PDB-2ri0: Crystal Structure of glucosamine 6-phosphate deaminase (NagB) fro...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 2ri0

タイトル

Crystal Structure of glucosamine 6-phosphate deaminase (NagB) from S. mutans

要素

Glucosamine-6-phosphate deaminase

キーワード

HYDROLASE / glucosamine 6-phosphate deaminase / Carbohydrate metabolism

機能・相同性

機能・相同性情報

glucosamine catabolic process / amino sugar metabolic process / glucosamine-6-phosphate deaminase / glucosamine-6-phosphate deaminase activity / N-acetylglucosamine catabolic process / N-acetylneuraminate catabolic process / carbohydrate metabolic process / identical protein binding / cytoplasm
類似検索 - 分子機能

生物種

Streptococcus mutans (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.6 Å

データ登録者

Li, D. / Liu, C. / Li, L.F. / Su, X.D.

引用

ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2008
タイトル: Ring-opening mechanism revealed by crystal structures of NagB and its ES intermediate complex
著者: Liu, C. / Li, D. / Liang, Y.H. / Li, L.F. / Su, X.D.

履歴

登録	2007年10月10日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2008年3月25日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年7月13日	Group: Advisory / Version format compliance
改定 1.2	2024年3月13日	Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	2ri0.cif.gz	120.3 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb2ri0.ent.gz	95.2 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	2ri0.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ri/2ri0 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ri/2ri0	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	2ri1C C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	3b24-1 2ye4-d 2ye3-d 4lwi-d 5j27-d 2yeb-d 3zxx-d 3qdd-d 2ye8-d 6cyh-2 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: Glucosamine-6-phosphate deaminase

B: Glucosamine-6-phosphate deaminase

ヘテロ分子

51.6 kDa, 2 ポリマー
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1

A: Glucosamine-6-phosphate deaminase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
25.8 kDa, 1 ポリマー
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2

B: Glucosamine-6-phosphate deaminase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
25.8 kDa, 1 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	54.000, 82.170, 134.910
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

#1: タンパク質	Glucosamine-6-phosphate deaminase / NagB / Glucosamine-6-phosphate isomerase / GNPDA / GlcN6P deaminase 分子量: 25588.402 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Streptococcus mutans (バクテリア) 遺伝子: SMU.636 / プラスミド: pET-28a / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: Q8DV70, glucosamine-6-phosphate deaminase
#2: 化合物	ChemComp-BTB / 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL / BIS-TRIS BUFFER / ビストリス分子量: 209.240 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₈H₁₉NO₅ / コメント: pH緩衝剤*YM
#3: 化合物	ChemComp-NA / SODIUM ION / ナトリウムカチオン分子量: 22.990 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Na
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 663 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.92 Å³/Da / 溶媒含有率: 57.94 %
結晶化	温度: 289 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 5.5 詳細: 0.2M ammonium sulfate, 0.1M bis-Tris pH 5.5, 25%(w/v) PEG 3350, vapor diffusion, hanging drop, temperature 289K

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

ESRF

/ ビームライン: ID29 / 波長: 0.97564 Å

検出器

タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.97564 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 1.5→45.13 Å / Num. obs: 76798 / % possible obs: 79.3 % / Observed criterion σ(I): -3 / B_iso Wilson estimate: 24.622 Å² / R_merge(I) obs: 0.069 / Net I/σ(I): 18.32

反射シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)	最高解像度 (Å)	R_merge(I) obs	Mean I/σ(I) obs	Num. measured obs	Num. unique obs	% possible all
1.5-1.6
1.6-1.7		0.318	5.1	58824	10736	81.7
1.7-1.8		0.223	8.4	73440	10169	97.8
1.8-2		0.131	13.4	107941	14854	98.5
2-2.5		0.073	22.3	144313	19718	99
2.5-2.7		0.06	27.5	31610	4324	99.2
2.7-3		0.063	27.8	32951	4523	99.5
3-3.3		0.067	26.8	21900	3056	99.7
3.3-4		0.061	29.4	28811	4060	99.7
4-5		0.053	33.9	18127	2590	99.5
5-6		0.052	35	8249	1169	99.9
6-10		0.051	34.8	8657	1274	98.2
10-15		0.05	30.9	1239	226	81.6
	15	0.051	24.6	407	99	72.8

-
位相決定

位相決定	手法: 分子置換

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
XSCALE		データスケーリング
MOLREP		位相決定
REFMAC	5.2.0005	精密化
PDB_EXTRACT	3	データ抽出

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 1.6→45.13 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.957 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.945 / SU B: 2.596 / SU ML: 0.048 / TLS residual ADP flag: LIKELY RESIDUAL / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.082 / ESU R Free: 0.08 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.199	3865	5 %	RANDOM
R_work	0.177	-	-	-
obs	0.178	76734	96.67 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 12.575 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	0.1 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	-0.07 Å²	0 Å²
3-	-	-	-0.03 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.6→45.13 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	3564	0	30	663	4257

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.012	0.022	3752
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.455	1.987	5088
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	6.259	5	498
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	40.956	25.772	149
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	12.123	15	681
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	14.426	15	8
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.183	0.2	584
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.006	0.02	2768
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined	0.21	0.2	1910
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined	0.314	0.2	2647
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined	0.146	0.2	495
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined	0.203	0.2	55
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined	0.122	0.2	24
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	0.657	1.5	2380
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	1.182	2	3836
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	2.354	3	1388
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	3.741	4.5	1236

LS精密化シェル

解像度: 1.604→1.646 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.294	207	-
R_work	0.231	4120	-
all	-	4327	-
obs	-	-	74.55 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.2613	-0.3499	-0.744	14.1056	1.4117	5.137	0.2511	0.0657	0.0091	-0.8141	-0.4522	0.0288	-0.3577	-0.6365	0.2012	-0.0254	0.0455	-0.058	0.1031	-0.0141	-0.0711	40.489	41.097	-3.563
2	1.6325	0.8842	-0.1555	1.2733	0.2238	2.6498	-0.0919	0.0743	0.0039	-0.2926	-0.0108	-0.0187	-0.0101	0.1258	0.1027	0.0292	0.015	0.0228	0.0321	0.0213	-0.001	53.997	38.237	-1.235
3	7.0584	-0.3999	-2.9406	3.1779	-0.0488	3.9598	0.0174	0.2041	-0.2161	-0.3815	-0.0384	0.0658	0.3115	-0.0431	0.021	0.0926	0.021	0.0216	0.0243	-0.0226	-0.0325	52.106	28.758	-0.853
4	1.0975	0.268	-1.0107	1.4611	-1.1294	3.8702	-0.0128	0.0167	-0.1313	-0.1486	-0.022	-0.0896	0.225	0.2185	0.0348	-0.023	0.0579	0.0297	0.0588	0.0055	0.0375	57.382	28.937	11.39
5	2.5892	1.2849	-1.1872	4.8173	2.2041	4.8742	-0.0661	-0.0628	-0.1732	-0.1099	0.0494	-0.329	0.3806	0.5101	0.0168	-0.0117	0.1045	0.0397	0.078	0.0125	0.0107	61.868	29.94	7.208
6	1.163	-0.3881	0.1226	1.3043	-0.8283	2.1821	-0.0263	-0.1056	0.0595	0.0503	0.0385	-0.1083	-0.0453	0.2627	-0.0122	-0.0425	0.0161	0.005	0.0864	0.0024	0.0198	58.907	39.342	19.587
7	2.614	0.2821	-0.5951	1.8362	0.8679	5.8115	-0.0905	0.0762	-0.172	0.0763	0.0432	0.118	0.2513	-0.098	0.0473	-0.0253	0.0141	0.0205	0.0316	-0.0079	0.0641	40.075	37.843	15.835
8	2.6051	-2.0444	-1.8082	8.3691	-1.0191	2.1339	-0.0098	-0.2157	0.299	0.0974	0.009	-0.3122	-0.1159	0.0254	0.0008	0.0016	0.0197	0.0052	0.0387	-0.0173	0.035	47.869	46.587	21.742
9	7.1579	7.2018	0.9368	11.8289	1.358	0.4722	-0.3585	0.361	-0.1966	-0.1677	0.4885	0.0408	-0.0603	0.0812	-0.1299	-0.0408	0.0012	0.0467	0.0697	0.0152	0.0142	43.128	26.483	22.53
10	13.9432	-2.2091	1.2135	17.6113	1.8987	6.8317	-0.0521	-0.6797	-1.7307	0.8068	0.0408	0.3524	0.6745	0.1471	0.0113	0.0285	0.0432	0.0928	0.0723	0.1251	0.2321	46.766	21.436	27.219
11	0.7616	1.0139	-0.2136	1.8848	-1.1885	2.1166	-0.0308	-0.0228	-0.0178	0.0088	-0.0511	-0.0574	-0.1027	0.1367	0.0819	-0.0032	0.0226	0.0272	0.0568	-0.0011	0.0336	51.162	43.232	16.18
12	6.6464	7.347	-0.2994	8.782	0.7336	2.4989	-0.0073	0.076	0.1565	-0.3121	-0.2139	0.1974	0.0339	-0.2579	0.2212	0.0055	0.0176	-0.0122	0.0737	-0.0191	0.0016	43.171	39.072	2.95
13	3.6147	-1.9755	0.234	8.2255	1.5326	6.7033	-0.0497	0.1012	-0.1908	-0.322	-0.2512	0.49	-0.1436	-0.5962	0.3009	-0.0605	0.036	-0.0303	0.1163	-0.0489	0.0265	33.832	40.592	7.156
14	2.857	-1.5168	0.4282	6.7729	2.5047	2.669	0.1106	0.1502	0.0333	-0.0489	-0.2283	0.2122	-0.2184	-0.3562	0.1177	-0.0248	0.066	-0.0002	0.0783	-0.0241	0.0349	34.474	49.024	15.113
15	1.6589	0.0612	-0.3773	0.7084	0.3591	2.1109	0.061	0.0876	0.1326	-0.1301	0.0052	0.1231	-0.202	-0.1035	-0.0662	0.022	0.0379	-0.0053	0.0334	0.0089	0.0159	42.625	46.645	6.599
16	7.8169	-2.0308	-6.1832	44.6096	22.2891	34.1914	0.6222	0.7871	-0.3875	-1.3358	-1.2953	0.9424	-0.9279	-2.508	0.673	-0.0581	0.0996	-0.0899	0.2487	-0.0764	-0.0201	32.025	39.559	-1.03
17	4.608	-10.428	2.7596	43.4439	-15.529	8.6849	0.225	0.0967	0.0601	1.6313	-0.5863	0.3828	-0.4021	0.326	0.3613	0.1217	-0.0411	0.1485	-0.0223	-0.0304	-0.0227	67.196	31.927	56.859
18	8.0445	-1.7343	4.1361	2.0693	-0.6197	3.0173	-0.0716	-0.1996	0.2024	0.3831	0.0366	0.2019	-0.1789	-0.0528	0.035	0.0734	0.0051	0.0353	0.0084	-0.0167	0.0149	73.859	41.014	51.303
19	1.0659	-0.6717	0.6242	1.6504	0.0988	1.3038	0.0012	0.0226	0.0209	0.2476	0.0134	0.0273	-0.0828	0.0498	-0.0146	0.0408	-0.0153	-0.0057	0.0312	0.0052	0.0154	80.514	33.856	46.956
20	0.6915	0.0063	-0.0671	1.4324	0.6028	1.3052	0.0679	-0.0357	0.0528	0.0868	-0.0171	-0.1697	-0.0934	0.0465	-0.0508	0.0148	-0.0209	-0.0117	0.0198	0.0076	0.0436	83.859	35.004	41.604
21	1.349	0.3657	0.649	1.9995	1.4751	3.5736	0.0209	0.1269	0.126	-0.0706	0.0016	-0.0223	-0.2446	-0.0066	-0.0225	-0.0004	-0.0087	0.0164	0.0346	0.0253	0.0452	81.887	33.565	29.983
22	0.4446	-0.0058	-0.2858	1.4121	0.8728	1.2469	0.044	0.0281	0.0011	-0.0335	-0.0089	-0.2787	-0.0234	0.1269	-0.0351	-0.0118	-0.0102	0.0038	0.0294	0.0008	0.0782	88.59	27.694	35.317
23	0.6344	0.9695	0.3055	2.8014	1.8963	5.2048	-0.033	0.0267	-0.1218	-0.0163	0.0217	-0.2266	0.0699	0.0951	0.0113	-0.0108	0.0088	0.0071	0.0156	-0.0079	0.0922	86.548	14.853	34.107
24	1.6256	0.125	0.1729	1.1154	0.3395	0.9279	0.0531	-0.0737	-0.0042	0.1613	0.0126	-0.0462	0.003	0.0117	-0.0657	0.0017	-0.0059	-0.0134	0.0169	0.0284	0.022	79.22	22.852	43.9
25	2.263	-0.1578	-1.2337	3.6474	-1.0347	2.5297	0.0108	0.0461	0.0034	-0.0175	-0.0288	0.0332	-0.036	-0.0671	0.018	-0.0016	-0.0211	-0.0015	0.0316	0.0096	0.0276	70.895	15.354	40.233
26	4.3052	-2.6564	3.0239	4.1818	-3.618	3.3314	-0.0642	-0.0111	-0.0778	0.0951	0.2243	0.2229	-0.0352	-0.2765	-0.1601	-0.0389	0.0236	-0.0006	0.0799	0.016	0.0236	69.843	23.406	27.576
27	3.9872	-1.9259	1.3359	21.5352	-10.5208	10.4253	-0.0349	0.8475	-0.08	-1.5498	0.2281	-0.0043	0.686	-0.131	-0.1932	0.0614	-0.0506	-0.0313	0.1836	0.0358	-0.0336	73.867	25.373	18.709
28	0.7303	0.1255	0.1867	0.854	0.9315	3.118	-0.0023	-0.0216	-0.0488	0.0905	-0.0612	-0.0282	0.0009	0.0103	0.0635	0.019	-0.0193	-0.0178	0.0305	0.016	0.0347	78.045	19.72	44.407
29	8.8525	-5.0587	4.9983	3.3742	-1.9654	5.3302	0.0859	-0.0555	-0.1208	0.3599	-0.0227	0.4762	-0.2147	-0.0241	-0.0632	0.0198	0.0014	0.0612	-0.0056	0.0108	0.093	67.662	32.357	47.144
30	4.1292	-0.4956	-1.2082	5.0341	0.2398	6.5242	0.0346	0.1195	0.082	0.2178	-0.0855	0.4841	-0.0633	-0.2588	0.0509	-0.0255	0.0021	0.0648	0.0137	-0.001	0.0751	60.305	27.126	46.704
31	2.2682	0.303	-1.7055	4.3043	0.1928	2.2448	0.0941	0.0588	0.0369	0.215	-0.0699	0.2771	-0.0118	-0.1067	-0.0242	0.0079	-0.0268	0.0348	0.0386	0.008	0.0452	63.11	16.818	47.739
32	2.6423	-0.3105	0.9088	3.1241	0.0703	1.5126	0.1242	-0.1788	0.1648	0.5296	-0.1437	0.2225	-0.1674	-0.106	0.0195	0.0421	-0.0173	0.0942	0.0214	-0.0078	0.0148	66.372	28.754	52.841

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	A	0 - 9	1 - 10
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	A	10 - 37	11 - 38
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	A	38 - 49	39 - 50
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	A	50 - 80	51 - 81
5	X-RAY DIFFRACTION	5	A	A	81 - 93	82 - 94
6	X-RAY DIFFRACTION	6	A	A	94 - 123	95 - 124
7	X-RAY DIFFRACTION	7	A	A	124 - 138	125 - 139
8	X-RAY DIFFRACTION	8	A	A	139 - 144	140 - 145
9	X-RAY DIFFRACTION	9	A	A	145 - 161	146 - 162
10	X-RAY DIFFRACTION	10	A	A	162 - 170	163 - 171
11	X-RAY DIFFRACTION	11	A	A	171 - 183	172 - 184
12	X-RAY DIFFRACTION	12	A	A	184 - 192	185 - 193
13	X-RAY DIFFRACTION	13	A	A	193 - 202	194 - 203
14	X-RAY DIFFRACTION	14	A	A	203 - 209	204 - 210
15	X-RAY DIFFRACTION	15	A	A	210 - 226	211 - 227
16	X-RAY DIFFRACTION	16	A	A	227 - 233	228 - 234
17	X-RAY DIFFRACTION	17	B	B	0 - 6	1 - 7
18	X-RAY DIFFRACTION	18	B	B	7 - 22	8 - 23
19	X-RAY DIFFRACTION	19	B	B	23 - 42	24 - 43
20	X-RAY DIFFRACTION	20	B	B	43 - 65	44 - 66
21	X-RAY DIFFRACTION	21	B	B	66 - 84	67 - 85
22	X-RAY DIFFRACTION	22	B	B	85 - 101	86 - 102
23	X-RAY DIFFRACTION	23	B	B	102 - 109	103 - 110
24	X-RAY DIFFRACTION	24	B	B	110 - 132	111 - 133
25	X-RAY DIFFRACTION	25	B	B	133 - 143	134 - 144
26	X-RAY DIFFRACTION	26	B	B	144 - 160	145 - 161
27	X-RAY DIFFRACTION	27	B	B	161 - 170	162 - 171
28	X-RAY DIFFRACTION	28	B	B	171 - 184	172 - 185
29	X-RAY DIFFRACTION	29	B	B	185 - 192	186 - 193
30	X-RAY DIFFRACTION	30	B	B	193 - 202	194 - 203
31	X-RAY DIFFRACTION	31	B	B	203 - 214	204 - 215
32	X-RAY DIFFRACTION	32	B	B	215 - 233	216 - 234

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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