	2.5556	0.5017	-0.6564	-0.5722	0.2827	0.1063	0.3127	0.4747	-0.7073	-0.608	0.283	-0.1787	-0.1407	0.4182	0.307	0.5525	30.301	50.022	148.331
16	1.6216	-0.1039	0.8788	2.3498	-0.5562	2.6486	0.048	-0.1846	-0.1836	-0.0575	0.0964	0.3081	0.013	-0.4201	-0.1445	0.0534	0.0076	0.0586	0.2498	0.0032	0.1769	-26.745	67.016	160.044
17	1.5124	0.6092	0.4106	2.0713	-0.0718	2.0064	-0.2245	0.1023	0.2653	-0.1567	0.127	0.0146	-0.2644	-0.1741	0.0975	0.2086	0.0154	0.0179	0.1783	0.0143	0.1959	-9.219	102.463	156.782
18	1.0431	0.0682	0.78	3.7742	0.088	2.0947	-0.1068	-0.0328	0.1455	0.4273	0.0336	-0.3948	-0.1908	0.1474	0.0733	0.2465	-0.0112	-0.1237	0.2091	-0.0549	0.3486	12.957	108.004	188.97
19	1.2327	0.4509	0.3898	4.4558	-1.1233	1.7464	-0.0481	-0.3513	0.0891	1.5012	-0.0113	-0.4177	-0.2685	-0.0215	0.0593	0.8305	0.1087	-0.2089	0.3232	-0.0496	0.2318	10.165	75.542	211.705
20	1.1029	0.0775	0.5532	2.6982	-0.0736	1.9405	-0.0447	-0.2464	-0.166	0.4194	0.2199	0.3965	0.084	-0.3418	-0.1751	0.2131	0.047	0.1402	0.3436	0.1307	0.2391	-14.394	50.072	193.743

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	1 - 307
2	X-RAY DIFFRACTION	2	B	1 - 307
3	X-RAY DIFFRACTION	3	C	1 - 307
4	X-RAY DIFFRACTION	4	D	1 - 307
5	X-RAY DIFFRACTION	5	E	1 - 307
6	X-RAY DIFFRACTION	6	F	1 - 307
7	X-RAY DIFFRACTION	7	G	1 - 307
8	X-RAY DIFFRACTION	8	H	1 - 307
9	X-RAY DIFFRACTION	9	I	1 - 307
10	X-RAY DIFFRACTION	10	J	1 - 307
11	X-RAY DIFFRACTION	11	K	1 - 307
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15	X-RAY DIFFRACTION	15	O	1 - 307
16	X-RAY DIFFRACTION	16	P	1 - 307
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18	X-RAY DIFFRACTION	18	R	1 - 307
19	X-RAY DIFFRACTION	19	S	1 - 307
20	X-RAY DIFFRACTION	20	T	1 - 307

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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