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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2waw | ||||||
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タイトル | crystal structure of Mycobacterium tuberculosis rv0371c homolog from mycobacterium sp. strain JC1 | ||||||
![]() | MOBA RELATE PROTEIN | ||||||
![]() | UNKNOWN FUNCTION | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Cho, H.J. / Kang, B.S. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal Structure of Mycobacterium Tuberculosis Rv0371C Homolog from Mycobacterium Sp. Strain Jc1 著者: Cho, H.J. / Kang, B.S. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 56.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 39.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 436.8 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 437.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 12.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 17.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 21128.186 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() | ||||
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#2: 化合物 | ChemComp-PGE / | ||||
#3: 化合物 | #4: 水 | ChemComp-HOH / | Has protein modification | Y | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.2 Å3/Da / 溶媒含有率: 44.21 % / 解説: NONE |
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結晶化 | pH: 7.5 詳細: 28% PEG 400, 0.1M HEPES PH 7.5, 0.2M CALCIUM CHLORIDE |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 294 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC CCD / 検出器: CCD / 日付: 2008年10月12日 / 詳細: MIRRORS |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.23985 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.58→50 Å / Num. obs: 23465 / % possible obs: 94.1 % / 冗長度: 8.9 % / Rmerge(I) obs: 0.07 / Net I/σ(I): 42.8 |
反射 シェル | 解像度: 1.58→1.64 Å / 冗長度: 4.3 % / Rmerge(I) obs: 0.24 / Mean I/σ(I) obs: 2.8 / % possible all: 72.4 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS RV0371C 解像度: 1.6→24.5 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.965 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.96 / SU B: 3.247 / SU ML: 0.058 / TLS residual ADP flag: LIKELY RESIDUAL / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.094 / ESU R Free: 0.091 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS.
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 23.8 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.6→24.5 Å
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拘束条件 |
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