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Open data
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Basic information
| Entry | Database: PDB / ID: 2x3y | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Title | Crystal structure of GmhA from Burkholderia pseudomallei | ||||||
Components | PHOSPHOHEPTOSE ISOMERASE | ||||||
Keywords | ISOMERASE / CAPSULE BIOGENESIS/DEGRADATION / CAPSULE / CARBOHYDRATE METABOLISM | ||||||
| Function / homology | Function and homology informationD-sedoheptulose-7-phosphate isomerase / D-sedoheptulose 7-phosphate isomerase activity / D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate biosynthetic process / capsule polysaccharide biosynthetic process / carbohydrate derivative binding / zinc ion binding / cytoplasm Similarity search - Function | ||||||
| Biological species | BURKHOLDERIA PSEUDOMALLEI (bacteria) | ||||||
| Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.4 Å | ||||||
Authors | Harmer, N.J. | ||||||
Citation | Journal: J.Mol.Biol. / Year: 2010Title: The Structure of Sedoheptulose-7-Phosphate Isomerase from Burkholderia Pseudomallei Reveals a Zinc Binding Site at the Heart of the Active Site. Authors: Harmer, N.J. | ||||||
| History |
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Structure visualization
| Structure viewer | Molecule: Molmil Jmol/JSmol |
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| PDBx/mmCIF format | 2x3y.cif.gz | 597.9 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
|---|---|---|---|---|
| PDB format | pdb2x3y.ent.gz | 496.4 KB | Display | PDB format |
| PDBx/mmJSON format | 2x3y.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
| Others | Other downloads |
-Validation report
| Summary document | 2x3y_validation.pdf.gz | 482.9 KB | Display | wwPDB validaton report |
|---|---|---|---|---|
| Full document | 2x3y_full_validation.pdf.gz | 496.4 KB | Display | |
| Data in XML | 2x3y_validation.xml.gz | 58.9 KB | Display | |
| Data in CIF | 2x3y_validation.cif.gz | 82.6 KB | Display | |
| Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/x3/2x3y ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/x3/2x3y | HTTPS FTP |
-Related structure data
| Related structure data | ![]() 2xblC ![]() 1tk9S ![]() 2x3z S: Starting model for refinement C: citing same article ( |
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| Similar structure data |
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Assembly
| Deposited unit | ![]()
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| Unit cell |
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| Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
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BURKHOLDERIA PSEUDOMALLEI (bacteria)
X-RAY DIFFRACTION
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