登録情報 | データベース: PDB / ID: 2rdq |
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タイトル | Crystal Structure of PtlH with Fe/alpha ketoglutarate bound |
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要素 | 1-deoxypentalenic acid 11-beta hydroxylase; Fe(II)/alpha-ketoglutarate dependent hydroxylase |
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キーワード | OXIDOREDUCTASE / double stranded barrel helix / dioxygenase |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
1-deoxypentalenic acid 11beta-hydroxylase / lactone biosynthetic process / 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity / L-ascorbic acid binding / antibiotic biosynthetic process / iron ion binding類似検索 - 分子機能 q2cbj1_9rhob like domain / Phytanoyl-CoA dioxygenase / Phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) / Jelly Rolls / Sandwich / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 2-OXOGLUTARIC ACID / : / 1-deoxypentalenic acid 11-beta-hydroxylase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Streptomyces avermitilis (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.31 Å |
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データ登録者 | You, Z. / Omura, S. / Ikeda, H. / Cane, D.E. / Jogl, G. |
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引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2007 タイトル: Crystal Structure of the Non-heme Iron Dioxygenase PtlH in Pentalenolactone Biosynthesis. 著者: You, Z. / Omura, S. / Ikeda, H. / Cane, D.E. / Jogl, G. |
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履歴 | 登録 | 2007年9月24日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2007年10月16日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Advisory / Version format compliance |
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改定 1.2 | 2017年10月25日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software Item: _software.classification / _software.contact_author ..._software.classification / _software.contact_author / _software.contact_author_email / _software.date / _software.language / _software.location / _software.name / _software.type / _software.version |
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改定 1.3 | 2024年2月21日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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