ENSEMBLE OF 30 STRUCTURES THAT SATISFIED THE NMR RESTRAINTS WITH NO NOE VIOLATIONS GREATER THAN 0.3 A AND NO DIHEDRAL ANGLE VIOLATIONS GREATER THAN 3 DEGREES.
代表モデル
-
要素
#1: タンパク質
STROMALCELL-DERIVEDFACTOR-1 / SDF
分子量: 7849.280 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P48061
-
実験情報
-
実験
実験
手法: 溶液NMR
NMR実験
Conditions-ID
Experiment-ID
Solution-ID
タイプ
1
1
1
COSY
1
2
1
NOESY
1
3
1
TOCSY
1
4
1
13C-HSQC
1
5
1
13C EDITED HMQC-NOESY
1
6
1
15N-HSQC
1
7
1
3D 15N-EDITED NOESY-HSQC
-
試料調製
試料状態
pH: 4.9 / 温度: 303 K
結晶化
*PLUS
手法: other / 詳細: NMR
-
NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ
製造業者
モデル
磁場強度 (MHz)
Spectrometer-ID
Varian VARIAN INOVA
Varian
VARIANINOVA
500
1
Varian UNITY
Varian
UNITY
600
2
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
X-PLOR
3.1
モデル構築
X-PLOR
3.1
精密化
X-PLOR
3.1
位相決定
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
X-PLOR
3.1
BRUNGER
精密化
X-PLOR
構造決定
精密化
手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: STRUCTURES WERE REFINED WITH MULTIPLE ROUNDS OF SIMULATED ANNEALING, WITH THE ADDITION OF NEW NOES AND CORRECTION OF AMBIGUOUS NOES. DETAILS OF THE NUMBER OF RESTRAINTS ETC. CAN BE FOUND IN ...詳細: STRUCTURES WERE REFINED WITH MULTIPLE ROUNDS OF SIMULATED ANNEALING, WITH THE ADDITION OF NEW NOES AND CORRECTION OF AMBIGUOUS NOES. DETAILS OF THE NUMBER OF RESTRAINTS ETC. CAN BE FOUND IN THE JRNL CITATION ABOVE.
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: ENSEMBLE OF 30 STRUCTURES THAT SATISFIED THE NMR RESTRAINTS WITH NO NOE VIOLATIONS GREATER THAN 0.3 A AND NO DIHEDRAL ANGLE VIOLATIONS GREATER THAN 3 DEGREES. 計算したコンフォーマーの数: 30 / 登録したコンフォーマーの数: 30