分子量: 3686.565 Da / 分子数: 1 / 断片: fragment 26-61 of MK / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Aedes aegypti (ネッタイシマカ) 遺伝子: CECD, AAEL000598 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q17NR1
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実験情報
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実験
実験
手法: 溶液NMR
NMR実験
Conditions-ID
Experiment-ID
Solution-ID
タイプ
1
1
1
2D 1H-1H NOESY
1
2
1
2D 1H-1H TOCSY
1
3
1
2D 1H-15N HSQC
2
4
1
2D 1H-1H NOESY
1
5
2
2D 1H-13C HSQC
1
6
2
2D 1H-1H TOCSY
1
7
2
2D 1H-1H NOESY
-
試料調製
詳細
Solution-ID
内容
溶媒系
1
0.784mMcecropinGK, 50%H2O/50%TFE
50%H2O/50%TFE
2
0.784mMcecropinGK, 50%D2O/50%TFE
50%D2O/50%TFE
試料
濃度 (mg/ml)
構成要素
Solution-ID
0.784mM
cecropin GK-1
1
0.784mM
cecropin GK-2
2
試料状態
Conditions-ID
イオン強度
pH
圧 (kPa)
温度 (K)
1
0.15
7.4
ambient
283K
2
0.15
7.4
ambient
302K
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NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ: Bruker Avance / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 700 MHz
-
解析
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
TopSpin
3.2
BrukerBiospin
collection
CYANA
2.1
Guntert, MumenthalerandWuthrich
構造決定
CNS
1.2
Brunger, Adams, Clore, Gros, NilgesandRead
精密化
TALOS
Cornilescu, DelaglioandBax
データ解析
精密化
手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1
NMR constraints
NOE constraints total: 372 / NOE intraresidue total count: 75 / NOE long range total count: 0 / NOE medium range total count: 127 / NOE sequential total count: 142 / Protein chi angle constraints total count: 0 / Protein other angle constraints total count: 0 / Protein phi angle constraints total count: 26 / Protein psi angle constraints total count: 26
代表構造
選択基準: closest to the average
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: structures with the least restraint violations 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 / Maximum upper distance constraint violation: 0.293 Å