1.3 mM [U-100% 15N; U-5% 13C] ZR18, 20 mM MES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 10 mM DTT, 0.02 % NaN3, 95% H2O/5% D2O
95% H2O/5% D2O
2
1.15 mM [U-100% 15N; U-100% 13C] ZR18, 20 mM MES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 10 mM DTT, 0.02 % NaN3, 95% H2O/5% D2O
95% H2O/5% D2O
試料
濃度 (mg/ml)
構成要素
Isotopic labeling
Solution-ID
1.3mM
ZR18-1
[U-100% 15N; U-5% 13C]
1
20mM
MES-2
1
100mM
NaCl-3
1
5mM
CaCl2-4
1
10mM
DTT-5
1
0.02 %
NaN3-6
1
1.15mM
ZR18-7
[U-100% 15N; U-100% 13C]
2
20mM
MES-8
2
100mM
NaCl-9
2
5mM
CaCl2-10
2
10mM
DTT-11
2
0.02 %
NaN3-12
2
試料状態
イオン強度: 0.1 / pH: 6.5 / 温度: 298 K
-
NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ
製造業者
モデル
磁場強度 (MHz)
Spectrometer-ID
Varian UNITY Inova
Varian
UNITYInova
500
1
Varian UNITY Inova
Varian
UNITYInova
600
2
-
解析
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
HYPER
3.2
Tejero, Monleon, Celda, PowersandMontelione
データ解析
TALOS
2.1
Cornilescu, DelaglioandBax
データ解析
VNMR6.1C
Varian
データ収集
NMRPipe
Delaglio, Grzesiek, Vuister, Zhu, PfeiferandBax
rawspectraldataprocessing
Sparky
Goddard
spectralvisualization
AutoAssign
Zimmerman, Moseley, KulikowskiandMontelione
automatedbackboneassignments
AutoStructure
1.1.2
Huang, Tejero, PowersandMontelione
automatedstructuraldetermination
SPINS
Baran, Montelione
integratedspectralanalysussoftware
SPINS
Baran, Montelione
integratedspectralanalysussoftware
CNS
精密化
精密化
手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: Refinement of PDB 1PQX coordinates (10 models) using CNS in explicit water. The original 1PQX models were generated by AutoStructure.
代表構造
選択基準: lowest energy
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 56 / 登録したコンフォーマーの数: 10