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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2m3b | ||||||
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タイトル | Serine 16 phosphorylated phospholamban pentamer, Hybrid solution and solid-state NMR structural ensemble | ||||||
要素 | Cardiac phospholamban | ||||||
キーワード | MEMBRANE PROTEIN / phospholamban / pln / plb | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 negative regulation of calcium ion binding / negative regulation of calcium ion import into sarcoplasmic reticulum / negative regulation of ATPase-coupled calcium transmembrane transporter activity / adenylate cyclase-activating adrenergic receptor signaling pathway involved in heart process / regulation of relaxation of muscle / regulation of the force of heart contraction by cardiac conduction / calcium ion-transporting ATPase complex / acrosome assembly / negative regulation of calcium ion transmembrane transporter activity / negative regulation of calcium ion import ...negative regulation of calcium ion binding / negative regulation of calcium ion import into sarcoplasmic reticulum / negative regulation of ATPase-coupled calcium transmembrane transporter activity / adenylate cyclase-activating adrenergic receptor signaling pathway involved in heart process / regulation of relaxation of muscle / regulation of the force of heart contraction by cardiac conduction / calcium ion-transporting ATPase complex / acrosome assembly / negative regulation of calcium ion transmembrane transporter activity / negative regulation of calcium ion import / negative regulation of catalytic activity / ATPase inhibitor activity / cardiac muscle tissue development / regulation of cardiac muscle cell contraction / enzyme inhibitor activity / negative regulation of heart rate / muscle cell cellular homeostasis / regulation of calcium ion transport / regulation of cardiac muscle contraction by regulation of the release of sequestered calcium ion / Notch signaling pathway / sarcoplasmic reticulum membrane / mitochondrial membrane / intracellular calcium ion homeostasis / ATPase binding / endoplasmic reticulum membrane / perinuclear region of cytoplasm / endoplasmic reticulum / protein homodimerization activity / identical protein binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Oryctolagus cuniculus (ウサギ) | ||||||
手法 | 溶液NMR / 個体NMR / simulated annealing | ||||||
Model details | lowest energy, model1 | ||||||
データ登録者 | Vostrikov, V.V. / Verardi, R. / Veglia, G. | ||||||
引用 | ジャーナル: Structure / 年: 2013 タイトル: Structural Dynamics and Topology of Phosphorylated Phospholamban Homopentamer Reveal Its Role in the Regulation of Calcium Transport. 著者: Vostrikov, V.V. / Mote, K.R. / Verardi, R. / Veglia, G. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2m3b.cif.gz | 1.7 MB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2m3b.ent.gz | 1.4 MB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2m3b.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/m3/2m3b ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/m3/2m3b | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ | |
その他のデータベース |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 6179.478 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Oryctolagus cuniculus (ウサギ) / 遺伝子: PLN / プラスミド: pMAL-c2X / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: P61015 |
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-実験情報
-実験
実験 |
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 |
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-データ収集
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: target function / 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |