PDB-2qi4: Crystal structure of protease inhibitor, MIT-2-AD93 in complex wi...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 2qi4

タイトル

Crystal structure of protease inhibitor, MIT-2-AD93 in complex with wild type HIV-1 protease

要素

Protease

キーワード

HYDROLASE / Drug design / HIV-1 protease / protease inhibitors

機能・相同性

機能・相同性情報

HIV-1 retropepsin / symbiont-mediated activation of host apoptosis / retroviral ribonuclease H / exoribonuclease H / exoribonuclease H activity / host multivesicular body / DNA integration / viral genome integration into host DNA / RNA-directed DNA polymerase / establishment of integrated proviral latency ...
類似検索 - 分子機能

Reverse transcriptase connection / Reverse transcriptase connection domain / Reverse transcriptase thumb / Reverse transcriptase thumb domain / Integrase Zinc binding domain / Zinc finger integrase-type profile. / Integrase-like, N-terminal / Integrase DNA binding domain / Integrase, C-terminal domain superfamily, retroviral / Integrase, N-terminal zinc-binding domain ...
類似検索 - ドメイン・相同性

生物種

Human immunodeficiency virus 1 (ヒト免疫不全ウイルス)

手法

X線回折 /

分子置換 / 解像度: 1.8 Å

データ登録者

Nalam, M.N.L. / Schiffer, C.A.

引用

ジャーナル: J.Am.Chem.Soc. / 年: 2008
タイトル: HIV-1 protease inhibitors from inverse design in the substrate envelope exhibit subnanomolar binding to drug-resistant variants.
著者: Altman, M.D. / Ali, A. / Reddy, G.S. / Nalam, M.N. / Anjum, S.G. / Cao, H. / Chellappan, S. / Kairys, V. / Fernandes, M.X. / Gilson, M.K. / Schiffer, C.A. / Rana, T.M. / Tidor, B.

履歴

登録	2007年7月3日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2008年4月22日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年7月13日	Group: Advisory / Derived calculations ...Advisory / Derived calculations / Refinement description / Version format compliance
改定 1.2	2017年10月18日	Group: Refinement description / カテゴリ: software
改定 1.3	2021年10月20日	Group: Database references / Derived calculations / カテゴリ: database_2 / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
改定 1.4	2023年8月30日	Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	2qi4.cif.gz	58.1 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb2qi4.ent.gz	43.3 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	2qi4.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	2qi4_validation.pdf.gz	790.9 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	2qi4_full_validation.pdf.gz	791.6 KB	表示
XML形式データ	2qi4_validation.xml.gz	11.6 KB	表示
CIF形式データ	2qi4_validation.cif.gz	15.9 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/qi/2qi4 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/qi/2qi4	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	2qhyC 2qhzC 2qi0C 2qi1C 2qi3C 2qi5C 2qi6C 2qi7C 1f7aS C: 同じ文献を引用 (文献) S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	4q1x-d 2qi0-d 3mxd-d 3ekv-d 3o9h-d 1t7j-d 3o9a-d 4dqh-d 2qi6-d 3o9i-d 4gb2-d 3sa9-d 6oy1-d 1mer-d 1k6c-d 3bgc-d 2q55-d 3ekx-d 1t7i-d 3sa7-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#6 - 2000年6月 HIV-1タンパク質分解酵素 (HIV-1 Protease) 類似性 (2) #163 - 2013年7月 HIVカプシド (HIV Capsid) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Protease

B: Protease

ヘテロ分子

22.4 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	50.855, 58.178, 61.804
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

#1: タンパク質	Protease 分子量: 10815.790 Da / 分子数: 2 / 変異: Q7K / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Human immunodeficiency virus 1 (ヒト免疫不全ウイルス) 属: Lentivirus / 株: SF2 / 遺伝子: pol / プラスミド: PXC35 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): TAP56 / 参照: UniProt: O38732, UniProt: P03369*PLUS
#2: 化合物	ChemComp-PO4 / PHOSPHATE ION / ホスファ-ト分子量: 94.971 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: PO₄
#3: 化合物	ChemComp-MZ6 / N-[(1S,2R)-3-{(1,3-BENZOTHIAZOL-6-YLSULFONYL)[(2S)-2-METHYLBUTYL]AMINO}-1-BENZYL-2-HYDROXYPROPYL]-3-HYDROXYBENZAMIDE / AD-93 分子量: 567.719 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₉H₃₃N₃O₅S₂
#4: 化合物	ChemComp-ACT / ACETATE ION / 酢酸イオン分子量: 59.044 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₃O₂
#5: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 147 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.11 Å³/Da / 溶媒含有率: 41.76 %
結晶化	温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.2 詳細: 126 mM Sodium Phosphate, 63 mM sodium citrate, 24-29% ammonium sulphate, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 200 K
放射光源	由来: 回転陽極 / タイプ: RIGAKU / 波長: 1.5418 Å
検出器	タイプ: RIGAKU RAXIS IV / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2006年9月14日 / 詳細: osmic mirrors
放射	モノクロメーター: osmic mirrors / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1.5418 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.8→50 Å / Num. obs: 16632 / % possible obs: 94.5 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 6.4 % / R_merge(I) obs: 0.042 / R_sym value: 4.2 / Net I/σ(I): 16.6

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.2.0005	精密化
HKL-2000		データ削減
SCALEPACK		データスケーリング
AMoRE		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: pdb entry 1F7A

1f7a

解像度: 1.8→42.37 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.957 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.937 / SU B: 4.725 / SU ML: 0.079 / TLS residual ADP flag: LIKELY RESIDUAL / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / σ(I): 0 / ESU R: 0.145 / ESU R Free: 0.127 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.20317	849	5.1 %	RANDOM
R_work	0.17267	-	-	-
all	0.17418	15748	-	-
obs	0.17418	15748	94.61 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 16.911 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-0.55 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	0.06 Å²	0 Å²
3-	-	-	0.5 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.8→42.37 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	1498	0	48	147	1693

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.008	0.022	1644
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.006	0.02	1572
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.193	2.014	2247
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	0.696	3	3654
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	6.189	5	210
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	41.796	24.915	59
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	11.8	15	279
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	17.885	15	9
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.067	0.2	261
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.004	0.02	1817
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.001	0.02	299
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined	0.176	0.2	224
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other	0.19	0.2	1569
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined	0.165	0.2	765
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other	0.08	0.2	940
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined	0.14	0.2	110
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined	0.122	0.2	11
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other	0.163	0.2	63
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined	0.099	0.2	11
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	0.549	1.5	1090
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	0.089	1.5	426
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	0.659	2	1667
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	0.994	3	680
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	1.458	4.5	580
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

LS精密化シェル

解像度: 1.8→1.847 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.265	41	-
R_work	0.212	777	-
obs	-	-	64.82 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	4.6299	-1.2389	0.2876	5.1637	1.0952	2.7978	-0.2644	-0.3752	0.047	0.369	0.234	0.0053	0.0599	0.0751	0.0304	-0.0035	0.0614	0.0157	-0.0317	0.0049	-0.149	21.0739	25.8416	29.3711
2	5.9446	-3.3245	0.8902	3.4839	0.6418	3.1788	-0.1036	-0.003	-0.4315	0.1704	0.1936	0.3107	0.0129	-0.0141	-0.09	-0.0353	0.0058	0.0479	-0.1012	0.0497	-0.0474	19.7058	17.8069	23.0831
3	1.9296	0.3898	0.7393	1.9231	-0.3736	1.459	-0.0565	0.0056	-0.0714	-0.0162	-0.0529	-0.0804	-0.0558	-0.0327	0.1094	-0.0401	0.0081	-0.0053	-0.0453	0.0032	-0.0653	27.6686	28.5338	19.1004
4	5.2777	-0.5131	1.2064	6.0146	0.0201	2.1881	0.0386	0.0649	-0.1487	-0.1506	0.044	0.2476	-0.0523	-0.0578	-0.0826	-0.0486	0.0185	0.0101	-0.0698	0.0161	-0.0777	12.7041	26.832	18.5274
5	10.5554	1.94	-0.9919	5.6148	-0.1508	4.139	0.0841	-0.3552	-0.4119	0.1702	-0.2333	-0.8057	-0.1092	0.4094	0.1492	-0.0585	-0.0119	-0.075	-0.0796	0.0487	0.0563	38.9858	30.645	24.1961
6	34.8022	-10.7657	-1.848	4.9123	2.8714	10.6406	-0.0219	0.1637	-0.9006	0.1638	-0.1462	0.9599	-0.1138	-0.8653	0.1681	-0.0912	-0.0191	0.0354	-0.0168	0.0365	0.1795	1.5727	21.6011	18.1535
7	5.1836	-0.3279	0.276	1.9728	3.4073	6.0231	0.1127	0.0933	0.002	-0.0813	0.0635	-0.3529	-0.0678	0.3906	-0.1763	-0.0434	-0.0022	0.0157	-0.0331	0.0545	-0.0063	39.556	31.4779	10.6814
8	7.8602	-0.2703	0.0425	5.9481	3.5127	4.9541	0.1955	0.2065	-0.079	-0.1477	-0.0364	0.475	0.0025	-0.5919	-0.1591	-0.0811	0.0125	0.009	0.0067	0.1019	-0.0483	0.3923	34.2433	13.7204
9	15.4546	-2.2772	-3.0639	0.9044	0.4511	3.1081	-0.0265	0.2655	-0.3397	-0.0654	-0.1085	0.0466	0.0018	-0.0096	0.135	-0.0297	0.0097	0.002	-0.0731	0.0113	-0.0766	27.419	30.8347	4.8186
10	14.5761	-4.3839	-3.1998	2.8091	-1.1176	3.6047	0.2404	0.108	0.0917	-0.0856	-0.0158	0.0622	-0.1385	-0.1008	-0.2246	-0.0327	0.0011	-0.0062	-0.0738	0.0067	-0.0585	12.7694	39.3753	11.5965
11	1.0915	0.0566	-0.3473	3.6565	-1.1761	4.6273	0.0024	0.0808	0.1477	0.0509	-0.0497	0.2071	-0.2848	-0.0606	0.0474	-0.0474	0.0043	-0.0075	-0.0489	0.0101	-0.0299	29.2386	33.1488	14.844
12	6.1699	-5.1955	7.1124	5.3032	-6.9107	9.1138	0.3618	0.3211	-0.1151	-0.3401	-0.1603	0.2153	0.4946	0.4715	-0.2015	-0.019	0.0098	-0.0228	-0.067	0.0039	-0.0409	10.4292	29.3987	12.7204
13	4.2533	-0.4558	0.8348	4.4804	-0.7615	0.4836	0.0096	0.0606	-0.027	-0.038	-0.0907	-0.0367	0.1442	0.1093	0.0811	-0.0358	-0.0054	0.0055	-0.0413	-0.0113	-0.0265	28.9229	19.8187	19.6535
14	5.515	-2.7926	-2.7767	5.0247	-0.8379	2.7925	-0.4036	-0.6834	0.0513	0.0643	0.3741	0.4032	0.0066	0.1187	0.0295	-0.0145	0.0733	0.0331	0.046	0.0337	-0.0516	11.6794	28.593	27.0575
15	2.2193	1.5099	-2.2234	10.7343	-12.4835	19.1202	-0.1129	0.1049	-0.7005	-0.4363	-0.5223	-0.5799	0.0765	0.5554	0.6352	-0.127	0.0633	0.0672	-0.0247	0.0514	0.0062	39.0954	23.571	10.697
16	10.7082	6.452	-7.0494	12.3311	-9.233	18.69	0.3462	-0.138	0.2987	0.4665	0.3543	0.6168	-0.6276	-0.4101	-0.7004	-0.1503	0.0767	0.0367	-0.0902	0.0456	0.0406	1.4185	36.3893	21.1566
17	22.0677	-1.5012	-4.2143	14.9844	0.8639	12.6062	-0.133	0.2024	1.3052	0.4922	0.1646	-0.0121	0.3933	-0.1503	-0.0316	-0.1229	-0.0172	-0.0946	-0.1737	0.0308	0.0246	37.1459	24.3941	23.9894
18	28.8742	-12.9374	1.154	10.2407	-0.0153	6.3758	-0.1139	1.0034	-0.2411	-0.2586	-0.389	0.2805	0.8021	0.5224	0.5028	-0.0193	0.0789	0.0875	0.0239	0.081	0.0192	3.1992	23.3537	24.2351
19	1.1077	-1.2874	1.6894	2.2778	-0.9472	7.2201	-0.0056	0.2022	-0.0195	0.0196	-0.1202	-0.2154	0.0425	0.3534	0.1258	-0.0696	0.001	0.0121	-0.0474	0.0271	-0.0128	36.4076	21.8913	18.339
20	2.3099	3.7365	-3.8778	6.1844	-5.9404	7.2972	0.053	-0.1391	-0.0771	-0.0974	-0.0631	0.3303	0.0793	0.2282	0.0101	-0.077	0.0578	0.0292	-0.0108	0.056	0.0199	4.2288	29.6178	24.9317
21	14.5591	-10.4296	-2.4915	17.8708	2.2948	1.0771	0.1563	0.1625	-0.1047	-0.2908	0.046	-0.4027	-0.049	-0.0051	-0.2023	-0.0469	0.0029	-0.0021	-0.0871	-0.0097	-0.0914	19.6139	30.8049	14.4872

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	1 - 5
2	X-RAY DIFFRACTION	1	A	94 - 99
3	X-RAY DIFFRACTION	1	A	6 - 10
4	X-RAY DIFFRACTION	2	B	1 - 5
5	X-RAY DIFFRACTION	2	B	94 - 99
6	X-RAY DIFFRACTION	2	B	6 - 10
7	X-RAY DIFFRACTION	3	A	20 - 32
8	X-RAY DIFFRACTION	4	B	20 - 32
9	X-RAY DIFFRACTION	5	A	11 - 19
10	X-RAY DIFFRACTION	6	B	11 - 19
11	X-RAY DIFFRACTION	7	A	33 - 43
12	X-RAY DIFFRACTION	8	B	33 - 43
13	X-RAY DIFFRACTION	9	A	44 - 57
14	X-RAY DIFFRACTION	10	B	44 - 57
15	X-RAY DIFFRACTION	11	A	77 - 85
16	X-RAY DIFFRACTION	12	B	77 - 85
17	X-RAY DIFFRACTION	13	A	86 - 93
18	X-RAY DIFFRACTION	14	B	86 - 93
19	X-RAY DIFFRACTION	15	A	58 - 62
20	X-RAY DIFFRACTION	16	B	58 - 62
21	X-RAY DIFFRACTION	17	A	63 - 68
22	X-RAY DIFFRACTION	18	B	63 - 68
23	X-RAY DIFFRACTION	19	A	69 - 76
24	X-RAY DIFFRACTION	20	B	69 - 76
25	X-RAY DIFFRACTION	21	A	200

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)