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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2m7d | ||||||
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タイトル | Trp-cage 16b P12W: a Hyperstable Miniprotein | ||||||
![]() | Trp-Cage mini-protein | ||||||
![]() | DE NOVO PROTEIN / miniprotein / Trp-cage / circular permutant / microprotein | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
Model details | closest to the average, model1 | ||||||
![]() | Williams, D.V. / Andersen, N.H. / Kier, B.L. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Circular Permutation of the Trp-cage: Fold Rescue upon Addition of a Hydrophobic Staple. 著者: Byrne, A. / Kier, B.L. / Williams, D.V. / Scian, M. / Andersen, N.H. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 142.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 113.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 373.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 406.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 8.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 14.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 2131.283 Da / 分子数: 1 / 変異: P12W, G10a, G15a / 由来タイプ: 合成 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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NMR実験 | タイプ: 2D 1H-1H NOESY |
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試料調製
詳細 | 内容: 50 mM sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O / 溶媒系: 90% H2O/10% D2O |
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試料 | 濃度: 50 mM / 構成要素: sodium phosphate-1 |
試料状態 | イオン強度: 0.11 / pH: 7 / 圧: ambient / 温度: 280 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DMX / 製造業者: Bruker / モデル: DMX / 磁場強度: 800 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: Incorporated LJ potential relax as extra final step for improved refinement. | ||||||||||||
NMR constraints | NOE constraints total: 323 | ||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 30 |