0.5-1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PfSR1-RRM1, 25 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 3 mM TCEP, 50 mM L-arginine, 25 mM L-glutamate, 90% H2O/10% D2O
90% H2O/10% D2O
2
0.5-1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PfSR1-RRM1, 25 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 3 mM TCEP, 50 mM L-arginine, 25 mM L-glutamate, 100% D2O
100% D2O
試料
濃度 (mg/ml)
単位
構成要素
Isotopic labeling
Conc. range (mg/ml)
Solution-ID
mM
PfSR1-RRM1-1
[U-100% 13C; U-100% 15N]
0.5-1
1
25mM
sodium phosphate-2
1
100mM
sodium chloride-3
1
3mM
TCEP-4
1
50mM
L-arginine-5
1
25mM
L-glutamate-6
1
mM
PfSR1-RRM1-7
[U-100% 13C; U-100% 15N]
0.5-1
2
25mM
sodium phosphate-8
2
100mM
sodium chloride-9
2
3mM
TCEP-10
2
50mM
L-arginine-11
2
25mM
L-glutamate-12
2
試料状態
イオン強度: 125 / pH: 5.9 / 圧: ambient / 温度: 298 K
-
NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ
製造業者
モデル
磁場強度 (MHz)
Spectrometer-ID
Bruker Avance
Bruker
AVANCE
500
1
Bruker Avance
Bruker
AVANCE
700
2
-
解析
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
TopSpin
2.1
BrukerBiospin
collection
TopSpin
2.1
BrukerBiospin
解析
CARA
1.8.4
KellerandWuthrich
peakpicking
CARA
1.8.4
KellerandWuthrich
chemicalshiftassignment
CARA
1.8.4
KellerandWuthrich
データ解析
CYANA
Guntert, MumenthalerandWuthrich
peakpicking
CYANA
Guntert, MumenthalerandWuthrich
構造決定
CNS
1.3
Brunger, Adams, Clore, Gros, NilgesandRead
精密化
CYANA
精密化
精密化
手法: DGSA-distance geometry simulated annealing, simulated annealing ソフトェア番号: 1 / 詳細: Refinement in explicit water
NMR constraints
NOE constraints total: 803 / NOE intraresidue total count: 203 / NOE long range total count: 167 / NOE medium range total count: 135 / NOE sequential total count: 298 / Hydrogen bond constraints total count: 96
代表構造
選択基準: closest to the average
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 20 / 代表コンフォーマー: 5