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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2mie | ||||||
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タイトル | Solution structure of the CLAVATA encoded peptide of Arabidopsis thaliana - AtCLE44 | ||||||
![]() | CLAVATA3/ESR (CLE)-related protein 44 | ||||||
![]() | UNKNOWN FUNCTION / CLE / CLAVATA | ||||||
機能・相同性 | ![]() procambium histogenesis / phloem development / xylem development / cell-cell signaling involved in cell fate commitment / axillary shoot meristem initiation / maintenance of root meristem identity / phloem or xylem histogenesis / secondary shoot formation / apoplast / receptor serine/threonine kinase binding ...procambium histogenesis / phloem development / xylem development / cell-cell signaling involved in cell fate commitment / axillary shoot meristem initiation / maintenance of root meristem identity / phloem or xylem histogenesis / secondary shoot formation / apoplast / receptor serine/threonine kinase binding / regulation of cell differentiation / cell division 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
![]() | Bobay, B.G. / DiGennaro, P.M. / Bird, D.M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Inferring function of CLE peptides from high resolution tertiary structures 著者: DiGennaro, P.M. / Bobay, B.G. / Bird, D.M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 34.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 23.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 417.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 459.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 8.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 9.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 1248.322 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 101-112 / 由来タイプ: 合成 由来: (合成) ![]() ![]() 参照: UniProt: Q941C5, UniProt: Q84W98*PLUS |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | 内容: 4 mg/mL peptide, 2.7 mM potassium chloride, 1.8 mM potassium phosphate, 137 mM sodium chloride, 10 mM sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O 溶媒系: 90% H2O/10% D2O | ||||||||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 140 / pH: 7 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker Avance / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 700 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | |||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | |||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 20 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |