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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 2m2j
タイトル
Solution NMR structure of the N-terminal domain of STM1478 from Salmonella typhimurium LT2: Target STR147A of the Northeast Structural Genomics consortium (NESG), and APC101565 of the Midwest Center for Structural Genomics (MCSG).
要素
Putative periplasmic protein
キーワード
STRUCTURAL GENOMICS / UNKNOWN FUNCTION / NESG / Northeast structural genomics consortium / MCSG / Midwest center for structural genomics / PSI-Biology
内容: 0.5 mM [U-13C; U-15N] protein, 10 mM BIS-TRIS, 200 mM sodium chloride, 10 uM ZnSO4, 10 mM DTT, 1 mM benzamidine, 90% H2O/10% D2O 溶媒系: 90% H2O/10% D2O
試料
濃度 (mg/ml)
構成要素
Isotopic labeling
Solution-ID
0.5mM
entity-1
[U-13C; U-15N]
1
10mM
BIS-TRIS-2
1
200mM
sodium chloride-3
1
10uM
ZnSO4-4
1
10mM
DTT-5
1
1mM
benzamidine-6
1
試料状態
イオン強度: 200 / pH: 6.5 / 圧: ambient / 温度: 298 K
-
NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ
製造業者
モデル
磁場強度 (MHz)
Spectrometer-ID
Bruker Avance
Bruker
AVANCE
800
1
Bruker Avance
Bruker
AVANCE
600
2
-
解析
NMR software
名称
開発者
分類
NMRPipe
Delaglio, Grzesiek, Vuister, Zhu, PfeiferandBax
解析
Sparky
Goddard
peakpicking
FMC
Lemak,Steren,Llinas, Arrowsmith
chemicalshiftassignment
TALOS
Cornilescu, DelaglioandBax
データ解析
PSVS
BhattacharyaandMontelione
構造検証
CYANA
Guntert, MumenthalerandWuthrich
構造決定
CNS
Brunger, Adams, Clore, Gros, NilgesandRead
精密化
精密化
手法: restrained molecular dynamics / ソフトェア番号: 1
代表構造
選択基準: lowest energy
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20