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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2pgd | |||||||||
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タイトル | THE STRUCTURE OF 6-PHOSPHOGLUCONATE DEHYDROGENASE REFINED AT 2 ANGSTROMS RESOLUTION | |||||||||
![]() | 6-PHOSPHOGLUCONATE DEHYDROGENASE | |||||||||
![]() | OXIDOREDUCTASE (CHOH(D)-NADP+(A)) | |||||||||
機能・相同性 | ![]() D-gluconate metabolic process / phosphogluconate dehydrogenase (NADP+-dependent, decarboxylating) / phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating) activity / pentose-phosphate shunt / NADP binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | ![]() | |||||||||
![]() | Adams, M.J. / Phillips, C. / Gover, S. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: The structure of 6-phosphogluconate dehydrogenase refined at 2.5 A resolution. 著者: Adams, M.J. / Gover, S. / Leaback, R. / Phillips, C. / Somers, D.O. #1: ![]() タイトル: Crystallographic Study of Coenzyme, Coenzyme Analogue and Substrate Binding in 6-Phosphogluconate Dehydrogenase: Implications for Nadp Specificity and the Enzyme Mechanism 著者: Adams, M.J. / Ellis, G.H. / Gover, S. / Naylor, C.E. / Phillips, C. #2: ![]() タイトル: The Structure of 6-Phosphogluconate Dehydrogenase Refined at 2.5 Angstroms Resolution 著者: Adams, M.J. / Gover, S. / Leaback, R. / Phillips, C. / Somers, D.O'N. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 109.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 84.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 427.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 434.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 22.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 32.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO 67 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 52905.652 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() 参照: UniProt: P00349, phosphogluconate dehydrogenase (NADP+-dependent, decarboxylating) | ||
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#2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.61 Å3/Da / 溶媒含有率: 52.87 % | |||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 6.5 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | |||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | Rfactor Rwork: 0.198 / Rfactor obs: 0.198 / 最高解像度: 2 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2 Å
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拘束条件 |
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