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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2moc | ||||||
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タイトル | Membrane induced structure of novel human tachykinin Hemokinin-1 (hHK1) | ||||||
要素 | Tachykinin-4Tachykinin peptides | ||||||
キーワード | NEUROPEPTIDE / Tachykinin | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 substance K receptor binding / negative regulation of sensory perception of pain / positive regulation of sensory perception of pain / substance P receptor binding / positive regulation of flagellated sperm motility / tachykinin receptor signaling pathway / regulation of sensory perception of pain / negative regulation of systemic arterial blood pressure / detection of temperature stimulus involved in sensory perception of pain / 血圧 ...substance K receptor binding / negative regulation of sensory perception of pain / positive regulation of sensory perception of pain / substance P receptor binding / positive regulation of flagellated sperm motility / tachykinin receptor signaling pathway / regulation of sensory perception of pain / negative regulation of systemic arterial blood pressure / detection of temperature stimulus involved in sensory perception of pain / 血圧 / positive regulation of cytosolic calcium ion concentration / receptor ligand activity / 炎症 / extracellular space 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics | ||||||
Model details | closest to the average, model1 | ||||||
データ登録者 | Ganjiwale, A. / Cowsik, S. | ||||||
引用 | ジャーナル: To be Published タイトル: Membrane induced structure of novel human tachykinin Hemokinin-1 著者: Ganjiwale, A. / Cowsik, S. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2moc.cif.gz | 69.6 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2moc.ent.gz | 50.1 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2moc.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/mo/2moc ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/mo/2moc | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 1187.388 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: Custom synthesized peptide with >99% purity / 由来: (合成) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q86UU9 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR 詳細: NMR solution structure of Hemokinin-1 in SDS Micelles | ||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 | 内容: 4.5 mM Hemokinin-1, 90 % H2O-2, 10 % [U-2H] D2O-3, 300 mM [U-99% 2H] SDS-4, 90% H2O/10% D2O 溶媒系: 90% H2O/10% D2O | ||||||||||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | pH: 3.5 / 圧: ambient / 温度: 305 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker Avance / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 700 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | ||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: target function / 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 20 / 代表コンフォーマー: 1 |