登録情報 | データベース: PDB / ID: 2w9m |
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タイトル | Structure of family X DNA polymerase from Deinococcus radiodurans |
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要素 | POLYMERASE X |
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キーワード | DNA REPLICATION / SAXS / DNA REPAIR / DNA POLYMERASE |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
phosphoric ester hydrolase activity / bacterial-type flagellum-dependent swarming motility / DNA-directed DNA polymerase activity / DNA repair / DNA binding / zinc ion binding / cytosol類似検索 - 分子機能 DNA polymerase/3'-5' exonuclease PolX-like / Polymerase/histidinol phosphatase, N-terminal / DNA polymerase alpha chain like domain / Polymerase/histidinol phosphatase-like / Helix-hairpin-helix domain / Beta Polymerase; domain 3 / DNA polymerase, thumb domain / DNA polymerase beta, N-terminal domain-like / Metal-dependent hydrolases / DNA-directed DNA polymerase X ...DNA polymerase/3'-5' exonuclease PolX-like / Polymerase/histidinol phosphatase, N-terminal / DNA polymerase alpha chain like domain / Polymerase/histidinol phosphatase-like / Helix-hairpin-helix domain / Beta Polymerase; domain 3 / DNA polymerase, thumb domain / DNA polymerase beta, N-terminal domain-like / Metal-dependent hydrolases / DNA-directed DNA polymerase X / DNA polymerase beta-like, N-terminal domain / Helix-hairpin-helix domain / DNA polymerase X family / DNA polymerase lambda lyase domain superfamily / DNA polymerase, thumb domain superfamily / Beta Polymerase, domain 2 / Helix-hairpin-helix DNA-binding motif, class 1 / Helix-hairpin-helix DNA-binding motif class 1 / Beta Polymerase; domain 2 / Nucleotidyltransferase superfamily / 5' to 3' exonuclease, C-terminal subdomain / DNA polymerase; domain 1 / TIM Barrel / Alpha-Beta Barrel / 2-Layer Sandwich / Orthogonal Bundle / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | DEINOCOCCUS RADIODURANS (放射線耐性) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 単波長異常分散 / 解像度: 2.46 Å |
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データ登録者 | Leulliot, N. / Cladiere, L. / Lecointe, F. / Durand, D. / Hubscher, U. / van Tilbeurgh, H. |
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引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2009 タイトル: The Family X DNA Polymerase from Deinococcus Radioduran Adopts a Non-Standard Extended Conformation. 著者: Leulliot, N. / Cladiere, L. / Lecointe, F. / Durand, D. / Hubscher, U. / Van Tilbeurgh, H. |
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履歴 | 登録 | 2009年1月27日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2009年2月10日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年5月8日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.3 | 2024年5月8日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Other カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_sf / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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