分子量: 11233.758 Da / 分子数: 1 断片: RNA Hairpin containing the 5' pseudouridylation pocket 由来タイプ: 合成 詳細: Synthesized by in-vitro transcription using T7 RNA polymerase from linearzed plsmid DNA. This sequence occurs naturally in humans.
#2: RNA鎖
rRNAsubstrateofU65boxH/ACAsnoRNA
分子量: 4495.691 Da / 分子数: 1 断片: rRNA substrate of the 5' pseudouridylation pocket of U65 Box H/ACA snoRNA 由来タイプ: 合成 詳細: Chemically synthesized. This sequence occurs naturally in humans.
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実験情報
-
実験
実験
手法: 溶液NMR
NMR実験
Conditions-ID
Experiment-ID
Solution-ID
タイプ
1
1
1
2D NOESY
2
2
1
2D NOESY
2
3
1
DQF-COSY
1
4
2
15N-HSQC
2
5
2
13C-HSQC
1
6
2
15N-NOESYHSQC
2
7
2
13C-NOESYHSQC
2
8
2
(H)CCH/COSY/RELAY/TOCSY
2
9
1
31P-HETCOR
NMR実験の詳細
Text: See paper for more details
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試料調製
詳細
Solution-ID
内容
溶媒系
1
Unlabeled
90% H2O/10% D2O
2
Uniform labeling with 15N: U-15N Uniform labeling with 13C: U-13C
90% H2O/10% D2O
試料状態
Conditions-ID
イオン強度
pH
圧 (kPa)
温度 (K)
1
5mMcacodylate, 1mMMgCl2, 50mMNaCl, 0.1mMEDTA.
6.5
ambient
283K
2
5mMcacodylate, 1mMMgCl2, 50mMNaCl, 0.1mMEDTA
6.5
ambient
303K
-
NMR測定
放射
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M
放射波長
相対比: 1
NMRスペクトロメーター
タイプ
製造業者
モデル
磁場強度 (MHz)
Spectrometer-ID
Varian INOVA
Varian
INOVA
500
1
Varian UNITYPLUS
Varian
UNITYPLUS
600
2
Varian INOVA
Varian
INOVA
800
3
-
解析
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
NMRPipe
解析
Sparky
データ解析
CNS
1.1
BRUNGER
精密化
精密化
手法: torsion angle dynamics molecular dynamics / ソフトェア番号: 1 / 詳細: Described in the primary citation
代表構造
選択基準: closest to the average
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 17