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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2r9l | ||||||
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タイトル | Polymerase Domain from Mycobacterium tuberculosis Ligase D in complex with DNA | ||||||
要素 |
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キーワード | TRANSFERASE/DNA / TRANSFERASE / PROTEIN-DNA COMPLEX / ATP-binding / Ligase / Nucleotide-binding / TRANSFERASE-DNA COMPLEX | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 : / ribonucleotide binding / DNA ligase activity / DNA ligase (ATP) / DNA ligase (ATP) activity / DNA ligation / DNA primase activity / single-stranded DNA 3'-5' DNA exonuclease activity / DNA replication, synthesis of primer / double-strand break repair via nonhomologous end joining ...: / ribonucleotide binding / DNA ligase activity / DNA ligase (ATP) / DNA ligase (ATP) activity / DNA ligation / DNA primase activity / single-stranded DNA 3'-5' DNA exonuclease activity / DNA replication, synthesis of primer / double-strand break repair via nonhomologous end joining / DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity / double-strand break repair / manganese ion binding / DNA recombination / DNA-directed DNA polymerase activity / nucleotide binding / magnesium ion binding / DNA binding / ATP binding / metal ion binding / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Mycobacterium tuberculosis H37Rv (結核菌) synthetic construct (人工物) | ||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.4 Å | ||||||
データ登録者 | Brissett, N.C. / Fox, G.C. / Pitcher, R.S. / Doherty, A.J. | ||||||
引用 | ジャーナル: Science / 年: 2007 タイトル: Structure of a NHEJ polymerase-mediated DNA synaptic complex 著者: Brissett, N.C. / Pitcher, R.S. / Juarez, R. / Picher, A.J. / Green, A.J. / Dafforn, T.R. / Fox, G.C. / Blanco, L. / Doherty, A.J. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2r9l.cif.gz | 145.5 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2r9l.ent.gz | 109.6 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2r9l.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 2r9l_validation.pdf.gz | 502.6 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 2r9l_full_validation.pdf.gz | 547.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | 2r9l_validation.xml.gz | 25.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 2r9l_validation.cif.gz | 34.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/r9/2r9l ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/r9/2r9l | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | 2iruS S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCSドメイン:
NCSドメイン領域:
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